RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635861.1

CLN3-241, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,404 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-241ENST00000635861 H0Y9P7 68 aa9.18□□□□□ -0.94
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CLN3-241ENST00000635861 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa9.16□□□□□ -0.94
CLN3-241ENST00000635861 LINC00208Q96KT6 92 aa9.16□□□□□ -0.94
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CLN3-241ENST00000635861 MT1FP04733 61 aa9.11□□□□□ -0.95
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CLN3-241ENST00000635861 K7ERS5 55 aa8.05□□□□□ -1.12
CLN3-241ENST00000635861 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa8.02□□□□□ -1.13
CLN3-241ENST00000635861 A0A1B0GU33 70 aa8.01□□□□□ -1.13
CLN3-241ENST00000635861 H0YAA0 97 aa7.99□□□□□ -1.13
CLN3-241ENST00000635861 KMT2DO14686 5537 aa7.99□□□□□ -1.13
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CLN3-241ENST00000635861 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.86□□□□□ -1.15
CLN3-241ENST00000635861 PRAC1Q96KF2 57 aa7.81□□□□□ -1.16
CLN3-241ENST00000635861 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.8□□□□□ -1.16
CLN3-241ENST00000635861 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.77□□□□□ -1.17
CLN3-241ENST00000635861 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.77□□□□□ -1.17
CLN3-241ENST00000635861 PLAC4Q8WY50 150 aa7.74□□□□□ -1.17
CLN3-241ENST00000635861 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.74□□□□□ -1.17
CLN3-241ENST00000635861 MT1XP80297 61 aa7.73□□□□□ -1.17
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CLN3-241ENST00000635861 SPRR2AP35326 72 aa7.69□□□□□ -1.18
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CLN3-241ENST00000635861 R4GN34 69 aa7.68□□□□□ -1.18
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CLN3-241ENST00000635861 ROMO1P60602 79 aa7.62□□□□□ -1.19
CLN3-241ENST00000635861 P0C880 135 aa7.58□□□□□ -1.2
CLN3-241ENST00000635861 M0QZ58 72 aa7.57□□□□□ -1.2
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CLN3-241ENST00000635861 SPRR2DP22532 72 aa7.44□□□□□ -1.22
CLN3-241ENST00000635861 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.44□□□□□ -1.22
CLN3-241ENST00000635861 KRTAP10-12P60413 245 aa7.38□□□□□ -1.23
CLN3-241ENST00000635861 A0A0D9SG42 100 aa7.37□□□□□ -1.23
CLN3-241ENST00000635861 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CLN3-241ENST00000635861 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.33□□□□□ -1.24
CLN3-241ENST00000635861 LCE3BQ5TA77 95 aa7.26□□□□□ -1.25
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