RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 MT1MQ8N339 61 aa5.57□□□□□ -1.52
PTDSS1-202ENST00000517309 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.49□□□□□ -1.53
PTDSS1-202ENST00000517309 RNF213Q63HN8 5207 aa5.49□□□□□ -1.53
PTDSS1-202ENST00000517309 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.46□□□□□ -1.54
PTDSS1-202ENST00000517309 MT3P25713 68 aa5.45□□□□□ -1.54
PTDSS1-202ENST00000517309 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.37□□□□□ -1.55
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PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.32□□□□□ -1.56
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.25□□□□□ -1.57
PTDSS1-202ENST00000517309 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.25□□□□□ -1.57
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PTDSS1-202ENST00000517309 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.24□□□□□ -1.57
PTDSS1-202ENST00000517309 MT1AP04731 61 aa5.2□□□□□ -1.58
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PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.11□□□□□ -1.59
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PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5□□□□□ -1.61
PTDSS1-202ENST00000517309 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
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PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.79□□□□□ -1.64
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PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.78□□□□□ -1.64
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PTDSS1-202ENST00000517309 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.28□□□□□ -1.88
PTDSS1-202ENST00000517309 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.2□□□□□ -1.9
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP5-8O75690 187 aa3.04□□□□□ -1.92
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.03□□□□□ -1.92
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PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.72□□□□□ -1.97
PTDSS1-202ENST00000517309 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
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PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.63□□□□□ -1.99
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.49□□□□□ -2.01
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.3□□□□□ -2.04
PTDSS1-202ENST00000517309 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.25□□□□□ -2.05
PTDSS1-202ENST00000517309 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.61□□□□□ -2.15
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