RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259351.9

RALGPS1-201, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 6,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-201ENST00000259351 TNXBP22105 4242 aa4.04□□□□□ -1.76
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RALGPS1-201ENST00000259351 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RALGPS1-201ENST00000259351 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.96□□□□□ -1.78
RALGPS1-201ENST00000259351 MUC2Q02817 5179 aa3.95□□□□□ -1.78
RALGPS1-201ENST00000259351 RNF213Q63HN8 5207 aa3.94□□□□□ -1.78
RALGPS1-201ENST00000259351 MT4P47944 62 aa3.94□□□□□ -1.78
RALGPS1-201ENST00000259351 PRM1P04553 51 aa3.91□□□□□ -1.78
RALGPS1-201ENST00000259351 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.91□□□□□ -1.78
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.91□□□□□ -1.78
RALGPS1-201ENST00000259351 MT3P25713 68 aa3.9□□□□□ -1.79
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.87□□□□□ -1.79
RALGPS1-201ENST00000259351 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.85□□□□□ -1.79
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.83□□□□□ -1.8
RALGPS1-201ENST00000259351 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.82□□□□□ -1.8
RALGPS1-201ENST00000259351 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.81□□□□□ -1.8
RALGPS1-201ENST00000259351 LCE1DQ5T752 114 aa3.79□□□□□ -1.8
RALGPS1-201ENST00000259351 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RALGPS1-201ENST00000259351 MT1AP04731 61 aa3.7□□□□□ -1.82
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RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.69□□□□□ -1.82
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.69□□□□□ -1.82
RALGPS1-201ENST00000259351 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
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RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.53□□□□□ -1.84
RALGPS1-201ENST00000259351 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.52□□□□□ -1.85
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.51□□□□□ -1.85
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RALGPS1-201ENST00000259351 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.41□□□□□ -1.86
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.4□□□□□ -1.86
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RALGPS1-201ENST00000259351 LCE4AQ5TA78 99 aa3.23□□□□□ -1.89
RALGPS1-201ENST00000259351 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.2□□□□□ -1.9
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.19□□□□□ -1.9
RALGPS1-201ENST00000259351 LCE1CQ5T751 118 aa3.19□□□□□ -1.9
RALGPS1-201ENST00000259351 LCE1EQ5T753 118 aa3.19□□□□□ -1.9
RALGPS1-201ENST00000259351 LCE1FQ5T754 118 aa3.19□□□□□ -1.9
RALGPS1-201ENST00000259351 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.17□□□□□ -1.9
RALGPS1-201ENST00000259351 SSPOA2VEC9 5147 aa3.1□□□□□ -1.91
RALGPS1-201ENST00000259351 MDN1Q9NU22 5596 aa3.08□□□□□ -1.92
RALGPS1-201ENST00000259351 NEBP20929 6669 aa3□□□□□ -1.93
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.95□□□□□ -1.94
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.93□□□□□ -1.94
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP5-9P26371 169 aa2.88□□□□□ -1.95
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.85□□□□□ -1.95
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RALGPS1-201ENST00000259351 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.77□□□□□ -1.97
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.75□□□□□ -1.97
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.67□□□□□ -1.98
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.67□□□□□ -1.98
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RALGPS1-201ENST00000259351 MUC5ACP98088 5654 aa2.59□□□□□ -1.99
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.51□□□□□ -2.01
RALGPS1-201ENST00000259351 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.49□□□□□ -2.01
RALGPS1-201ENST00000259351 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.28□□□□□ -2.04
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.25□□□□□ -2.05
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP5-8O75690 187 aa2.11□□□□□ -2.07
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.11□□□□□ -2.07
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.98□□□□□ -2.09
RALGPS1-201ENST00000259351 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
RALGPS1-201ENST00000259351 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
RALGPS1-201ENST00000259351 PHGR1C9JFL3 82 aa1.87□□□□□ -2.11
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.87□□□□□ -2.11
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.8□□□□□ -2.12
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.78□□□□□ -2.12
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.6□□□□□ -2.15
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.54□□□□□ -2.16
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.43□□□□□ -2.18
RALGPS1-201ENST00000259351 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.15□□□□□ -2.23
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