RNA–Protein interactions for RNA: YOL080C

REX4, Transcript of Putative RNA exonuclease, yeast

Gene REX4, Length 870 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REX4	YOL080C	CYK3	Q07533	885 aa		4.66	□□□□□ -1.66
REX4	YOL080C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
REX4	YOL080C	INO80	P53115	1489 aa		4.66	□□□□□ -1.66
REX4	YOL080C	CTT1	P06115	562 aa		4.65	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	YCR061W	P25639	631 aa		4.65	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	BEM3	P32873	1128 aa		4.65	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
REX4	YOL080C	LNP1	P38878	278 aa		4.65	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	VPS8	P39702	1274 aa		4.65	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	NET1	P47035	1189 aa		4.65	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	MDG1	P53885	366 aa		4.65	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	CRF1	Q04930	467 aa		4.65	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	BSP1	Q06604	576 aa		4.65	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	IRC3	Q06683	689 aa		4.65	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	ARP7	Q12406	477 aa		4.65	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.65	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.65	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.65	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	CLC1	P17891	233 aa		4.64	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	YLF2	P38746	405 aa		4.64	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	MAD3	P47074	515 aa		4.64	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	COG2	P53271	262 aa		4.64	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	YML053C	Q04978	212 aa		4.64	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	CRD1	Q07560	283 aa		4.64	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	AAD4	Q07747	329 aa		4.64	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	NYV1	Q12255	253 aa		4.64	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.64	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	SPC110	P32380	944 aa		4.63	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	MAM1	P40065	302 aa		4.63	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	NMD5	P46970	1048 aa		4.63	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	RSC9	Q03124	581 aa		4.63	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	YDL242W	Q07746	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	SPT7	P35177	1332 aa		4.63	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	LAS21	P40367	830 aa		4.62	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	GLO1	P50107	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	RTS3	P53289	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.62	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	VPS64	Q03944	604 aa		4.62	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	ICL2	Q12031	575 aa		4.62	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	LCB4	Q12246	624 aa		4.62	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	RTC1	Q08281	1341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	BI2	P03873	423 aa		4.61	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	SNM1	P40993	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	STP1	Q00947	519 aa		4.61	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	MET14	Q02196	202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	PLM2	Q04383	521 aa		4.61	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	TPO3	Q06451	622 aa		4.61	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	NNF2	P53253	936 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	AIM6	Q07716	390 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	ICT1	Q12385	394 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	GAL1	P04385	528 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	SNO3	P43544	222 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	TEP1	P53916	434 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	TLG1	Q03322	224 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	YAP7	Q08182	245 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REX4	YOL080C	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	TMT1	P32643	299 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	YKL133C	P36066	463 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	TPM2	P40414	161 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	HIS6	P40545	261 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	QRI7	P43122	407 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	GAT1	P43574	510 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	HIM1	Q06674	414 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	APM3	P38153	483 aa		4.57	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	FTH1	P38310	465 aa		4.57	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	CIR1	P42940	261 aa		4.57	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	AAT1	Q01802	451 aa		4.57	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	MLC2	Q06580	163 aa		4.57	□□□□□ -1.68
REX4	YOL080C	RAD34	Q06665	692 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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