RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Glrp1E9Q9S8 174 aa14,94□□□□□ -0,02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 OdaphJ3QNT8 126 aa14,94□□□□□ -0,02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm3443F7CCV5 94 aa14,93□□□□□ -0,02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1700010B08RikQ9DAI7 102 aa14,93□□□□□ -0,02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trdv5A0A075B661 115 aa14,93□□□□□ -0,02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 B230217C12RikE9Q3Z1 139 aa14,93□□□□□ -0,02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SbsponQ3UPR9 264 aa14,93□□□□□ -0,02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ndufs7Q9DC70 224 aa14,93□□□□□ -0,02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 FcgbpE9Q0B5 2583 aa14,93□□□□□ -0,02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Muc4Q8JZM8 3443 aa14,92□□□□□ -0,02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm29666A0A087WQ99 126 aa14,92□□□□□ -0,02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm11444F6QMA6 170 aa14,91□□□□□ -0,02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm9767G3X930 207 aa14,91□□□□□ -0,02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CirbpP60824 172 aaKnown RBP14,91□□□□□ -0,02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prr13Q9CQJ5 137 aa14,91□□□□□ -0,02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spag11Q8K4N2 71 aa14,91□□□□□ -0,02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm29423A0A087WRM1 55 aa14,89□□□□□ -0,03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rmi2Q3UPE3 149 aa14,89□□□□□ -0,03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smim10l1A0A087WNQ7 89 aa14,88□□□□□ -0,03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atp5g3P56384 141 aa14,87□□□□□ -0,03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Wdr38Q9D994 303 aa14,87□□□□□ -0,03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf414Q9DCK4 299 aa14,87□□□□□ -0,03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4930415O20RikQ8CDT5 131 aa14,86□□□□□ -0,03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Xlr5cQ9JJR2 179 aa14,86□□□□□ -0,03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fxyd5P97808 178 aa14,86□□□□□ -0,03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem101Q91VP7 257 aa14,86□□□□□ -0,03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tex15F8VPN2 2785 aa14,85□□□□□ -0,03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm28539A0A087WSL9 92 aa14,84□□□□□ -0,03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm7075D3Z497 112 aa14,84□□□□□ -0,03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Igkv4-78A0A0A6YYE5 119 aa14,84□□□□□ -0,03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam110dQ80X91 271 aa14,83□□□□□ -0,04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm3233E9Q2H5 230 aa14,82□□□□□ -0,04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01786 117 aa14,82□□□□□ -0,04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10577Q3UDV9 132 aa14,82□□□□□ -0,04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q99M08 65 aa14,82□□□□□ -0,04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav7-6A0A075B640 112 aa14,82□□□□□ -0,04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10767Q3TQP0 103 aa14,82□□□□□ -0,04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4930432M17RikQ3V0W9 174 aa14,82□□□□□ -0,04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Igkv4-91A0A075B5L2 119 aa14,81□□□□□ -0,04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4930470P17RikQ9D542 155 aa14,81□□□□□ -0,04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fgf23Q9EPC2 251 aa14,81□□□□□ -0,04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm20730A0A075B5J6 119 aa14,8□□□□□ -0,04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Stab1Q8R4Y4 2571 aa14,8□□□□□ -0,04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 2310009B15RikA0A0A6YWI4 143 aa14,8□□□□□ -0,04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4930546C10RikE9Q4Y3 121 aa14,8□□□□□ -0,04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm904Q3V2L5 102 aa14,78□□□□□ -0,04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01738 130 aa14,78□□□□□ -0,04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zc2hc1bQ9D534 172 aa14,78□□□□□ -0,04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Phpt1Q9DAK9 124 aa14,78□□□□□ -0,04
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krtap24-1G3X9A2 248 aa14,77□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Scgb1b2O35176 93 aa14,77□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cox6b1P56391 86 aaKnown RBP14,77□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm815Q3UWS2 115 aa14,77□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm867A0A1W2P7T4 151 aa14,76□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 9430069I07RikQ9CX21 111 aa14,76□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav13d-1A0A075B606 110 aa14,75□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01823 113 aa14,75□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10735Q3US96 136 aa14,75□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Foxc1Q61572 553 aa14,75□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nhlrc1Q8BR37 401 aa14,74□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Il19Q8CJ70 176 aa14,74□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv1-62-1A0A075B5U3 116 aa14,74□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AngP21570 145 aa14,74□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CdsnQ7TPC1 561 aa14,74□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lage3Q9CR70 148 aa14,74□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cd164l2Q9D6W7 172 aa14,74□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10549Q3URY4 149 aa14,73□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ly6c2P0CW03 131 aa14,72□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 BB014433Q8C5R5 389 aa14,72□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rpl36aP83882 106 aaKnown RBP14,72□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Eif4ebp3Q80VV3 101 aa14,72□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lyrm9Q3UN90 78 aa14,71□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SpinklQ8CEK3 90 aa14,71□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 HampQ9EQ21 83 aa14,71□□□□□ -0,05
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Megf8P60882 2789 aa14,7□□□□□ -0,06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav9n-2A0A0G2JDP3 113 aa14,69□□□□□ -0,06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Shisa2Q8QZV2 295 aa14,69□□□□□ -0,06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ly6hQ9WUC3 139 aa14,69□□□□□ -0,06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10251J3QPM5 127 aa14,69□□□□□ -0,06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Acyp1P56376 99 aa14,69□□□□□ -0,06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cdc42se2Q8BGH7 84 aa14,69□□□□□ -0,06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lst1O08843 95 aa14,68□□□□□ -0,06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sostdc1Q9CQN4 206 aa14,68□□□□□ -0,06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SmcpP15265 143 aa14,67□□□□□ -0,06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Igkv4-79A0A075B5L8 119 aa14,67□□□□□ -0,06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atp5g1Q9CR84 136 aa14,67□□□□□ -0,06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tfpi2O35536 230 aa14,66□□□□□ -0,06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PemtQ61907 199 aa14,66□□□□□ -0,06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm9922Q8C3P1 144 aa14,66□□□□□ -0,06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10300Q8C8P7 189 aa14,66□□□□□ -0,06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Chchd7Q8K2Q5 85 aa14,66□□□□□ -0,06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lypd5Q9D7Z7 256 aa14,66□□□□□ -0,06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MalO09198 153 aa14,65□□□□□ -0,06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rpl28P41105 137 aaKnown RBP14,65□□□□□ -0,06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dmbt1Q60997 2085 aa14,65□□□□□ -0,06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PrlhG3UWC3 86 aa14,65□□□□□ -0,06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CrygaP04345 174 aa14,64□□□□□ -0,07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Plac8l1Q08EJ0 177 aa14,64□□□□□ -0,07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TeppQ6IMH0 216 aa14,64□□□□□ -0,07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Defb42Q8BVB5 75 aa14,64□□□□□ -0,07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9,4 ms