RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF213Q63HN8 5207 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRJ-201ENST00000418331 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRJ-201ENST00000418331 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRJ-201ENST00000418331 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.57□□□□□ -1.36
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PTPRJ-201ENST00000418331 MUC2Q02817 5179 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRJ-201ENST00000418331 MT1AP04731 61 aa6.29□□□□□ -1.4
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PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.17□□□□□ -1.42
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PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.02□□□□□ -1.45
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PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.96□□□□□ -1.46
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PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP5-9P26371 169 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRJ-201ENST00000418331 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.15□□□□□ -1.58
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PTPRJ-201ENST00000418331 MDN1Q9NU22 5596 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRJ-201ENST00000418331 LCE1FQ5T754 118 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRJ-201ENST00000418331 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRJ-201ENST00000418331 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP5-8O75690 187 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRJ-201ENST00000418331 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
PTPRJ-201ENST00000418331 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRJ-201ENST00000418331 PHGR1C9JFL3 82 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRJ-201ENST00000418331 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 210.9 ms