RNA–Protein interactions for RNA: YOR057W

SGT1, Transcript of Cochaperone protein, yeast

Gene SGT1, Length 1,188 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SGT1	YOR057W	UBP12	P39538	1254 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	DOS2	P54858	310 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	USA1	Q03714	838 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	KRE5	P22023	1365 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	RPC34	P32910	317 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	BRN1	P38170	754 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	EXO1	P39875	702 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	YEL076C	P39971	216 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	YFL015C	P43578	164 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	SAP4	P53036	818 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	PEF1	P53238	335 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	SEC5	P89102	971 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	PCK1	P10963	549 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	AEP2	P22136	580 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	EUG1	P32474	517 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	PEA2	P40091	420 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	GAT1	P43574	510 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	IRC5	P43610	853 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	YJL043W	P47053	257 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	YGL081W	P53156	320 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	ORM2	Q06144	216 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	MRPL9	P31334	269 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	NIT2	P47016	307 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	ATP23	P53722	227 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	IRC3	Q06683	689 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	FRE7	Q12333	620 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	RAD9	P14737	1309 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	CTT1	P06115	562 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	SEC12	P11655	471 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	DSS4	P32601	143 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	YEN1	P40028	759 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	SPC105	P53148	917 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	WAR1	Q03631	944 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
SGT1	YOR057W	VPS5	Q92331	675 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	SNF2	P22082	1703 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	BET2	P20133	325 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	CWH43	P25618	953 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	BEM3	P32873	1128 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	APD1	P38281	316 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	MDR1	P53258	950 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	TRE2	Q08693	809 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	PSK1	P31374	1356 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	EAF5	P39995	279 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	OPT1	P40897	799 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	NMD5	P46970	1048 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	MNT2	P53059	558 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	SLD3	P53135	668 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	STP1	Q00947	519 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	RGT2	Q12300	763 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	SPT7	P35177	1332 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	AAC1	P04710	309 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	TDA10	P42938	290 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	BST1	P43571	1029 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	PCL8	Q08966	492 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	AIM44	Q99299	758 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	ARG1	P22768	420 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	GSY2	P27472	705 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	GRX4	P32642	244 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	YBR071W	P38243	211 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	TMA17	Q12513	150 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SGT1	YOR057W	CDC5	P32562	705 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SGT1	YOR057W	SAE2	P46946	345 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SGT1	YOR057W	BSP1	Q06604	576 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SGT1	YOR057W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SGT1	YOR057W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SGT1	YOR057W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SGT1	YOR057W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SGT1	YOR057W	MHP1	P43638	1398 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SGT1	YOR057W	URA3	P03962	267 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SGT1	YOR057W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SGT1	YOR057W	STL1	P39932	569 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SGT1	YOR057W	MAD2	P40958	196 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SGT1	YOR057W	YJR120W	P47157	116 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SGT1	YOR057W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SGT1	YOR057W	HOL1	P53389	586 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SGT1	YOR057W	YNL092W	P53934	400 aa		4.01	□□□□□ -1.77

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