RNA–Protein interactions for RNA: YNL146W

YNL146W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YNL146W, Length 303 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL146W	YNL146W	SEC12	P11655	471 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YNL146W	YNL146W	LAS21	P40367	830 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YNL146W	YNL146W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
YNL146W	YNL146W	PLM2	Q04383	521 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YNL146W	YNL146W	HFI1	Q12060	488 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YNL146W	YNL146W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YNL146W	YNL146W	DGR2	P32330	852 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YNL146W	YNL146W	PLC1	P32383	869 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YNL146W	YNL146W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YNL146W	YNL146W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YNL146W	YNL146W	YJL107C	P42947	387 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YNL146W	YNL146W	ACS1	Q01574	713 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YNL146W	YNL146W	LCB4	Q12246	624 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YNL146W	YNL146W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
YNL146W	YNL146W	CBP3	P21560	335 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YNL146W	YNL146W	VPS8	P39702	1274 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YNL146W	YNL146W	MAM1	P40065	302 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YNL146W	YNL146W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
YNL146W	YNL146W	YML053C	Q04978	212 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YNL146W	YNL146W	NIC96	P34077	839 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	RKM3	P38222	552 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	FMP42	Q04991	504 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	YLR281C	Q05863	155 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	EXO84	P38261	753 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	SLX1	P38324	304 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	ORC5	P50874	479 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	PEF1	P53238	335 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	APM4	Q99186	491 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	SAN1	P22470	610 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	HXT4	P32467	576 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	QRI7	P43122	407 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	FCP1	Q03254	732 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	YLR352W	Q06479	807 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	RSA1	Q08932	381 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	ARN1	P38731	627 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	PCL6	P40038	420 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	SND1	Q04007	877 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	CDC23	P16522	626 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	COS12	P53053	380 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	MDR1	P53258	950 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	YDL242W	Q07746	117 aa		2.79	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	AEP2	P22136	580 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	GSH1	P32477	678 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	MNN2	P38069	597 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	BZZ1	P38822	633 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	UBP7	P40453	1071 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	AZF1	P41696	914 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	YAT1	P80235	687 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	IZH1	Q03419	316 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	YLR112W	Q12130	139 aa		2.78	□□□□□ -1.96
YNL146W	YNL146W	FAA2	P39518	744 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	CRZ1	P53968	678 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	CWH43	P25618	953 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	STB5	P38699	743 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	VPS25	P47142	202 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	MSS51	P32335	436 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	ASG1	P40467	964 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	TAH18	Q12181	623 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	REV1	P12689	985 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	ATP12	P22135	325 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	ARG1	P22768	420 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	OCA5	P38738	679 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	LNP1	P38878	278 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.74	□□□□□ -1.97	not detected
YNL146W	YNL146W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	DID4	P36108	232 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	VPS41	P38959	992 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	KRE9	P39005	276 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	CUL3	P53202	744 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	RNH70	P53331	553 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	ESBP6	P53918	673 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	ARP9	Q05123	467 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	PDR8	Q06149	701 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	VPS5	Q92331	675 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	YML002W	P0CF17	737 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	EFM2	P38347	419 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YNL146W	YNL146W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 169.6 ms