RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641928.1

MFSD8-255, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 4,083 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-255	ENST00000641928	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	SPC25	Q9HBM1	224 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	KLF15	Q9UIH9	416 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	LMNB1	P20700	586 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	PTGS1	P23219	599 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	RRM1	P23921	792 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	SKOR1	P84550	965 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	LUZP1	Q86V48	1076 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	ARHGEF10	O15013	1369 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	FANCC	Q00597	558 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	KRT32	Q14532	448 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	MTFR1	Q15390	333 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	FANCA	O15360	1455 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	SHPRH	Q149N8	1683 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	GPR182	O15218	404 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	CORO7	P57737	925 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	PIP4K2B	P78356	416 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	ARID5A	Q03989	594 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	DRP2	Q13474	957 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	PTPRN	Q16849	979 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	MPND	Q8N594	471 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	CENPO	Q9BU64	300 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	DACH1	Q9UI36	760 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-255	ENST00000641928	ERVK-7	P63135	1459 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	TREH	O43280	583 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	CDR1	P51861	262 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	NEDD9	Q14511	834 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	ZNF394	Q53GI3	561 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	CNTROB	Q8N137	903 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	SPC24	Q8NBT2	197 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	TET3	O43151	1660 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	EBAG9	O00559	213 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	MTHFS	P49914	203 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	PSMD2	Q13200	908 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	ILDR2	Q71H61	639 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-255	ENST00000641928	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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