RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 MT3P25713 68 aa6.29□□□□□ -1.4
CCSAP-203ENST00000366687 RNF213Q63HN8 5207 aa6.2□□□□□ -1.42
CCSAP-203ENST00000366687 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.2□□□□□ -1.42
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.18□□□□□ -1.42
CCSAP-203ENST00000366687 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CCSAP-203ENST00000366687 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.15□□□□□ -1.43
CCSAP-203ENST00000366687 TNXBP22105 4242 aa6.13□□□□□ -1.43
CCSAP-203ENST00000366687 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.13□□□□□ -1.43
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.12□□□□□ -1.43
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.12□□□□□ -1.43
CCSAP-203ENST00000366687 MT4P47944 62 aa6.1□□□□□ -1.43
CCSAP-203ENST00000366687 MUC2Q02817 5179 aa6.02□□□□□ -1.45
CCSAP-203ENST00000366687 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6□□□□□ -1.45
CCSAP-203ENST00000366687 PRM1P04553 51 aa5.99□□□□□ -1.45
CCSAP-203ENST00000366687 MT1AP04731 61 aa5.96□□□□□ -1.45
CCSAP-203ENST00000366687 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.92□□□□□ -1.46
CCSAP-203ENST00000366687 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.89□□□□□ -1.47
CCSAP-203ENST00000366687 LCE1DQ5T752 114 aa5.88□□□□□ -1.47
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.81□□□□□ -1.48
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.81□□□□□ -1.48
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.81□□□□□ -1.48
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.8□□□□□ -1.48
CCSAP-203ENST00000366687 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.74□□□□□ -1.49
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.7□□□□□ -1.5
CCSAP-203ENST00000366687 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.58□□□□□ -1.52
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.56□□□□□ -1.52
CCSAP-203ENST00000366687 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.56□□□□□ -1.52
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.54□□□□□ -1.52
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.54□□□□□ -1.52
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.53□□□□□ -1.52
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.46□□□□□ -1.54
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.44□□□□□ -1.54
CCSAP-203ENST00000366687 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
CCSAP-203ENST00000366687 USH2AO75445 5202 aa5.39□□□□□ -1.55
CCSAP-203ENST00000366687 LCE4AQ5TA78 99 aa5.39□□□□□ -1.55
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CCSAP-203ENST00000366687 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.28□□□□□ -1.56
CCSAP-203ENST00000366687 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
CCSAP-203ENST00000366687 KMT2DO14686 5537 aa5.04□□□□□ -1.6
CCSAP-203ENST00000366687 LCE1CQ5T751 118 aa4.96□□□□□ -1.62
CCSAP-203ENST00000366687 LCE1EQ5T753 118 aa4.96□□□□□ -1.62
CCSAP-203ENST00000366687 LCE1FQ5T754 118 aa4.96□□□□□ -1.62
CCSAP-203ENST00000366687 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.87□□□□□ -1.63
CCSAP-203ENST00000366687 MDN1Q9NU22 5596 aa4.81□□□□□ -1.64
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP5-9P26371 169 aa4.81□□□□□ -1.64
CCSAP-203ENST00000366687 NEBP20929 6669 aa4.76□□□□□ -1.65
CCSAP-203ENST00000366687 SSPOA2VEC9 5147 aa4.71□□□□□ -1.66
CCSAP-203ENST00000366687 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.69□□□□□ -1.66
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.65□□□□□ -1.67
CCSAP-203ENST00000366687 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.61□□□□□ -1.67
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.56□□□□□ -1.68
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.53□□□□□ -1.68
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.4□□□□□ -1.7
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.17□□□□□ -1.74
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.06□□□□□ -1.76
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.02□□□□□ -1.77
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.02□□□□□ -1.77
CCSAP-203ENST00000366687 MUC5ACP98088 5654 aa3.94□□□□□ -1.78
CCSAP-203ENST00000366687 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.87□□□□□ -1.79
CCSAP-203ENST00000366687 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.74□□□□□ -1.81
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.69□□□□□ -1.82
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP5-8O75690 187 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.31□□□□□ -1.88
CCSAP-203ENST00000366687 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-203ENST00000366687 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-203ENST00000366687 PHGR1C9JFL3 82 aa2.98□□□□□ -1.93
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.92□□□□□ -1.94
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.83□□□□□ -1.96
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.32□□□□□ -2.04
CCSAP-203ENST00000366687 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 1056.1 ms