Protein–RNA interactions for Protein: P10598

Csn2, Beta-casein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn2P10598 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Csn2P10598 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Csn2P10598 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Csn2P10598 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Csn2P10598 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Csn2P10598 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Csn2P10598 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Csn2P10598 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csn2P10598 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csn2P10598 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csn2P10598 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csn2P10598 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csn2P10598 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csn2P10598 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csn2P10598 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csn2P10598 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csn2P10598 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csn2P10598 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csn2P10598 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Csn2P10598 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Csn2P10598 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csn2P10598 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Csn2P10598 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Csn2P10598 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Csn2P10598 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Csn2P10598 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csn2P10598 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csn2P10598 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csn2P10598 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csn2P10598 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Csn2P10598 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csn2P10598 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csn2P10598 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csn2P10598 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Csn2P10598 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csn2P10598 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csn2P10598 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csn2P10598 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csn2P10598 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Csn2P10598 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Csn2P10598 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Csn2P10598 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csn2P10598 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csn2P10598 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csn2P10598 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Csn2P10598 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csn2P10598 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Csn2P10598 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csn2P10598 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csn2P10598 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csn2P10598 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csn2P10598 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csn2P10598 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csn2P10598 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csn2P10598 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Csn2P10598 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csn2P10598 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csn2P10598 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csn2P10598 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csn2P10598 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csn2P10598 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csn2P10598 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csn2P10598 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csn2P10598 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csn2P10598 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csn2P10598 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csn2P10598 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csn2P10598 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csn2P10598 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csn2P10598 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csn2P10598 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Csn2P10598 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csn2P10598 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csn2P10598 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csn2P10598 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Csn2P10598 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csn2P10598 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csn2P10598 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csn2P10598 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csn2P10598 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Csn2P10598 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csn2P10598 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csn2P10598 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Csn2P10598 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Csn2P10598 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csn2P10598 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csn2P10598 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csn2P10598 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csn2P10598 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csn2P10598 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csn2P10598 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csn2P10598 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csn2P10598 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csn2P10598 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csn2P10598 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csn2P10598 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csn2P10598 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csn2P10598 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csn2P10598 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csn2P10598 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms