Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NdnP25233 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NdnP25233 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NdnP25233 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NdnP25233 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NdnP25233 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NdnP25233 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NdnP25233 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NdnP25233 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NdnP25233 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NdnP25233 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NdnP25233 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NdnP25233 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NdnP25233 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NdnP25233 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NdnP25233 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NdnP25233 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NdnP25233 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NdnP25233 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NdnP25233 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NdnP25233 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NdnP25233 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NdnP25233 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NdnP25233 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NdnP25233 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NdnP25233 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NdnP25233 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NdnP25233 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NdnP25233 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NdnP25233 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NdnP25233 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NdnP25233 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NdnP25233 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NdnP25233 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NdnP25233 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NdnP25233 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NdnP25233 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NdnP25233 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NdnP25233 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NdnP25233 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NdnP25233 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NdnP25233 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NdnP25233 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NdnP25233 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NdnP25233 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NdnP25233 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NdnP25233 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NdnP25233 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NdnP25233 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NdnP25233 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NdnP25233 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NdnP25233 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NdnP25233 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NdnP25233 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NdnP25233 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NdnP25233 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NdnP25233 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NdnP25233 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NdnP25233 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NdnP25233 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NdnP25233 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NdnP25233 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NdnP25233 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NdnP25233 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NdnP25233 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NdnP25233 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NdnP25233 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NdnP25233 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NdnP25233 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NdnP25233 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NdnP25233 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NdnP25233 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NdnP25233 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NdnP25233 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NdnP25233 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NdnP25233 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NdnP25233 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NdnP25233 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NdnP25233 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NdnP25233 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NdnP25233 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NdnP25233 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NdnP25233 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NdnP25233 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NdnP25233 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NdnP25233 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NdnP25233 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NdnP25233 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NdnP25233 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NdnP25233 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NdnP25233 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NdnP25233 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NdnP25233 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NdnP25233 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NdnP25233 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NdnP25233 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NdnP25233 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NdnP25233 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NdnP25233 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NdnP25233 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms