RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 WDR19Q8NEZ3 1342 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 CACNA1SQ13698 1873 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 DPEP1P16444 411 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 IARSP41252 1262 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 CACNB3P54284 484 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 SGMS1Q86VZ5 419 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 ZNF654Q8IZM8 581 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 PPIP5K2O43314 1243 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 ECE2O60344 883 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 TFAP4Q01664 338 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 RTN1Q16799 776 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 C12orf60Q5U649 245 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 TTLL6Q8N841 843 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 ALG1Q9BT22 464 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 TMEM63CQ9P1W3 806 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 TTC6Q86TZ1 520 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 GAS2L3Q86XJ1 694 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 SLF2Q8IX21 1173 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 SPATA32Q96LK8 384 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 STX8Q9UNK0 236 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 SYCE3A1L190 88 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 USP17L3A6NCW0 530 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 USP17L4A6NCW7 530 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 SLURP2P0DP57 97 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 RHBDL3P58872 404 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 PPP4CP60510 307 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 TCP10Q12799 353 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 PODNQ7Z5L7 613 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 TMTC2Q8N394 836 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 FANCBQ8NB91 859 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 FAM205AQ6ZU69 1335 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 MYH13Q9UKX3 1938 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 CDKL5O76039 1030 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 TSPY3P0CV98 308 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 TSPY8P0CW00 308 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 GUCY1A2P33402 732 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 CATIPQ7Z7H3 387 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 USP40Q9NVE5 1235 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 FLT1P17948 1338 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 RESTQ13127 1097 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 SEC23AQ15436 765 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 C7orf43Q8WVR3 580 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 DOCK2Q92608 1830 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 RAD17O75943 681 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 MBD3O95983 291 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 PLCG2P16885 1265 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 NTRK3Q16288 839 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 SBK1Q52WX2 424 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 TEKT1Q969V4 418 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 A0A1B0GUL6 1792 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 LAMA4Q16363 1823 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 UBE2HP62256 183 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 PLEKHA8P1O95397 391 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 NFIAQ12857 509 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 TRIM29Q14134 588 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 LARGE2Q8N3Y3 721 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 USP28Q96RU2 1077 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 KCNJ14Q9UNX9 436 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 ORC4O43929 436 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 CRKP46108 304 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 CDK8P49336 464 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 EIF6P56537 245 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 KRT40Q6A162 431 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 BICD2Q8TD16 824 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 IL17RBQ9NRM6 502 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 KIF28PB7ZC32 967 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 FGRP09769 529 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-215ENST00000549143 PCP11498 1178 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms