RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368226.8

PTPRK-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 6,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-207ENST00000368226 MUC17Q685J3 4493 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.75□□□□□ -2.13
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PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.44□□□□□ -2.18
PTPRK-207ENST00000368226 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.17□□□□□ -2.22
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 138.9 ms