RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AI854703Q8BIN3 203 aa3.56□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 BB014433Q8C5R5 389 aa3.56□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q99M08 65 aa3.56□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 9430069I07RikQ9CX21 111 aa3.56□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mfap4Q9D1H9 257 aa3.56□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Crip2Q9DCT8 208 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 4930546C10RikE9Q4Y3 121 aa3.55□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm10135F6TEE5 83 aa3.55□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Acyp1P56376 99 aa3.55□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm9747Q810H1 104 aa3.55□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nop10Q9CQS2 64 aa3.55□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wdr38Q9D994 303 aa3.55□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 1700074P13RikQ9D9G7 251 aa3.55□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q9DAQ5 155 aa3.55□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trdv5A0A075B661 115 aa3.54□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm11595B1AQA7 289 aa3.54□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm10490F6VBM2 120 aa3.54□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rbmy1bQ60990 380 aa3.54□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Phpt1Q9DAK9 124 aa3.54□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Arhgap32Q811P8 2089 aa3.53□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm29423A0A087WRM1 55 aa3.53□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Defa1P11477 93 aa3.53□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Defb47Q30KN1 79 aa3.53□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm10549Q3URY4 149 aa3.53□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Chchd7Q8K2Q5 85 aa3.53□□□□□ -1.84
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trav3-4A0A075B654 114 aa3.52□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Igkv8-34A0A0G2JDU0 121 aa3.52□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm9513B3GLJ6 99 aa3.52□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm11444F6QMA6 170 aa3.52□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 P01738 130 aa3.52□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Spink1P09036 80 aa3.52□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Psors1c2Q80ZC9 134 aa3.52□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ss18l2Q9D174 77 aa3.52□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Igkv4-91A0A075B5L2 119 aa3.51□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ighv8-11A0A075B5X4 119 aa3.51□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm43218A0A0G2JGT0 114 aa3.51□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Xcl1P47993 114 aa3.51□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tcl1b3P56842 122 aa3.51□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm10767Q3TQP0 103 aa3.51□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rmi2Q3UPE3 149 aa3.51□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 4930415O20RikQ8CDT5 131 aa3.51□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ndufs7Q9DC70 224 aa3.51□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ighv1-62-1A0A075B5U3 116 aa3.5□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trav7-6A0A075B640 112 aa3.5□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ighv1-59A0A0A6YXE0 117 aa3.5□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trav9n-2A0A0G2JDP3 113 aa3.5□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm16381A0A1Y7VKT9 73 aa3.5□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm11569B1AQB1 180 aa3.5□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm11554B1AQB2 190 aa3.5□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 A930033H14RikG5E8X6 103 aa3.5□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 OdaphJ3QNT8 126 aa3.5□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lst1O08843 95 aa3.5□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MalO09198 153 aa3.5□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 P01823 113 aa3.5□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rpl28P41105 137 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 4930432M17RikQ3V0W9 174 aa3.5□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 SpinklQ8CEK3 90 aa3.5□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Igkv4-72A0A0B4J1I4 117 aa3.49□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Smim26Q3V460 107 aa3.49□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Snhg11Q4G0K9 87 aa3.49□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cdc42se2Q8BGH7 84 aa3.49□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm20730A0A075B5J6 119 aa3.48□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ighv1-56A0A0A6YXG2 117 aa3.48□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trav11A0A0B4J1J9 114 aa3.48□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tfpi2O35536 230 aa3.48□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CrygaP04345 174 aa3.48□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 SelenowP63300 88 aa3.48□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Spag11Q8K4N2 71 aa3.48□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ndufa3Q9CQ91 84 aa3.48□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 1600014C23RikQ9DAX4 101 aa3.48□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trav14d-3-dv8A0A075B619 120 aa3.47□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tcl1b5P56845 121 aa3.47□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Plac8l1Q08EJ0 177 aa3.47□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 TeppQ6IMH0 216 aa3.47□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 4930519P11RikQ9CUJ8 166 aa3.47□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dnal4Q9DCM4 105 aa3.47□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fgf23Q9EPC2 251 aa3.47□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfand2aQ9JII7 171 aa3.47□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ly6hQ9WUC3 139 aa3.47□□□□□ -1.85
Trappc1-201ENSMUST00000060956 1700011M02RikB1AX35 88 aa3.46□□□□□ -1.86
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Smim20D3Z7Q2 69 aa3.46□□□□□ -1.86
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Igf1P05017 153 aa3.46□□□□□ -1.86
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hist1h4aP62806 103 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Klk9Q32M27 251 aa3.46□□□□□ -1.86
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem223Q9CQE2 199 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
Trappc1-201ENSMUST00000060956 4930524J08RikQ9CUJ5 163 aa3.46□□□□□ -1.86
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hectd4E9Q2E4 4418 aa3.46□□□□□ -1.86
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PkigO70139 76 aa3.45□□□□□ -1.86
Trappc1-201ENSMUST00000060956 P01819 144 aa3.45□□□□□ -1.86
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Defa16P50714 93 aa3.45□□□□□ -1.86
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rps28P62858 69 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pglyrp4Q0VB07 374 aa3.45□□□□□ -1.86
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vmo1Q5SXG7 201 aa3.45□□□□□ -1.86
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sprr1bQ62267 153 aa3.45□□□□□ -1.86
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Defb40Q70KL2 73 aa3.45□□□□□ -1.86
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ndufa12Q7TMF3 145 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm16485Q8C4B7 115 aa3.45□□□□□ -1.86
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sostdc1Q9CQN4 206 aa3.45□□□□□ -1.86
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MobpQ9D2P8 170 aa3.45□□□□□ -1.86
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ighv8-13A0A075B5Y0 101 aa3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 743.7 ms