RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000193170.1

Ccdc71-202, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ighv3-1A0A075B5S6 116 aa6.5□□□□□ -1.37
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Lelp1Q9DAE3 120 aa6.5□□□□□ -1.37
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ighv8-5A0A0A6YY60 119 aa6.49□□□□□ -1.37
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm9970F6ZED4 185 aa6.49□□□□□ -1.37
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Prr9Q8BV84 116 aa6.45□□□□□ -1.38
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm29423A0A087WRM1 55 aa6.39□□□□□ -1.39
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 LeprotO89013 131 aa6.39□□□□□ -1.39
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Tac4Q99N14 128 aa6.39□□□□□ -1.39
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 SelenowP63300 88 aa6.39□□□□□ -1.39
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm17472A0A075B683 117 aa6.39□□□□□ -1.39
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Igkv3-3A0A140T8Q0 119 aa6.39□□□□□ -1.39
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm17732E9Q5I2 61 aa6.39□□□□□ -1.39
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Defb33Q30KN3 62 aa6.39□□□□□ -1.39
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 NbasE9Q411 2356 aa6.39□□□□□ -1.39
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Akap13E9Q394 2776 aa6.38□□□□□ -1.39
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Fgf23Q9EPC2 251 aa6.38□□□□□ -1.39
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Phlda3Q9WV95 125 aa6.38□□□□□ -1.39
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Igkv4-69A0A0B4J1I6 116 aa6.38□□□□□ -1.39
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Spink8Q09TK9 105 aa6.38□□□□□ -1.39
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Trav9-2A0A075B647 113 aa6.37□□□□□ -1.39
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Trav9-4A0A0B4J1K2 113 aa6.37□□□□□ -1.39
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Spink12Q9D256 87 aa6.37□□□□□ -1.39
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Igkv4-62A0A0G2JDW9 117 aa6.36□□□□□ -1.39
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