RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635754.1

CLN6-211, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

Gene CLN6, Length 1,441 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-211ENST00000635754 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.51□□□□□ -1.21
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.51□□□□□ -1.21
CLN6-211ENST00000635754 MP68P56378 58 aa7.49□□□□□ -1.21
CLN6-211ENST00000635754 LINC00208Q96KT6 92 aa7.47□□□□□ -1.21
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.46□□□□□ -1.21
CLN6-211ENST00000635754 C5orf47Q569G3 176 aa7.45□□□□□ -1.22
CLN6-211ENST00000635754 MT2AP02795 61 aa7.44□□□□□ -1.22
CLN6-211ENST00000635754 S4R3F8 94 aa7.41□□□□□ -1.22
CLN6-211ENST00000635754 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.4□□□□□ -1.22
CLN6-211ENST00000635754 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.4□□□□□ -1.22
CLN6-211ENST00000635754 H3BPC8 53 aa7.4□□□□□ -1.22
CLN6-211ENST00000635754 MT1FP04733 61 aa7.38□□□□□ -1.23
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP10-10P60014 251 aa7.38□□□□□ -1.23
CLN6-211ENST00000635754 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.37□□□□□ -1.23
CLN6-211ENST00000635754 KLKP1Q107X0 134 aa7.36□□□□□ -1.23
CLN6-211ENST00000635754 LCA10Q71F78 164 aa7.35□□□□□ -1.23
CLN6-211ENST00000635754 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.35□□□□□ -1.23
CLN6-211ENST00000635754 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.34□□□□□ -1.23
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.34□□□□□ -1.23
CLN6-211ENST00000635754 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.33□□□□□ -1.24
CLN6-211ENST00000635754 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN6-211ENST00000635754 A8MUN3 132 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN6-211ENST00000635754 CSAG1Q6PB30 78 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa7.29□□□□□ -1.24
CLN6-211ENST00000635754 NDUFC1O43677 76 aa7.21□□□□□ -1.25
CLN6-211ENST00000635754 SERP2Q8N6R1 65 aa7.18□□□□□ -1.26
CLN6-211ENST00000635754 DMAC1Q96GE9 116 aa7.18□□□□□ -1.26
CLN6-211ENST00000635754 SNURFQ9Y675 71 aa7.15□□□□□ -1.27
CLN6-211ENST00000635754 C20orf197Q8N268 126 aa7.12□□□□□ -1.27
CLN6-211ENST00000635754 ACYP2P14621 99 aa7.07□□□□□ -1.28
CLN6-211ENST00000635754 H0YAA0 97 aa7.06□□□□□ -1.28
CLN6-211ENST00000635754 COX7CP15954 63 aa7.03□□□□□ -1.28
CLN6-211ENST00000635754 USH2AO75445 5202 aa7.03□□□□□ -1.28
CLN6-211ENST00000635754 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.02□□□□□ -1.29
CLN6-211ENST00000635754 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.01□□□□□ -1.29
CLN6-211ENST00000635754 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.99□□□□□ -1.29
CLN6-211ENST00000635754 CRIPTQ9P021 101 aa6.99□□□□□ -1.29
CLN6-211ENST00000635754 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.98□□□□□ -1.29
CLN6-211ENST00000635754 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.96□□□□□ -1.3
CLN6-211ENST00000635754 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.95□□□□□ -1.3
CLN6-211ENST00000635754 PCP4P48539 62 aa6.95□□□□□ -1.3
CLN6-211ENST00000635754 SSPOA2VEC9 5147 aa6.92□□□□□ -1.3
CLN6-211ENST00000635754 Q5VV11 94 aa6.9□□□□□ -1.31
CLN6-211ENST00000635754 CCDC179H3BU77 68 aa6.89□□□□□ -1.31
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.89□□□□□ -1.31
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.89□□□□□ -1.31
CLN6-211ENST00000635754 H7BZZ5 65 aa6.85□□□□□ -1.31
CLN6-211ENST00000635754 P0C880 135 aa6.85□□□□□ -1.31
CLN6-211ENST00000635754 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.85□□□□□ -1.31
CLN6-211ENST00000635754 MT1BP07438 61 aa6.84□□□□□ -1.31
CLN6-211ENST00000635754 R4GN34 69 aa6.82□□□□□ -1.32
CLN6-211ENST00000635754 COA5Q86WW8 74 aa6.81□□□□□ -1.32
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.77□□□□□ -1.33
CLN6-211ENST00000635754 M0QZ58 72 aa6.76□□□□□ -1.33
CLN6-211ENST00000635754 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CLN6-211ENST00000635754 A6NN06 94 aa6.69□□□□□ -1.34
CLN6-211ENST00000635754 LINC01554Q52M75 96 aa6.66□□□□□ -1.34
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP10-5P60370 271 aa6.65□□□□□ -1.35
CLN6-211ENST00000635754 PLAC4Q8WY50 150 aa6.65□□□□□ -1.35
CLN6-211ENST00000635754 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CLN6-211ENST00000635754 TMEM258P61165 79 aa6.64□□□□□ -1.35
CLN6-211ENST00000635754 SEC61GP60059 68 aa6.62□□□□□ -1.35
CLN6-211ENST00000635754 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.59□□□□□ -1.35
CLN6-211ENST00000635754 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.54□□□□□ -1.36
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.5□□□□□ -1.37
CLN6-211ENST00000635754 MT1XP80297 61 aa6.49□□□□□ -1.37
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.49□□□□□ -1.37
CLN6-211ENST00000635754 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLN6-211ENST00000635754 A0A1B0GU69 56 aa6.48□□□□□ -1.37
CLN6-211ENST00000635754 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CLN6-211ENST00000635754 A0A1B0GU33 70 aa6.45□□□□□ -1.38
CLN6-211ENST00000635754 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.4□□□□□ -1.39
CLN6-211ENST00000635754 PRR15LQ9BU68 103 aa6.38□□□□□ -1.39
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.36□□□□□ -1.39
CLN6-211ENST00000635754 A0A0D9SG42 100 aa6.35□□□□□ -1.39
CLN6-211ENST00000635754 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.33□□□□□ -1.4
CLN6-211ENST00000635754 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.33□□□□□ -1.4
CLN6-211ENST00000635754 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.32□□□□□ -1.4
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP12-2P59991 146 aa6.29□□□□□ -1.4
CLN6-211ENST00000635754 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.28□□□□□ -1.4
CLN6-211ENST00000635754 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.25□□□□□ -1.41
CLN6-211ENST00000635754 SVIPQ8NHG7 77 aa6.25□□□□□ -1.41
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP12-1P59990 96 aa6.23□□□□□ -1.41
CLN6-211ENST00000635754 A8MU10 97 aa6.2□□□□□ -1.42
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP5-9P26371 169 aa6.19□□□□□ -1.42
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP10-12P60413 245 aa6.16□□□□□ -1.42
CLN6-211ENST00000635754 Q1T7F1 81 aa6.16□□□□□ -1.42
CLN6-211ENST00000635754 V9GYY9 64 aa6.16□□□□□ -1.42
CLN6-211ENST00000635754 UQCR11O14957 56 aa6.16□□□□□ -1.42
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.16□□□□□ -1.42
CLN6-211ENST00000635754 NEBP20929 6669 aa6.15□□□□□ -1.42
CLN6-211ENST00000635754 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.08□□□□□ -1.44
CLN6-211ENST00000635754 KMT2DO14686 5537 aa6.07□□□□□ -1.44
CLN6-211ENST00000635754 PSPHP1O15172 72 aa6.07□□□□□ -1.44
CLN6-211ENST00000635754 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.03□□□□□ -1.44
CLN6-211ENST00000635754 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.03□□□□□ -1.44
CLN6-211ENST00000635754 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.98□□□□□ -1.45
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