RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CTDP1-208ENST00000613122 MUC17Q685J3 4493 aa6.25□□□□□ -1.41
CTDP1-208ENST00000613122 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.24□□□□□ -1.41
CTDP1-208ENST00000613122 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CTDP1-208ENST00000613122 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.15□□□□□ -1.42
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.13□□□□□ -1.43
CTDP1-208ENST00000613122 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.08□□□□□ -1.44
CTDP1-208ENST00000613122 LCE1BQ5T7P3 118 aa6.08□□□□□ -1.44
CTDP1-208ENST00000613122 LCE1DQ5T752 114 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDP1-208ENST00000613122 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.04□□□□□ -1.44
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDP1-208ENST00000613122 RNF213Q63HN8 5207 aa5.96□□□□□ -1.46
CTDP1-208ENST00000613122 PRM1P04553 51 aa5.94□□□□□ -1.46
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.94□□□□□ -1.46
CTDP1-208ENST00000613122 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.94□□□□□ -1.46
CTDP1-208ENST00000613122 MT1AP04731 61 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.93□□□□□ -1.46
CTDP1-208ENST00000613122 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.81□□□□□ -1.48
CTDP1-208ENST00000613122 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CTDP1-208ENST00000613122 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDP1-208ENST00000613122 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDP1-208ENST00000613122 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.73□□□□□ -1.49
CTDP1-208ENST00000613122 MUC2Q02817 5179 aa5.72□□□□□ -1.49
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.66□□□□□ -1.5
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CTDP1-208ENST00000613122 LCE4AQ5TA78 99 aa5.58□□□□□ -1.52
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.53□□□□□ -1.52
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.48□□□□□ -1.53
CTDP1-208ENST00000613122 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.3□□□□□ -1.56
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.28□□□□□ -1.56
CTDP1-208ENST00000613122 LCE1CQ5T751 118 aa5.25□□□□□ -1.57
CTDP1-208ENST00000613122 LCE1EQ5T753 118 aa5.25□□□□□ -1.57
CTDP1-208ENST00000613122 LCE1FQ5T754 118 aa5.25□□□□□ -1.57
CTDP1-208ENST00000613122 USH2AO75445 5202 aa4.97□□□□□ -1.61
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.94□□□□□ -1.62
CTDP1-208ENST00000613122 NEBP20929 6669 aa4.88□□□□□ -1.63
CTDP1-208ENST00000613122 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CTDP1-208ENST00000613122 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP5-9P26371 169 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDP1-208ENST00000613122 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CTDP1-208ENST00000613122 KMT2DO14686 5537 aa4.77□□□□□ -1.65
CTDP1-208ENST00000613122 SSPOA2VEC9 5147 aa4.65□□□□□ -1.67
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.65□□□□□ -1.67
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.6□□□□□ -1.67
CTDP1-208ENST00000613122 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDP1-208ENST00000613122 MDN1Q9NU22 5596 aa4.52□□□□□ -1.69
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.38□□□□□ -1.71
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.3□□□□□ -1.72
CTDP1-208ENST00000613122 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.3□□□□□ -1.72
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.2□□□□□ -1.74
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.2□□□□□ -1.74
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.18□□□□□ -1.74
CTDP1-208ENST00000613122 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.18□□□□□ -1.74
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.79□□□□□ -1.8
CTDP1-208ENST00000613122 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.67□□□□□ -1.82
CTDP1-208ENST00000613122 MUC5ACP98088 5654 aa3.66□□□□□ -1.82
CTDP1-208ENST00000613122 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.51□□□□□ -1.85
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP5-8O75690 187 aa3.46□□□□□ -1.86
CTDP1-208ENST00000613122 PHGR1C9JFL3 82 aa3.24□□□□□ -1.89
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.21□□□□□ -1.89
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.17□□□□□ -1.9
CTDP1-208ENST00000613122 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.92
CTDP1-208ENST00000613122 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.96□□□□□ -1.94
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.87□□□□□ -1.95
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.72□□□□□ -1.97
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.6□□□□□ -1.99
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.36□□□□□ -2.03
CTDP1-208ENST00000613122 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.85□□□□□ -2.11
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