RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227451.3

DTX4-201, Transcript of deltex E3 ubiquitin ligase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DTX4, Length 5,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4-201ENST00000227451 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.56□□□□□ -1.36
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.5□□□□□ -1.37
DTX4-201ENST00000227451 MT3P25713 68 aa6.47□□□□□ -1.37
DTX4-201ENST00000227451 MT4P47944 62 aa6.47□□□□□ -1.37
DTX4-201ENST00000227451 RNF213Q63HN8 5207 aa6.32□□□□□ -1.4
DTX4-201ENST00000227451 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.31□□□□□ -1.4
DTX4-201ENST00000227451 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.26□□□□□ -1.41
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.25□□□□□ -1.41
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.21□□□□□ -1.41
DTX4-201ENST00000227451 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.17□□□□□ -1.42
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.16□□□□□ -1.42
DTX4-201ENST00000227451 MT1AP04731 61 aa6.14□□□□□ -1.43
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.1□□□□□ -1.43
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.1□□□□□ -1.43
DTX4-201ENST00000227451 LCE1DQ5T752 114 aa6.08□□□□□ -1.44
DTX4-201ENST00000227451 LCE1BQ5T7P3 118 aa6.07□□□□□ -1.44
DTX4-201ENST00000227451 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.07□□□□□ -1.44
DTX4-201ENST00000227451 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.06□□□□□ -1.44
DTX4-201ENST00000227451 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.96□□□□□ -1.45
DTX4-201ENST00000227451 PRM1P04553 51 aa5.96□□□□□ -1.46
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.95□□□□□ -1.46
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.95□□□□□ -1.46
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.9□□□□□ -1.47
DTX4-201ENST00000227451 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
DTX4-201ENST00000227451 MUC2Q02817 5179 aa5.81□□□□□ -1.48
DTX4-201ENST00000227451 LCE4AQ5TA78 99 aa5.8□□□□□ -1.48
DTX4-201ENST00000227451 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.77□□□□□ -1.49
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.74□□□□□ -1.49
DTX4-201ENST00000227451 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.7□□□□□ -1.5
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.68□□□□□ -1.5
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.67□□□□□ -1.5
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.64□□□□□ -1.51
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.48□□□□□ -1.53
DTX4-201ENST00000227451 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.35□□□□□ -1.55
DTX4-201ENST00000227451 LCE1CQ5T751 118 aa5.2□□□□□ -1.58
DTX4-201ENST00000227451 LCE1EQ5T753 118 aa5.2□□□□□ -1.58
DTX4-201ENST00000227451 LCE1FQ5T754 118 aa5.2□□□□□ -1.58
DTX4-201ENST00000227451 USH2AO75445 5202 aa5.2□□□□□ -1.58
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP5-9P26371 169 aa5.16□□□□□ -1.58
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.03□□□□□ -1.6
DTX4-201ENST00000227451 NEBP20929 6669 aa5.02□□□□□ -1.61
DTX4-201ENST00000227451 KMT2DO14686 5537 aa5□□□□□ -1.61
DTX4-201ENST00000227451 SSPOA2VEC9 5147 aa4.95□□□□□ -1.62
DTX4-201ENST00000227451 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
DTX4-201ENST00000227451 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.81□□□□□ -1.64
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.8□□□□□ -1.64
DTX4-201ENST00000227451 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.55□□□□□ -1.68
DTX4-201ENST00000227451 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.45□□□□□ -1.7
DTX4-201ENST00000227451 MDN1Q9NU22 5596 aa4.44□□□□□ -1.7
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.37□□□□□ -1.71
DTX4-201ENST00000227451 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.26□□□□□ -1.73
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.73
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.19□□□□□ -1.74
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.19□□□□□ -1.74
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.15□□□□□ -1.74
DTX4-201ENST00000227451 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.1□□□□□ -1.75
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.96□□□□□ -1.77
DTX4-201ENST00000227451 MUC5ACP98088 5654 aa3.7□□□□□ -1.82
DTX4-201ENST00000227451 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.7□□□□□ -1.82
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP5-8O75690 187 aa3.61□□□□□ -1.83
DTX4-201ENST00000227451 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.54□□□□□ -1.84
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.51□□□□□ -1.85
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.32□□□□□ -1.88
DTX4-201ENST00000227451 PHGR1C9JFL3 82 aa3.26□□□□□ -1.89
DTX4-201ENST00000227451 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.16□□□□□ -1.9
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.06□□□□□ -1.92
DTX4-201ENST00000227451 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.89□□□□□ -1.95
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.74□□□□□ -1.97
DTX4-201ENST00000227451 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.48□□□□□ -2.01
DTX4-201ENST00000227451 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms