RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	YPL014W	Q02606	381 aa		5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	NSE5	Q03718	556 aa		5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	YDR344C	Q05510	147 aa		5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	HOS1	Q12214	470 aa		5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	PPH22	P23595	377 aa		5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	PEX34	P25584	144 aa		5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	SGE1	P33335	543 aa		5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	ATM1	P40416	690 aa		5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	RRN7	P40992	514 aa		5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	PXA1	P41909	870 aa		5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	TAH11	P47112	604 aa		5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	MET14	Q02196	202 aa		5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	YLR012C	Q07927	99 aa		5.85	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.85	□□□□□ -1.47	not detected
AMD1	YML035C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	BST1	P43571	1029 aa		5.84	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	CNN1	P43618	361 aa		5.84	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.84	□□□□□ -1.47	not detected
AMD1	YML035C	SLT2	Q00772	484 aa		5.84	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	TOF2	Q02208	771 aa		5.84	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	ARP9	Q05123	467 aa		5.84	□□□□□ -1.47
AMD1	YML035C	YMR085W	P0CF18	432 aa		5.84	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	ERR1	P0CX10	437 aa		5.84	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	ERR2	P0CX11	437 aa		5.84	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	ERR3	P42222	437 aa		5.84	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	SWC7	Q06707	132 aa		5.84	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	PMR1	P13586	950 aa		5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	CDC20	P26309	610 aa		5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	MET22	P32179	357 aa		5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	SET3	P36124	751 aa		5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	KTR7	P40504	517 aa		5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	COQ6	P53318	479 aa		5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	TUB4	P53378	473 aa		5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	YPL109C	Q02981	657 aa		5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	ADI1	Q03677	179 aa		5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	YOR387C	Q08910	206 aa		5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	MRPL25	P23369	157 aa		5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	SMI1	P32566	505 aa		5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	UTR2	P32623	467 aa		5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	SRP101	P32916	621 aa		5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	SMF2	P38778	549 aa		5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	FAR8	Q05040	523 aa		5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	AFI1	Q99222	893 aa		5.83	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	BAS1	P22035	811 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	KAR9	P32526	644 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	PEX5	P35056	612 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	ADD66	P36040	267 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	ELO3	P40319	345 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	YJR142W	P47173	342 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	DOS2	P54858	310 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	YMR160W	Q03823	816 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	REV1	P12689	985 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	VAN1	P23642	535 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	URA10	P30402	227 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	MRPL40	P36534	297 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	KTR4	P38131	464 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	APM3	P38153	483 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	YSW1	P38280	609 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	YHL041W	P38730	149 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	SPC97	P38863	823 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	GND2	P53319	492 aa		5.82	□□□□□ -1.48
AMD1	YML035C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48

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