RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000062829.8

Hoxa6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa6, Length 874 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Map1lc3bQ9CQV6 125 aa11.68□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Mrpl53Q9D1H8 118 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Aurkaip1Q9DCJ7 200 aa11.68□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cml3Q9JIY8 226 aa11.68□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Trdv5A0A075B661 115 aa11.67□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Pglyrp1O88593 182 aa11.67□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ly6gP35461 111 aa11.67□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr1431Q8VF59 312 aa11.67□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr968Q8VFN4 314 aa11.67□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Bcl7bQ921K9 202 aa11.67□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Lyzl1Q9CPX3 148 aa11.67□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm43720E0CXM8 267 aa11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Csn1s2bP02664 143 aa11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Mbd3l1Q9D9H3 186 aa11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Vsig2Q9Z109 328 aa11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Pkd1O08852 4293 aa11.66□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm5218F6YH22 154 aa11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 U90926O08546 118 aa11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 NdnP25233 325 aa11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Sox15P43267 231 aa11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ube2g2P60605 165 aa11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cphx2Q8BX39 182 aa11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Sft2d2Q8VD57 159 aa11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Prss29Q99MS4 279 aa11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 RhohQ9D3G9 191 aa11.65□□□□□ -0.54
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tcl1b4P56844 120 aa11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Immp2lQ8BPT6 175 aa11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gpha2Q925Q5 128 aa11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Srp19Q9D7A6 144 aa11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm15294V9GXA7 121 aa11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm28845A0A087WR76 214 aa11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Igkv4-61A0A0G2JH00 117 aa11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Trbv14A0A140T8L9 115 aa11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rhox7bA6PW38 321 aa11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm17669F6QL70 154 aa11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Saa3P04918 122 aa11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 P06328 117 aa11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rab5cP35278 216 aa11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rgs16P97428 201 aa11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Chchd5Q9CQP3 110 aa11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Card19Q9D1I2 183 aa11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ighv8-11A0A075B5X4 119 aa11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ighv1-23A0A0A6YVW3 117 aa11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 P84751 237 aa11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tex26Q0VB26 296 aa11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm94Q3V2D2 93 aa11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Hspe1Q64433 102 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ifi27Q8C6G0 260 aa11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Fmc1Q9CR13 113 aa11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gins1Q9CZ15 196 aa11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Shisal2bQ9D1Y9 158 aa11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ighv8-13A0A075B5Y0 101 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ighv6-4A0A0A6YX19 119 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 B230217C12RikE9Q3Z1 139 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm9887F6RFI0 207 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm21900J3QP38 180 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Lcn2P11672 200 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Evi2aP20934 223 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Sem1P60897 70 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ube2g1P62254 170 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Pfn1P62962 140 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr1380Q7TQT5 311 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr745Q7TRL9 328 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rasl10aQ8K5A4 203 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Vmn1r226Q8R2A8 298 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tmem128Q9CZB9 163 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ceacam11Q9D0Z8 303 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Zfp825A0A1Y7VK00 292 aa11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tmem18Q3TUD9 140 aa11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Htr1dQ61224 374 aa11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr1419Q7TQS2 343 aa11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Vmn1r70Q8R254 298 aa11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Fxyd4Q9D2W0 88 aa11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 SelenofQ9ERR7 162 aa11.6□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Stard9Q80TF6 4561 aa11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr1191-ps1A0A1L1STD5 311 aa11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rabl2E9Q9D5 223 aa11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Krtap10-4Q08EG8 221 aa11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ss18Q62280 418 aa11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 V1ra8Q9EQ48 279 aa11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tmprss5Q9ER04 455 aa11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ctnnbip1Q9JJN6 81 aa11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gpr132Q9Z282 382 aa11.59□□□□□ -0.55
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm45783A0A1B0GT48 74 aa11.58□□□□□ -0.56
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 4930447F04RikA2AFR2 126 aa11.58□□□□□ -0.56
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 H2al1jA2BFR3 109 aa11.58□□□□□ -0.56
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Csn2P10598 231 aa11.58□□□□□ -0.56
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Trpc5osQ3UHV4 110 aa11.58□□□□□ -0.56
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Q8C708 225 aa11.58□□□□□ -0.56
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Q9D7E4 109 aa11.58□□□□□ -0.56
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tspan13Q9D8C2 204 aa11.58□□□□□ -0.56
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tmem239Q9DA47 151 aa11.58□□□□□ -0.56
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Trav19A0A0B4J1K4 119 aa11.57□□□□□ -0.56
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm21915J3QPM7 133 aa11.57□□□□□ -0.56
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rab19P35294 217 aa11.57□□□□□ -0.56
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr963Q7TRA9 311 aa11.57□□□□□ -0.56
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Slc25a48Q8BW66 306 aa11.57□□□□□ -0.56
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Olfr1441Q8VFV3 318 aa11.57□□□□□ -0.56
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Arpc5lQ9D898 153 aa11.57□□□□□ -0.56
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 HampQ9EQ21 83 aa11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 107 ms