RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
CCNDBP1-212ENST00000567690 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.64□□□□□ -1.83
CCNDBP1-212ENST00000567690 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.64□□□□□ -1.83
CCNDBP1-212ENST00000567690 LINC00313P59037 77 aa3.63□□□□□ -1.83
CCNDBP1-212ENST00000567690 PSPHP1O15172 72 aa3.62□□□□□ -1.83
CCNDBP1-212ENST00000567690 C8orf87E5RJ46 101 aa3.61□□□□□ -1.83
CCNDBP1-212ENST00000567690 COA5Q86WW8 74 aa3.61□□□□□ -1.83
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.61□□□□□ -1.83
CCNDBP1-212ENST00000567690 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.6□□□□□ -1.83
CCNDBP1-212ENST00000567690 A8MUN3 132 aa3.6□□□□□ -1.83
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CCNDBP1-212ENST00000567690 MT2AP02795 61 aa3.59□□□□□ -1.83
CCNDBP1-212ENST00000567690 HRES1P13985 223 aa3.59□□□□□ -1.83
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRR15LQ9BU68 103 aa3.59□□□□□ -1.83
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q5VV11 94 aa3.58□□□□□ -1.84
CCNDBP1-212ENST00000567690 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.58□□□□□ -1.84
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.57□□□□□ -1.84
CCNDBP1-212ENST00000567690 MT1FP04733 61 aa3.57□□□□□ -1.84
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP10-10P60014 251 aa3.55□□□□□ -1.84
CCNDBP1-212ENST00000567690 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.55□□□□□ -1.84
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q5W150 140 aa3.54□□□□□ -1.84
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.53□□□□□ -1.84
CCNDBP1-212ENST00000567690 USH2AO75445 5202 aa3.53□□□□□ -1.84
CCNDBP1-212ENST00000567690 A6NED7 52 aa3.52□□□□□ -1.85
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACYP2P14621 99 aa3.52□□□□□ -1.85
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPINK7P58062 85 aa3.52□□□□□ -1.85
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.51□□□□□ -1.85
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGKV2-30P06310 120 aa3.5□□□□□ -1.85
CCNDBP1-212ENST00000567690 PMAIP1Q13794 54 aa3.5□□□□□ -1.85
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.5□□□□□ -1.85
CCNDBP1-212ENST00000567690 DMAC1Q96GE9 116 aa3.5□□□□□ -1.85
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.49□□□□□ -1.85
CCNDBP1-212ENST00000567690 SSPOA2VEC9 5147 aa3.49□□□□□ -1.85
CCNDBP1-212ENST00000567690 LCA10Q71F78 164 aa3.48□□□□□ -1.85
CCNDBP1-212ENST00000567690 A8MU10 97 aa3.47□□□□□ -1.85
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.46□□□□□ -1.86
CCNDBP1-212ENST00000567690 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.43□□□□□ -1.86
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1B0GU69 56 aa3.42□□□□□ -1.86
CCNDBP1-212ENST00000567690 A6NN06 94 aa3.42□□□□□ -1.86
CCNDBP1-212ENST00000567690 H3BS24 57 aa3.42□□□□□ -1.86
CCNDBP1-212ENST00000567690 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.42□□□□□ -1.86
CCNDBP1-212ENST00000567690 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.42□□□□□ -1.86
CCNDBP1-212ENST00000567690 SEC61GP60059 68 aa3.39□□□□□ -1.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.39□□□□□ -1.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.39□□□□□ -1.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.37□□□□□ -1.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 UQCR11O14957 56 aa3.35□□□□□ -1.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.35□□□□□ -1.87
CCNDBP1-212ENST00000567690 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.29□□□□□ -1.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.29□□□□□ -1.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 S4R3F8 94 aa3.28□□□□□ -1.88
CCNDBP1-212ENST00000567690 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.27□□□□□ -1.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.26□□□□□ -1.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 MT1BP07438 61 aa3.24□□□□□ -1.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 CSAG1Q6PB30 78 aa3.24□□□□□ -1.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1B0GU33 70 aa3.23□□□□□ -1.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRAC1Q96KF2 57 aa3.23□□□□□ -1.89
CCNDBP1-212ENST00000567690 H0YAA0 97 aa3.21□□□□□ -1.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.21□□□□□ -1.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.2□□□□□ -1.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.2□□□□□ -1.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 K7ERS5 55 aa3.17□□□□□ -1.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP10-5P60370 271 aa3.17□□□□□ -1.9
CCNDBP1-212ENST00000567690 LINC01554Q52M75 96 aa3.15□□□□□ -1.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.1□□□□□ -1.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 CRIPTQ9P021 101 aa3.1□□□□□ -1.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.09□□□□□ -1.91
CCNDBP1-212ENST00000567690 NEBP20929 6669 aa3.09□□□□□ -1.92
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP5-9P26371 169 aa3.08□□□□□ -1.92
CCNDBP1-212ENST00000567690 ROMO1P60602 79 aa3.07□□□□□ -1.92
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.05□□□□□ -1.92
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A0D9SG42 100 aa3.04□□□□□ -1.92
CCNDBP1-212ENST00000567690 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.03□□□□□ -1.92
CCNDBP1-212ENST00000567690 P0C880 135 aa3.03□□□□□ -1.92
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.03□□□□□ -1.92
CCNDBP1-212ENST00000567690 KMT2DO14686 5537 aa3.03□□□□□ -1.92
CCNDBP1-212ENST00000567690 MT1XP80297 61 aa3.02□□□□□ -1.93
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLAC4Q8WY50 150 aa3.01□□□□□ -1.93
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.01□□□□□ -1.93
CCNDBP1-212ENST00000567690 M0QZ58 72 aa3□□□□□ -1.93
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPRR2EP22531 72 aa3□□□□□ -1.93
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPRR2BP35325 72 aa3□□□□□ -1.93
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPRR2AP35326 72 aa3□□□□□ -1.93
CCNDBP1-212ENST00000567690 R4GN34 69 aa3□□□□□ -1.93
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.98□□□□□ -1.93
CCNDBP1-212ENST00000567690 MDN1Q9NU22 5596 aa2.98□□□□□ -1.93
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP12-2P59991 146 aa2.97□□□□□ -1.93
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.96□□□□□ -1.94
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP12-1P59990 96 aa2.96□□□□□ -1.94
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.96□□□□□ -1.94
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.96□□□□□ -1.94
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa2.93□□□□□ -1.94
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa2.93□□□□□ -1.94
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP23-1A1A580 65 aa2.92□□□□□ -1.94
CCNDBP1-212ENST00000567690 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.92□□□□□ -1.94
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