RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 Q5VV11 94 aa7□□□□□ -1.29
NME3-211ENST00000568561 PCP4P48539 62 aa6.98□□□□□ -1.29
NME3-211ENST00000568561 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.96□□□□□ -1.3
NME3-211ENST00000568561 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.96□□□□□ -1.3
NME3-211ENST00000568561 MDN1Q9NU22 5596 aa6.96□□□□□ -1.3
NME3-211ENST00000568561 KMT2DO14686 5537 aa6.96□□□□□ -1.3
NME3-211ENST00000568561 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.95□□□□□ -1.3
NME3-211ENST00000568561 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.95□□□□□ -1.3
NME3-211ENST00000568561 SERP2Q8N6R1 65 aa6.94□□□□□ -1.3
NME3-211ENST00000568561 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.94□□□□□ -1.3
NME3-211ENST00000568561 OCR1Q9BZK8 76 aa6.94□□□□□ -1.3
NME3-211ENST00000568561 S4R3F8 94 aa6.94□□□□□ -1.3
NME3-211ENST00000568561 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.93□□□□□ -1.3
NME3-211ENST00000568561 KRTAP10-5P60370 271 aa6.93□□□□□ -1.3
NME3-211ENST00000568561 UQCRQO14949 82 aa6.91□□□□□ -1.3
NME3-211ENST00000568561 COX7CP15954 63 aa6.9□□□□□ -1.3
NME3-211ENST00000568561 LCA10Q71F78 164 aa6.9□□□□□ -1.3
NME3-211ENST00000568561 CSAG1Q6PB30 78 aa6.89□□□□□ -1.31
NME3-211ENST00000568561 KRTAP5-9P26371 169 aa6.87□□□□□ -1.31
NME3-211ENST00000568561 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.87□□□□□ -1.31
NME3-211ENST00000568561 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.85□□□□□ -1.31
NME3-211ENST00000568561 KLKP1Q107X0 134 aa6.83□□□□□ -1.32
NME3-211ENST00000568561 H0Y9P7 68 aa6.81□□□□□ -1.32
NME3-211ENST00000568561 MP68P56378 58 aa6.81□□□□□ -1.32
NME3-211ENST00000568561 H3BPC8 53 aa6.79□□□□□ -1.32
NME3-211ENST00000568561 CCDC179H3BU77 68 aa6.78□□□□□ -1.32
NME3-211ENST00000568561 C20orf197Q8N268 126 aa6.77□□□□□ -1.33
NME3-211ENST00000568561 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.76□□□□□ -1.33
NME3-211ENST00000568561 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.76□□□□□ -1.33
NME3-211ENST00000568561 NDUFC1O43677 76 aa6.75□□□□□ -1.33
NME3-211ENST00000568561 LINC00208Q96KT6 92 aa6.74□□□□□ -1.33
NME3-211ENST00000568561 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.73□□□□□ -1.33
NME3-211ENST00000568561 SNURFQ9Y675 71 aa6.68□□□□□ -1.34
NME3-211ENST00000568561 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.66□□□□□ -1.34
NME3-211ENST00000568561 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.66□□□□□ -1.34
NME3-211ENST00000568561 CRIPTQ9P021 101 aa6.66□□□□□ -1.34
NME3-211ENST00000568561 TMEM258P61165 79 aa6.65□□□□□ -1.34
NME3-211ENST00000568561 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.64□□□□□ -1.35
NME3-211ENST00000568561 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
NME3-211ENST00000568561 H7BZZ5 65 aa6.61□□□□□ -1.35
NME3-211ENST00000568561 SPRR2EP22531 72 aa6.61□□□□□ -1.35
NME3-211ENST00000568561 SPRR2BP35325 72 aa6.61□□□□□ -1.35
NME3-211ENST00000568561 SPRR2AP35326 72 aa6.61□□□□□ -1.35
NME3-211ENST00000568561 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.57□□□□□ -1.36
NME3-211ENST00000568561 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.56□□□□□ -1.36
NME3-211ENST00000568561 MT1XP80297 61 aa6.54□□□□□ -1.36
NME3-211ENST00000568561 A8MUN3 132 aa6.5□□□□□ -1.37
NME3-211ENST00000568561 H0YAA0 97 aa6.5□□□□□ -1.37
NME3-211ENST00000568561 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.5□□□□□ -1.37
NME3-211ENST00000568561 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.5□□□□□ -1.37
NME3-211ENST00000568561 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.5□□□□□ -1.37
NME3-211ENST00000568561 DMAC1Q96GE9 116 aa6.48□□□□□ -1.37
NME3-211ENST00000568561 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.47□□□□□ -1.37
NME3-211ENST00000568561 PLAC4Q8WY50 150 aa6.43□□□□□ -1.38
NME3-211ENST00000568561 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.43□□□□□ -1.38
NME3-211ENST00000568561 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.43□□□□□ -1.38
NME3-211ENST00000568561 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.43□□□□□ -1.38
NME3-211ENST00000568561 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
NME3-211ENST00000568561 ACYP2P14621 99 aa6.4□□□□□ -1.38
NME3-211ENST00000568561 SPRR2DP22532 72 aa6.39□□□□□ -1.39
NME3-211ENST00000568561 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.38□□□□□ -1.39
NME3-211ENST00000568561 KRTAP12-2P59991 146 aa6.38□□□□□ -1.39
NME3-211ENST00000568561 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.38□□□□□ -1.39
NME3-211ENST00000568561 R4GN34 69 aa6.34□□□□□ -1.39
NME3-211ENST00000568561 P0C880 135 aa6.33□□□□□ -1.4
NME3-211ENST00000568561 COA5Q86WW8 74 aa6.31□□□□□ -1.4
NME3-211ENST00000568561 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.3□□□□□ -1.4
NME3-211ENST00000568561 M0QZ58 72 aa6.3□□□□□ -1.4
NME3-211ENST00000568561 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.27□□□□□ -1.41
NME3-211ENST00000568561 LINC01554Q52M75 96 aa6.26□□□□□ -1.41
NME3-211ENST00000568561 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
NME3-211ENST00000568561 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.25□□□□□ -1.41
NME3-211ENST00000568561 LCE3BQ5TA77 95 aa6.24□□□□□ -1.41
NME3-211ENST00000568561 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.22□□□□□ -1.41
NME3-211ENST00000568561 V9GYY9 64 aa6.21□□□□□ -1.42
NME3-211ENST00000568561 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.2□□□□□ -1.42
NME3-211ENST00000568561 KRTAP10-12P60413 245 aa6.17□□□□□ -1.42
NME3-211ENST00000568561 Q1T7F1 81 aa6.12□□□□□ -1.43
NME3-211ENST00000568561 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
NME3-211ENST00000568561 PRR15LQ9BU68 103 aa6.07□□□□□ -1.44
NME3-211ENST00000568561 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.07□□□□□ -1.44
NME3-211ENST00000568561 SEC61GP60059 68 aa6.05□□□□□ -1.44
NME3-211ENST00000568561 A0A1B0GU69 56 aa6.01□□□□□ -1.45
NME3-211ENST00000568561 PSPHP1O15172 72 aa5.96□□□□□ -1.46
NME3-211ENST00000568561 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.93□□□□□ -1.46
NME3-211ENST00000568561 A6NED7 52 aa5.86□□□□□ -1.47
NME3-211ENST00000568561 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.86□□□□□ -1.47
NME3-211ENST00000568561 UQCR11O14957 56 aa5.85□□□□□ -1.47
NME3-211ENST00000568561 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.85□□□□□ -1.47
NME3-211ENST00000568561 A0A1B0GU33 70 aa5.84□□□□□ -1.47
NME3-211ENST00000568561 MT1EP04732 61 aa5.81□□□□□ -1.48
NME3-211ENST00000568561 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.81□□□□□ -1.48
NME3-211ENST00000568561 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.81□□□□□ -1.48
NME3-211ENST00000568561 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.79□□□□□ -1.48
NME3-211ENST00000568561 BRK1Q8WUW1 75 aa5.76□□□□□ -1.49
NME3-211ENST00000568561 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.76□□□□□ -1.49
NME3-211ENST00000568561 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.75□□□□□ -1.49
NME3-211ENST00000568561 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.75□□□□□ -1.49
NME3-211ENST00000568561 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.74□□□□□ -1.49
NME3-211ENST00000568561 LCE1DQ5T752 114 aa5.72□□□□□ -1.49
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