RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 S4R3F8 94 aa5.58□□□□□ -1.52
GGA3-211ENST00000582232 LCA10Q71F78 164 aa5.56□□□□□ -1.52
GGA3-211ENST00000582232 ACYP2P14621 99 aa5.55□□□□□ -1.52
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
GGA3-211ENST00000582232 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.54□□□□□ -1.52
GGA3-211ENST00000582232 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
GGA3-211ENST00000582232 CSAG1Q6PB30 78 aa5.51□□□□□ -1.53
GGA3-211ENST00000582232 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.49□□□□□ -1.53
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.47□□□□□ -1.53
GGA3-211ENST00000582232 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.46□□□□□ -1.54
GGA3-211ENST00000582232 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
GGA3-211ENST00000582232 TMEM258P61165 79 aa5.44□□□□□ -1.54
GGA3-211ENST00000582232 PCP4P48539 62 aa5.43□□□□□ -1.54
GGA3-211ENST00000582232 MT2AP02795 61 aa5.42□□□□□ -1.54
GGA3-211ENST00000582232 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.41□□□□□ -1.54
GGA3-211ENST00000582232 COA5Q86WW8 74 aa5.41□□□□□ -1.54
GGA3-211ENST00000582232 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.41□□□□□ -1.54
GGA3-211ENST00000582232 H0YAA0 97 aa5.39□□□□□ -1.55
GGA3-211ENST00000582232 MT1FP04733 61 aa5.37□□□□□ -1.55
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP10-10P60014 251 aa5.34□□□□□ -1.55
GGA3-211ENST00000582232 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.29□□□□□ -1.56
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.29□□□□□ -1.56
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.27□□□□□ -1.57
GGA3-211ENST00000582232 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.27□□□□□ -1.57
GGA3-211ENST00000582232 CRIPTQ9P021 101 aa5.26□□□□□ -1.57
GGA3-211ENST00000582232 P0C880 135 aa5.23□□□□□ -1.57
GGA3-211ENST00000582232 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.21□□□□□ -1.58
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.2□□□□□ -1.58
GGA3-211ENST00000582232 LCE2BO14633 110 aa5.17□□□□□ -1.58
GGA3-211ENST00000582232 SEC61GP60059 68 aa5.17□□□□□ -1.58
GGA3-211ENST00000582232 SSPOA2VEC9 5147 aa5.15□□□□□ -1.58
GGA3-211ENST00000582232 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
GGA3-211ENST00000582232 USH2AO75445 5202 aa5.14□□□□□ -1.59
GGA3-211ENST00000582232 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.14□□□□□ -1.59
GGA3-211ENST00000582232 R4GN34 69 aa5.14□□□□□ -1.59
GGA3-211ENST00000582232 A0A1B0GU69 56 aa5.12□□□□□ -1.59
GGA3-211ENST00000582232 M0QZ58 72 aa5.11□□□□□ -1.59
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.11□□□□□ -1.59
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
GGA3-211ENST00000582232 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.09□□□□□ -1.59
GGA3-211ENST00000582232 PRR15LQ9BU68 103 aa5.09□□□□□ -1.59
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.08□□□□□ -1.6
GGA3-211ENST00000582232 V9GYY9 64 aa5.08□□□□□ -1.6
GGA3-211ENST00000582232 Q1T7F1 81 aa5.07□□□□□ -1.6
GGA3-211ENST00000582232 A0A1B0GU33 70 aa5.06□□□□□ -1.6
GGA3-211ENST00000582232 Q5VV11 94 aa5.06□□□□□ -1.6
GGA3-211ENST00000582232 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
GGA3-211ENST00000582232 MT1BP07438 61 aa5.04□□□□□ -1.6
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.03□□□□□ -1.6
GGA3-211ENST00000582232 A6NN06 94 aa4.99□□□□□ -1.61
GGA3-211ENST00000582232 LINC01554Q52M75 96 aa4.98□□□□□ -1.61
GGA3-211ENST00000582232 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.97□□□□□ -1.61
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.95□□□□□ -1.62
GGA3-211ENST00000582232 UQCR11O14957 56 aa4.94□□□□□ -1.62
GGA3-211ENST00000582232 PSPHP1O15172 72 aa4.94□□□□□ -1.62
GGA3-211ENST00000582232 PLAC4Q8WY50 150 aa4.94□□□□□ -1.62
GGA3-211ENST00000582232 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
GGA3-211ENST00000582232 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
GGA3-211ENST00000582232 A0A0D9SG42 100 aa4.88□□□□□ -1.63
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP10-5P60370 271 aa4.86□□□□□ -1.63
GGA3-211ENST00000582232 A8MU10 97 aa4.85□□□□□ -1.63
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP12-1P59990 96 aa4.84□□□□□ -1.63
GGA3-211ENST00000582232 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.84□□□□□ -1.63
GGA3-211ENST00000582232 MT1XP80297 61 aa4.81□□□□□ -1.64
GGA3-211ENST00000582232 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.81□□□□□ -1.64
GGA3-211ENST00000582232 A6NED7 52 aa4.8□□□□□ -1.64
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP12-2P59991 146 aa4.8□□□□□ -1.64
GGA3-211ENST00000582232 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.79□□□□□ -1.64
GGA3-211ENST00000582232 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.76□□□□□ -1.65
GGA3-211ENST00000582232 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.71□□□□□ -1.66
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.7□□□□□ -1.66
GGA3-211ENST00000582232 K7ERS5 55 aa4.68□□□□□ -1.66
GGA3-211ENST00000582232 NEBP20929 6669 aa4.65□□□□□ -1.67
GGA3-211ENST00000582232 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.61□□□□□ -1.67
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP10-12P60413 245 aa4.59□□□□□ -1.67
GGA3-211ENST00000582232 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.59□□□□□ -1.67
GGA3-211ENST00000582232 BRK1Q8WUW1 75 aa4.53□□□□□ -1.68
GGA3-211ENST00000582232 TNP1P09430 55 aa4.51□□□□□ -1.69
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.47□□□□□ -1.69
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.47□□□□□ -1.69
GGA3-211ENST00000582232 KMT2DO14686 5537 aa4.46□□□□□ -1.7
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.45□□□□□ -1.7
GGA3-211ENST00000582232 ROMO1P60602 79 aa4.44□□□□□ -1.7
GGA3-211ENST00000582232 MDN1Q9NU22 5596 aa4.43□□□□□ -1.7
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP5-9P26371 169 aa4.43□□□□□ -1.7
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.43□□□□□ -1.7
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.41□□□□□ -1.7
GGA3-211ENST00000582232 LCE3AQ5TA76 89 aa4.35□□□□□ -1.71
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.34□□□□□ -1.71
GGA3-211ENST00000582232 PRO0628Q9UI54 55 aa4.33□□□□□ -1.72
GGA3-211ENST00000582232 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.32□□□□□ -1.72
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.3□□□□□ -1.72
GGA3-211ENST00000582232 PMAIP1Q13794 54 aa4.29□□□□□ -1.72
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.27□□□□□ -1.73
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.26□□□□□ -1.73
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.26□□□□□ -1.73
GGA3-211ENST00000582232 MT1EP04732 61 aa4.24□□□□□ -1.73
GGA3-211ENST00000582232 PP632Q6XCG6 107 aa4.24□□□□□ -1.73
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