Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm5218F6YH22 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm5218F6YH22 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm5218F6YH22 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5218F6YH22 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm5218F6YH22 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm5218F6YH22 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5218F6YH22 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5218F6YH22 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm5218F6YH22 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5218F6YH22 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5218F6YH22 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5218F6YH22 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm5218F6YH22 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5218F6YH22 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5218F6YH22 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5218F6YH22 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5218F6YH22 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5218F6YH22 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5218F6YH22 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5218F6YH22 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5218F6YH22 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5218F6YH22 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5218F6YH22 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5218F6YH22 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5218F6YH22 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5218F6YH22 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5218F6YH22 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5218F6YH22 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5218F6YH22 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5218F6YH22 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5218F6YH22 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm5218F6YH22 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5218F6YH22 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5218F6YH22 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5218F6YH22 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5218F6YH22 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5218F6YH22 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5218F6YH22 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5218F6YH22 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5218F6YH22 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5218F6YH22 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5218F6YH22 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5218F6YH22 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5218F6YH22 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5218F6YH22 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5218F6YH22 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5218F6YH22 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5218F6YH22 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5218F6YH22 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5218F6YH22 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5218F6YH22 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5218F6YH22 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5218F6YH22 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5218F6YH22 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5218F6YH22 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5218F6YH22 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5218F6YH22 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5218F6YH22 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5218F6YH22 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5218F6YH22 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5218F6YH22 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5218F6YH22 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5218F6YH22 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5218F6YH22 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5218F6YH22 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5218F6YH22 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5218F6YH22 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5218F6YH22 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5218F6YH22 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5218F6YH22 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5218F6YH22 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5218F6YH22 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5218F6YH22 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5218F6YH22 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5218F6YH22 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5218F6YH22 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5218F6YH22 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5218F6YH22 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5218F6YH22 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5218F6YH22 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5218F6YH22 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5218F6YH22 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5218F6YH22 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5218F6YH22 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5218F6YH22 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5218F6YH22 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5218F6YH22 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5218F6YH22 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5218F6YH22 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm5218F6YH22 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm5218F6YH22 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5218F6YH22 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5218F6YH22 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5218F6YH22 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5218F6YH22 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm5218F6YH22 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5218F6YH22 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5218F6YH22 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5218F6YH22 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms