RNA–Protein interactions for RNA: YOL007C

CSI2, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene CSI2, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI2YOL007C HMG2P12684 1045 aa3.57□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C YPK1P12688 680 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C AIM17P23180 465 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C HXT4P32467 576 aa3.57□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C YJL193WP39542 402 aa3.57□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C STL1P39932 569 aa3.57□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C TAN1P53072 289 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C MTD1Q02046 320 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C MET14Q02196 202 aa3.57□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C RRP6Q12149 733 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data3.57□□□□□ -1.84not detected
CSI2YOL007C TUF1P02992 437 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C VPS33P20795 691 aa3.56□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C PTP2P29461 750 aa3.56□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C SDS22P36047 338 aa3.56□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C TAF5P38129 798 aa3.56□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C GND1P38720 489 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C MDV1P47025 714 aa3.56□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C PUS4P48567 403 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C PEF1P53238 335 aa3.56□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C VMS1Q04311 632 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C MLC2Q06580 163 aa3.56□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C VPS5Q92331 675 aa3.56□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C PNO1Q99216 274 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C GAL1P04385 528 aa3.55□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C CWH43P25618 953 aa3.55□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C IMD2P38697 523 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C RRP8P38961 392 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C SAW1P39735 261 aa3.55□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C YIR016WP40572 265 aa3.55□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C IMD3P50095 523 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C PSF3Q12146 194 aa3.55□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C YEF3P16521 1044 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C PHO3P24031 467 aa3.54□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C PWP2P25635 923 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C RPT3P33298 428 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C ASK10P48361 1146 aa3.54□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C SQS1P53866 767 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C YNL092WP53934 400 aa3.54□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C UBX4P54730 416 aa3.54□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C SNU56Q03782 492 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C RAD33Q04231 177 aa3.54□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C TRI1Q05024 226 aa3.54□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C CET1O13297 549 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C GAL4P04386 881 aa3.53□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C MAK32P23060 363 aa3.53□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C GDA1P32621 518 aa3.53□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C TGL1P34163 548 aa3.53□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C RMA1P36001 430 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C EAF5P39995 279 aa3.53□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C YIL152WP40455 235 aa3.53□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C SCW10Q04951 389 aa3.53□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C ARP7Q12406 477 aa3.53□□□□□ -1.84
CSI2YOL007C TOP1P04786 769 aa3.52□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C YCR043CP25361 127 aa3.52□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C PET309P32522 965 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C VPS24P36095 224 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C FTH1P38310 465 aa3.52□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C YLF2P38746 405 aa3.52□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C HIS6P40545 261 aa3.52□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C MNT2P53059 558 aa3.52□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C BOP3P53958 396 aa3.52□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C CRT10Q08226 957 aa3.52□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C NUR1Q12066 484 aa3.52□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C VAS1P07806 1104 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C PCK1P10963 549 aa3.51□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C PGI1P12709 554 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C BET2P20133 325 aa3.51□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C DPB3P27344 201 aa3.51□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C CDC5P32562 705 aa3.51□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C DSS4P32601 143 aa3.51□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C PTH2P34222 208 aa3.51□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C MTG2P38860 518 aa3.51□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C MAD2P40958 196 aa3.51□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C CIN1P40987 1014 aa3.51□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C QRI7P43122 407 aa3.51□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C ATX2Q12067 313 aa3.51□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C DIN7Q12086 430 aa3.51□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C HOS1Q12214 470 aa3.51□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C UBX3Q12229 455 aa3.51□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C YOL114CQ12322 202 aa3.51□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C PHO2P07269 559 aa3.5□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C PIF1P07271 859 aa3.5□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C YHL041WP38730 149 aa3.5□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C SCS2P40075 244 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C MDR1P53258 950 aa3.5□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C YNR071CP53757 342 aa3.5□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C TEP1P53916 434 aa3.5□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C ATG16Q03818 150 aa3.5□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C BRE1Q07457 700 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C NRT1Q08485 598 aa3.5□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C MSS18P08593 268 aa3.49□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C SEC12P11655 471 aa3.49□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C PHO81P17442 1178 aa3.49□□□□□ -1.85
CSI2YOL007C MSH1P25846 959 aa3.49□□□□□ -1.85
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