RNA–Protein interactions for RNA: YJL054W

TIM54, Transcript of Component of the mitochondrial TIM22 complex, yeastyeast

Gene TIM54, Length 1,437 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIM54YJL054W ESBP6P53918 673 aa5.66□□□□□ -1.5
TIM54YJL054W YPL014WQ02606 381 aa5.66□□□□□ -1.5
TIM54YJL054W UTP5Q04177 643 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
TIM54YJL054W TAF9Q05027 157 aa5.66□□□□□ -1.5
TIM54YJL054W HRD3Q05787 833 aa5.66□□□□□ -1.5
TIM54YJL054W MSB2P32334 1306 aa5.66□□□□□ -1.5
TIM54YJL054W REV1P12689 985 aa5.65□□□□□ -1.5
TIM54YJL054W AEP2P22136 580 aa5.65□□□□□ -1.5
TIM54YJL054W MSH2P25847 964 aa5.65□□□□□ -1.5
TIM54YJL054W COQ2P32378 372 aa5.65□□□□□ -1.5
TIM54YJL054W SWE1P32944 819 aa5.65□□□□□ -1.5
TIM54YJL054W CSE1P33307 960 aa5.65□□□□□ -1.5
TIM54YJL054W ARL1P38116 183 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TIM54YJL054W TIF5P38431 405 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TIM54YJL054W NMD3P38861 518 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TIM54YJL054W RMD8P43620 662 aa5.65□□□□□ -1.5
TIM54YJL054W PHO86P46956 311 aa5.65□□□□□ -1.5
TIM54YJL054W HFM1P51979 1187 aa5.65□□□□□ -1.5
TIM54YJL054W YGR045CP53229 120 aa5.65□□□□□ -1.5
TIM54YJL054W YCG1Q06680 1035 aa5.65□□□□□ -1.5
TIM54YJL054W DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TIM54YJL054W LCB4Q12246 624 aa5.65□□□□□ -1.5
TIM54YJL054W TEL1P38110 2787 aa5.65□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W RPS3P05750 240 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W CDC33P07260 213 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W GCR1P07261 785 aa5.65□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W HEM13P11353 328 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W ECM13P38195 257 aa5.65□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W MIP6P38760 659 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W HEM14P40012 539 aa5.65□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W OSW5P40219 148 aa5.65□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W MAD1P40957 749 aa5.65□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W UFE1P41834 346 aa5.65□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W ASG7P46993 209 aa5.65□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W HOP2P53187 214 aa5.65□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W CWC24P53769 259 aa5.65□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W ARO80Q04052 950 aa5.65□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W MDM38Q08179 573 aa5.65□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W MRP4P32902 394 aa5.64□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W YAR028WP39548 234 aa5.64□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W RPT2P40327 437 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W ERG10P41338 398 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W PUS2P53167 370 aa5.64□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W NMA2P53204 395 aa5.64□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W COQ6P53318 479 aa5.64□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W RTN1Q04947 295 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W HDA2Q06629 674 aa5.64□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W GIC2Q06648 383 aa5.64□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W TMA16Q08687 178 aa5.64□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W YOR387CQ08910 206 aa5.64□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W SEC23P15303 768 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W RPN12P32496 274 aa5.63□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W STE5P32917 917 aa5.63□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W SGE1P33335 543 aa5.63□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W NIP100P33420 868 aa5.63□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W ADD66P36040 267 aa5.63□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W SAP190P36123 1033 aa5.63□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W PSY4P38193 441 aa5.63□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W QNS1P38795 714 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W SPT8P38915 602 aa5.63□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W YEL075CP39972 122 aa5.63□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W CCT8P47079 568 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W SVS1Q12254 260 aa5.63□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W ARP7Q12406 477 aa5.63□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W YOL098CQ12496 1037 aa5.63□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W MSP1P28737 362 aa5.62□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W PXL1P36166 706 aa5.62□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W KTR4P38131 464 aa5.62□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W DUN1P39009 513 aa5.62□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W DJP1P40564 432 aa5.62□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W STU2P46675 888 aa5.62□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data5.62□□□□□ -1.51not detected
TIM54YJL054W COP1P53622 1201 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W PIR3Q03180 325 aa5.62□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W AIM32Q04689 311 aa5.62□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W YPR078CQ06813 372 aa5.62□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W CBR1P38626 284 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W TFG2P41896 400 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W FLC3P53121 802 aa5.61□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W SIL1Q08199 421 aa5.61□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W EMP46Q12396 444 aa5.61□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W BI2P03873 423 aa5.6□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W BI4P03879 638 aa5.6□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W MSF1P08425 469 aa5.6□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W PUT4P15380 627 aa5.6□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W ARF2P19146 181 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W NFS1P25374 497 aa5.6□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W GYP6P32806 458 aa5.6□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W TCD2P36101 447 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W HSE1P38753 452 aa5.6□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W GDH3P39708 457 aa5.6□□□□□ -1.51
TIM54YJL054W GIP4P39732 760 aa5.6□□□□□ -1.51
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