RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF213Q63HN8 5207 aa8.64□□□□□ -1.03
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.64□□□□□ -1.03
USP3-AS1-201ENST00000558831 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.57□□□□□ -1.04
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
USP3-AS1-201ENST00000558831 S4R3F8 94 aa8.56□□□□□ -1.04
USP3-AS1-201ENST00000558831 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 LCA10Q71F78 164 aa8.51□□□□□ -1.05
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USP3-AS1-201ENST00000558831 SMIM26A0A096LP01 95 aa8.42□□□□□ -1.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 CSAG1Q6PB30 78 aa8.38□□□□□ -1.07
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USP3-AS1-201ENST00000558831 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.35□□□□□ -1.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 M0R2T5 61 aa8.33□□□□□ -1.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 V9GYY9 64 aa8.28□□□□□ -1.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 Q1T7F1 81 aa8.27□□□□□ -1.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.27□□□□□ -1.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 SEC61GP60059 68 aa8.24□□□□□ -1.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A1B0GU69 56 aa8.23□□□□□ -1.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRR15LQ9BU68 103 aa8.21□□□□□ -1.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 PSPHP1O15172 72 aa8.19□□□□□ -1.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.16□□□□□ -1.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 H0YAA0 97 aa8.12□□□□□ -1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 P0C880 135 aa8.07□□□□□ -1.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 Q5VV11 94 aa8.07□□□□□ -1.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A1B0GU33 70 aa8.01□□□□□ -1.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8□□□□□ -1.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.97□□□□□ -1.13
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USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.97□□□□□ -1.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 A6NED7 52 aa7.94□□□□□ -1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 UQCR11O14957 56 aa7.94□□□□□ -1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP10-10P60014 251 aa7.94□□□□□ -1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 MT1FP04733 61 aa7.91□□□□□ -1.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 R4GN34 69 aa7.89□□□□□ -1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 M0QZ58 72 aa7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.85□□□□□ -1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.84□□□□□ -1.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 CRIPTQ9P021 101 aa7.83□□□□□ -1.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 LINC01554Q52M75 96 aa7.77□□□□□ -1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A0D9SG42 100 aa7.76□□□□□ -1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 BRK1Q8WUW1 75 aa7.76□□□□□ -1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 A8MU10 97 aa7.75□□□□□ -1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.74□□□□□ -1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.74□□□□□ -1.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.69□□□□□ -1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.67□□□□□ -1.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.6□□□□□ -1.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 K7ERS5 55 aa7.54□□□□□ -1.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP12-1P59990 96 aa7.54□□□□□ -1.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP12-2P59991 146 aa7.54□□□□□ -1.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.54□□□□□ -1.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 A6NN06 94 aa7.52□□□□□ -1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.51□□□□□ -1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLAC4Q8WY50 150 aa7.48□□□□□ -1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRO0628Q9UI54 55 aa7.47□□□□□ -1.21
USP3-AS1-201ENST00000558831 MT1BP07438 61 aa7.42□□□□□ -1.22
USP3-AS1-201ENST00000558831 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.4□□□□□ -1.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 PMAIP1Q13794 54 aa7.33□□□□□ -1.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 USH2AO75445 5202 aa7.31□□□□□ -1.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.18□□□□□ -1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 ROMO1P60602 79 aa7.18□□□□□ -1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.18□□□□□ -1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.17□□□□□ -1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.16□□□□□ -1.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.15□□□□□ -1.27
USP3-AS1-201ENST00000558831 MT1XP80297 61 aa7.14□□□□□ -1.27
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP10-5P60370 271 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-AS1-201ENST00000558831 SSPOA2VEC9 5147 aa7.1□□□□□ -1.27
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.08□□□□□ -1.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 LCE3BQ5TA77 95 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNP1P09430 55 aa6.99□□□□□ -1.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.95□□□□□ -1.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.94□□□□□ -1.3
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USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRAC1Q96KF2 57 aa6.87□□□□□ -1.31
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.85□□□□□ -1.31
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.85□□□□□ -1.31
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP10-12P60413 245 aa6.77□□□□□ -1.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.73□□□□□ -1.33
USP3-AS1-201ENST00000558831 LCE3AQ5TA76 89 aa6.7□□□□□ -1.34
USP3-AS1-201ENST00000558831 PP632Q6XCG6 107 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-AS1-201ENST00000558831 SVIPQ8NHG7 77 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-201ENST00000558831 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-201ENST00000558831 LCE1DQ5T752 114 aa6.57□□□□□ -1.36
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.56□□□□□ -1.36
USP3-AS1-201ENST00000558831 KMT2DO14686 5537 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-AS1-201ENST00000558831 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
USP3-AS1-201ENST00000558831 H3BS24 57 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.46□□□□□ -1.37
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