RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CtsgP28293 261 aa9.95□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dad1P61804 113 aa9.95□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nhlrc1Q8BR37 401 aa9.95□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clec5aQ9R007 190 aa9.95□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 5930422O12RikQ8C4Y4 123 aa9.94□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PpbpQ9EQI5 113 aa9.94□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lamtor2Q9JHS3 125 aa9.94□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Unc79Q0KK59 2596 aa9.94□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NrepQ07475 68 aa9.94□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cphx2Q8BX39 182 aa9.94□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tm2d1Q99MB3 208 aa9.94□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PolqQ8CGS6 2544 aa9.94□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv1-77A0A0G2JGS9 117 aa9.94□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gp9O88186 177 aa9.94□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav7d-3Q5R1I1 112 aa9.94□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm12169F2Z474 250 aa9.94□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hoxd3P09027 433 aa9.94□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm1553Q66VB7 94 aa9.94□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 8030423J24RikQ9CX45 142 aa9.94□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Esp24A8R0V6 68 aa9.93□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bak1O08734 209 aa9.93□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lyrm9Q3UN90 78 aa9.93□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zmat4Q8BZ94 229 aa9.93□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tns1E9Q0S6 1888 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm28038F7BCN9 126 aa9.93□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm933J3QPC1 141 aa9.93□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dmrtc2Q8CGW9 370 aa9.93□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrp4Q8VI56 1905 aa9.93□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5941Q497P9 117 aa9.93□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sec11aQ9R0P6 179 aa9.93□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv12-3A0A075B5T1 117 aa9.92□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv1-23A0A0A6YVW3 117 aa9.92□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cited1P97769 203 aa9.92□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 9130213A22RikQ3V3T2 120 aa9.92□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NpbQ8K4P1 119 aa9.92□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wfdc15bQ9JHY4 80 aa9.92□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Foxi3E0CZH3 425 aa9.92□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd24P24807 76 aa9.92□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem263Q9DAM7 115 aa9.92□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 V1ra8Q9EQ48 279 aa9.92□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 IgipA0A1B0GR74 53 aa9.92□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 A930003A15RikQ3U552 87 aa9.92□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 H2al1nQ497L1 109 aa9.92□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20379A0A087WR34 119 aa9.91□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P03985 172 aa9.91□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf575Q3TXZ1 239 aa9.91□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ndufa4Q62425 82 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdk2ap2Q9CPY4 127 aa9.91□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav3n-3A0A0G2JEM0 114 aa9.91□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sdhaf1Q3U276 118 aa9.91□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igkv3-1A0A075B5P1 119 aa9.91□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sprr3O09116 238 aa9.91□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Oxld1Q9CR10 201 aa9.91□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9CX25 107 aa9.91□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv2-7A0A075B5Q8 116 aa9.91□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igkv4-57A0A0A6YYE7 117 aa9.91□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cks1bP61025 79 aa9.91□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 5730522E02RikQ5SP45 163 aa9.9□□□□□ -0.82
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igkv4-70A0A0B4J1I5 116 aa9.9□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm11020F6ZGD5 61 aa9.9□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ube2cQ9D1C1 179 aa9.9□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gnb1lQ9EQ15 326 aa9.9□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trbv14A0A140T8L9 115 aa9.89□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20517G3UVU6 152 aa9.89□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01748 117 aa9.89□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20499D3Z4G5 72 aa9.89□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnase1P00683 149 aa9.89□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01791 123 aa9.89□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav14n-2A0A0G2JDF5 121 aa9.89□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01820 115 aa9.89□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ang4Q3TMQ6 144 aa9.89□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10188Q3V432 135 aa9.89□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpx1P11352 201 aa9.89□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem86bQ497J1 226 aa9.89□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Foxi1Q922I5 372 aa9.89□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cox8bP48772 70 aa9.88□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SeboxP70368 190 aa9.88□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp292Q9Z2U2 2698 aa9.88□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm45717A0A1B0GT68 152 aa9.88□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GfyJ3KML8 504 aa9.88□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vamp8O70404 101 aa9.88□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav14-3A0A075B607 120 aa9.88□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav14d-1A0A075B6B1 121 aa9.88□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igkv8-34A0A0G2JDU0 121 aa9.88□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5150Q1AN92 299 aa9.88□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Megf10Q6DIB5 1147 aa9.88□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tac4Q99N14 128 aa9.88□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nop10Q9CQS2 64 aa9.88□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mlst8Q9DCJ1 326 aa9.88□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pla2g2dQ9WVF6 144 aa9.88□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prrc2aQ7TSC1 2158 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem14cQ9CQN6 114 aa9.88□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spata45Q9CVW4 97 aa9.88□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eml6Q5SQM0 1958 aa9.87□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01811 117 aa9.87□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plac1Q9JI83 173 aa9.87□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lama3Q61789 3330 aa9.87□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FlnbQ80X90 2602 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tex54G3UW99 86 aa9.87□□□□□ -0.83
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrps12O35680 139 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.9 ms