RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.21□□□□□ -1.89
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.21□□□□□ -1.89
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.21□□□□□ -1.89
HDGFL3-201ENST00000299633 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.18□□□□□ -1.9
HDGFL3-201ENST00000299633 RYR2Q92736 4967 aa3.14□□□□□ -1.91
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.12□□□□□ -1.91
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HDGFL3-201ENST00000299633 HERC2O95714 4834 aa3.11□□□□□ -1.91
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HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.34□□□□□ -2.03
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HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP5-9P26371 169 aa2.24□□□□□ -2.05
HDGFL3-201ENST00000299633 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.24□□□□□ -2.05
HDGFL3-201ENST00000299633 USH2AO75445 5202 aa2.23□□□□□ -2.05
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HDGFL3-201ENST00000299633 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa1.77□□□□□ -2.13
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.73□□□□□ -2.13
HDGFL3-201ENST00000299633 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.73□□□□□ -2.13
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HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP5-8O75690 187 aa1.61□□□□□ -2.15
HDGFL3-201ENST00000299633 PHGR1C9JFL3 82 aa1.58□□□□□ -2.16
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.54□□□□□ -2.16
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.54□□□□□ -2.16
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.45□□□□□ -2.18
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.43□□□□□ -2.18
HDGFL3-201ENST00000299633 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.15□□□□□ -2.23
HDGFL3-201ENST00000299633 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.1□□□□□ -2.23
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