Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H3

Mbd3l1, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l1Q9D9H3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Mbd3l1Q9D9H3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Mbd3l1Q9D9H3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Mbd3l1Q9D9H3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Mbd3l1Q9D9H3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Mbd3l1Q9D9H3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Mbd3l1Q9D9H3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Mbd3l1Q9D9H3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Mbd3l1Q9D9H3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Mbd3l1Q9D9H3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Mbd3l1Q9D9H3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Mbd3l1Q9D9H3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Mbd3l1Q9D9H3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Mbd3l1Q9D9H3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Mbd3l1Q9D9H3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Mbd3l1Q9D9H3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Mbd3l1Q9D9H3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Mbd3l1Q9D9H3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Mbd3l1Q9D9H3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Mbd3l1Q9D9H3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Mbd3l1Q9D9H3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,25■■□□□ 1,79
Mbd3l1Q9D9H3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Mbd3l1Q9D9H3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Mbd3l1Q9D9H3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Mbd3l1Q9D9H3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Mbd3l1Q9D9H3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Mbd3l1Q9D9H3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Mbd3l1Q9D9H3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Mbd3l1Q9D9H3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Mbd3l1Q9D9H3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Mbd3l1Q9D9H3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Mbd3l1Q9D9H3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Mbd3l1Q9D9H3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Mbd3l1Q9D9H3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Mbd3l1Q9D9H3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
Mbd3l1Q9D9H3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Mbd3l1Q9D9H3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Mbd3l1Q9D9H3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
Mbd3l1Q9D9H3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Mbd3l1Q9D9H3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
Mbd3l1Q9D9H3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Mbd3l1Q9D9H3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Mbd3l1Q9D9H3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Mbd3l1Q9D9H3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Mbd3l1Q9D9H3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Mbd3l1Q9D9H3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Mbd3l1Q9D9H3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Mbd3l1Q9D9H3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Mbd3l1Q9D9H3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Mbd3l1Q9D9H3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Mbd3l1Q9D9H3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Mbd3l1Q9D9H3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Mbd3l1Q9D9H3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Mbd3l1Q9D9H3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Mbd3l1Q9D9H3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Mbd3l1Q9D9H3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Mbd3l1Q9D9H3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Mbd3l1Q9D9H3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Mbd3l1Q9D9H3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Mbd3l1Q9D9H3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Mbd3l1Q9D9H3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Mbd3l1Q9D9H3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Mbd3l1Q9D9H3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Mbd3l1Q9D9H3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Mbd3l1Q9D9H3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Mbd3l1Q9D9H3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,4■■□□□ 1,5
Mbd3l1Q9D9H3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Mbd3l1Q9D9H3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Mbd3l1Q9D9H3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Mbd3l1Q9D9H3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Mbd3l1Q9D9H3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,3■■□□□ 1,48
Mbd3l1Q9D9H3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Mbd3l1Q9D9H3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Mbd3l1Q9D9H3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Mbd3l1Q9D9H3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Mbd3l1Q9D9H3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Mbd3l1Q9D9H3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Mbd3l1Q9D9H3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Mbd3l1Q9D9H3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Mbd3l1Q9D9H3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Mbd3l1Q9D9H3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Mbd3l1Q9D9H3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,11■■□□□ 1,45
Mbd3l1Q9D9H3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,07■■□□□ 1,44
Mbd3l1Q9D9H3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Mbd3l1Q9D9H3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Mbd3l1Q9D9H3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Mbd3l1Q9D9H3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Mbd3l1Q9D9H3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Mbd3l1Q9D9H3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Mbd3l1Q9D9H3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23,97■■□□□ 1,43
Mbd3l1Q9D9H3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23,95■■□□□ 1,42
Mbd3l1Q9D9H3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Mbd3l1Q9D9H3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,93■■□□□ 1,42
Mbd3l1Q9D9H3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Mbd3l1Q9D9H3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Mbd3l1Q9D9H3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Mbd3l1Q9D9H3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Mbd3l1Q9D9H3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Mbd3l1Q9D9H3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Mbd3l1Q9D9H3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,8 ms