Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ5

Prr13, Proline-rich protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr13Q9CQJ5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Prr13Q9CQJ5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Prr13Q9CQJ5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Prr13Q9CQJ5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Prr13Q9CQJ5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Prr13Q9CQJ5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Prr13Q9CQJ5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Prr13Q9CQJ5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Prr13Q9CQJ5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Prr13Q9CQJ5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20,31■□□□□ 0,84
Prr13Q9CQJ5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Prr13Q9CQJ5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Prr13Q9CQJ5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,94■□□□□ 0,78
Prr13Q9CQJ5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Prr13Q9CQJ5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Prr13Q9CQJ5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Prr13Q9CQJ5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19,66■□□□□ 0,74
Prr13Q9CQJ5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,66■□□□□ 0,74
Prr13Q9CQJ5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19,66■□□□□ 0,74
Prr13Q9CQJ5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Prr13Q9CQJ5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19,56■□□□□ 0,72
Prr13Q9CQJ5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19,46■□□□□ 0,71
Prr13Q9CQJ5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,33■□□□□ 0,69
Prr13Q9CQJ5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,33■□□□□ 0,69
Prr13Q9CQJ5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
Prr13Q9CQJ5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
Prr13Q9CQJ5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
Prr13Q9CQJ5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,23■□□□□ 0,67
Prr13Q9CQJ5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19,21■□□□□ 0,67
Prr13Q9CQJ5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Prr13Q9CQJ5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
Prr13Q9CQJ5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19,03■□□□□ 0,64
Prr13Q9CQJ5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19,03■□□□□ 0,64
Prr13Q9CQJ5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,98■□□□□ 0,63
Prr13Q9CQJ5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18,92■□□□□ 0,62
Prr13Q9CQJ5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,61
Prr13Q9CQJ5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Prr13Q9CQJ5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
Prr13Q9CQJ5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
Prr13Q9CQJ5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,57
Prr13Q9CQJ5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,63■□□□□ 0,57
Prr13Q9CQJ5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,61■□□□□ 0,57
Prr13Q9CQJ5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,59■□□□□ 0,57
Prr13Q9CQJ5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,56■□□□□ 0,56
Prr13Q9CQJ5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18,51■□□□□ 0,55
Prr13Q9CQJ5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,51■□□□□ 0,55
Prr13Q9CQJ5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,49■□□□□ 0,55
Prr13Q9CQJ5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,47■□□□□ 0,55
Prr13Q9CQJ5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,46■□□□□ 0,55
Prr13Q9CQJ5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,45■□□□□ 0,54
Prr13Q9CQJ5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,44■□□□□ 0,54
Prr13Q9CQJ5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,41■□□□□ 0,54
Prr13Q9CQJ5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,36■□□□□ 0,53
Prr13Q9CQJ5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,36■□□□□ 0,53
Prr13Q9CQJ5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
Prr13Q9CQJ5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,3■□□□□ 0,52
Prr13Q9CQJ5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
Prr13Q9CQJ5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
Prr13Q9CQJ5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,22■□□□□ 0,51
Prr13Q9CQJ5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,22■□□□□ 0,51
Prr13Q9CQJ5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Prr13Q9CQJ5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,18■□□□□ 0,5
Prr13Q9CQJ5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,16■□□□□ 0,5
Prr13Q9CQJ5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,16■□□□□ 0,5
Prr13Q9CQJ5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18,16■□□□□ 0,5
Prr13Q9CQJ5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Prr13Q9CQJ5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
Prr13Q9CQJ5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
Prr13Q9CQJ5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Prr13Q9CQJ5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18,09■□□□□ 0,49
Prr13Q9CQJ5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Prr13Q9CQJ5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Prr13Q9CQJ5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Prr13Q9CQJ5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Prr13Q9CQJ5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
Prr13Q9CQJ5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,97■□□□□ 0,47
Prr13Q9CQJ5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17,93■□□□□ 0,46
Prr13Q9CQJ5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,91■□□□□ 0,46
Prr13Q9CQJ5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,9■□□□□ 0,46
Prr13Q9CQJ5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Prr13Q9CQJ5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Prr13Q9CQJ5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Prr13Q9CQJ5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Prr13Q9CQJ5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Prr13Q9CQJ5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC17,8■□□□□ 0,44
Prr13Q9CQJ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,77■□□□□ 0,44
Prr13Q9CQJ5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,77■□□□□ 0,44
Prr13Q9CQJ5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,77■□□□□ 0,44
Prr13Q9CQJ5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17,77■□□□□ 0,43
Prr13Q9CQJ5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
Prr13Q9CQJ5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17,72■□□□□ 0,43
Prr13Q9CQJ5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17,72■□□□□ 0,43
Prr13Q9CQJ5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Prr13Q9CQJ5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,7■□□□□ 0,42
Prr13Q9CQJ5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Prr13Q9CQJ5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Prr13Q9CQJ5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17,68■□□□□ 0,42
Prr13Q9CQJ5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,67■□□□□ 0,42
Prr13Q9CQJ5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,67■□□□□ 0,42
Prr13Q9CQJ5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,67■□□□□ 0,42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,2 ms