RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552915.5

CNOT2-241, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

TSL 5

Gene CNOT2, Length 1,071 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2-241ENST00000552915 C5orf47Q569G3 176 aa6.38□□□□□ -1.39
CNOT2-241ENST00000552915 MUC17Q685J3 4493 aa6.36□□□□□ -1.39
CNOT2-241ENST00000552915 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.36□□□□□ -1.39
CNOT2-241ENST00000552915 COX7CP15954 63 aa6.35□□□□□ -1.39
CNOT2-241ENST00000552915 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.35□□□□□ -1.39
CNOT2-241ENST00000552915 C20orf197Q8N268 126 aa6.35□□□□□ -1.39
CNOT2-241ENST00000552915 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.34□□□□□ -1.39
CNOT2-241ENST00000552915 SPINK7P58062 85 aa6.34□□□□□ -1.39
CNOT2-241ENST00000552915 SNURFQ9Y675 71 aa6.34□□□□□ -1.39
CNOT2-241ENST00000552915 H3BPC8 53 aa6.31□□□□□ -1.4
CNOT2-241ENST00000552915 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.3□□□□□ -1.4
CNOT2-241ENST00000552915 A0A0U1RQV1 116 aa6.29□□□□□ -1.4
CNOT2-241ENST00000552915 CCDC179H3BU77 68 aa6.28□□□□□ -1.4
CNOT2-241ENST00000552915 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.28□□□□□ -1.4
CNOT2-241ENST00000552915 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.28□□□□□ -1.4
CNOT2-241ENST00000552915 KLKP1Q107X0 134 aa6.26□□□□□ -1.41
CNOT2-241ENST00000552915 HRES1P13985 223 aa6.23□□□□□ -1.41
CNOT2-241ENST00000552915 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.22□□□□□ -1.41
CNOT2-241ENST00000552915 FAM236CP0DP71 79 aa6.22□□□□□ -1.41
CNOT2-241ENST00000552915 C4orf26Q17RF5 130 aa6.22□□□□□ -1.41
CNOT2-241ENST00000552915 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.22□□□□□ -1.41
CNOT2-241ENST00000552915 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.21□□□□□ -1.42
CNOT2-241ENST00000552915 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.2□□□□□ -1.42
CNOT2-241ENST00000552915 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.17□□□□□ -1.42
CNOT2-241ENST00000552915 MUC2Q02817 5179 aa6.16□□□□□ -1.42
CNOT2-241ENST00000552915 NDUFC1O43677 76 aa6.14□□□□□ -1.43
CNOT2-241ENST00000552915 H7BZZ5 65 aa6.13□□□□□ -1.43
CNOT2-241ENST00000552915 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.07□□□□□ -1.44
CNOT2-241ENST00000552915 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.05□□□□□ -1.44
CNOT2-241ENST00000552915 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.05□□□□□ -1.44
CNOT2-241ENST00000552915 DMAC1Q96GE9 116 aa6.05□□□□□ -1.44
CNOT2-241ENST00000552915 A8MUN3 132 aa6.04□□□□□ -1.44
CNOT2-241ENST00000552915 TMEM258P61165 79 aa6.03□□□□□ -1.44
CNOT2-241ENST00000552915 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.03□□□□□ -1.44
CNOT2-241ENST00000552915 ACYP2P14621 99 aa6.02□□□□□ -1.45
CNOT2-241ENST00000552915 S4R3F8 94 aa6.02□□□□□ -1.45
CNOT2-241ENST00000552915 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CNOT2-241ENST00000552915 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.99□□□□□ -1.45
CNOT2-241ENST00000552915 MT3P25713 68 aa5.96□□□□□ -1.46
CNOT2-241ENST00000552915 M0R2T5 61 aa5.95□□□□□ -1.46
CNOT2-241ENST00000552915 LCA10Q71F78 164 aa5.95□□□□□ -1.46
CNOT2-241ENST00000552915 COA5Q86WW8 74 aa5.95□□□□□ -1.46
CNOT2-241ENST00000552915 MT1HP80294 61 aa5.92□□□□□ -1.46
CNOT2-241ENST00000552915 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CNOT2-241ENST00000552915 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.87□□□□□ -1.47
CNOT2-241ENST00000552915 CSAG1Q6PB30 78 aa5.85□□□□□ -1.47
CNOT2-241ENST00000552915 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CNOT2-241ENST00000552915 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.84□□□□□ -1.47
CNOT2-241ENST00000552915 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.83□□□□□ -1.48
CNOT2-241ENST00000552915 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
CNOT2-241ENST00000552915 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.72□□□□□ -1.49
CNOT2-241ENST00000552915 SEC61GP60059 68 aa5.68□□□□□ -1.5
CNOT2-241ENST00000552915 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CNOT2-241ENST00000552915 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.66□□□□□ -1.5
CNOT2-241ENST00000552915 A0A1B0GU69 56 aa5.65□□□□□ -1.5
CNOT2-241ENST00000552915 MT2AP02795 61 aa5.65□□□□□ -1.5
CNOT2-241ENST00000552915 H0YAA0 97 aa5.64□□□□□ -1.51
CNOT2-241ENST00000552915 KRTAP10-10P60014 251 aa5.64□□□□□ -1.51
CNOT2-241ENST00000552915 MT1FP04733 61 aa5.62□□□□□ -1.51
CNOT2-241ENST00000552915 P0C880 135 aa5.62□□□□□ -1.51
CNOT2-241ENST00000552915 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.62□□□□□ -1.51
CNOT2-241ENST00000552915 PRR15LQ9BU68 103 aa5.62□□□□□ -1.51
CNOT2-241ENST00000552915 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.62□□□□□ -1.51
CNOT2-241ENST00000552915 LCE1FQ5T754 118 aa5.59□□□□□ -1.51
CNOT2-241ENST00000552915 V9GYY9 64 aa5.59□□□□□ -1.51
CNOT2-241ENST00000552915 LCE1EQ5T753 118 aa5.58□□□□□ -1.52
CNOT2-241ENST00000552915 PSPHP1O15172 72 aa5.56□□□□□ -1.52
CNOT2-241ENST00000552915 Q1T7F1 81 aa5.56□□□□□ -1.52
CNOT2-241ENST00000552915 M0QZ58 72 aa5.53□□□□□ -1.52
CNOT2-241ENST00000552915 R4GN34 69 aa5.53□□□□□ -1.52
CNOT2-241ENST00000552915 A0A1B0GU33 70 aa5.51□□□□□ -1.53
CNOT2-241ENST00000552915 PRAC1Q96KF2 57 aa5.51□□□□□ -1.53
CNOT2-241ENST00000552915 CRIPTQ9P021 101 aa5.48□□□□□ -1.53
CNOT2-241ENST00000552915 LINC01554Q52M75 96 aa5.47□□□□□ -1.53
CNOT2-241ENST00000552915 Q5VV11 94 aa5.46□□□□□ -1.54
CNOT2-241ENST00000552915 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.46□□□□□ -1.54
CNOT2-241ENST00000552915 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.44□□□□□ -1.54
CNOT2-241ENST00000552915 KRTAP10-12P60413 245 aa5.43□□□□□ -1.54
CNOT2-241ENST00000552915 UQCR11O14957 56 aa5.42□□□□□ -1.54
CNOT2-241ENST00000552915 A0A0D9SG42 100 aa5.41□□□□□ -1.54
CNOT2-241ENST00000552915 A6NED7 52 aa5.4□□□□□ -1.54
CNOT2-241ENST00000552915 KRTAP10-5P60370 271 aa5.4□□□□□ -1.54
CNOT2-241ENST00000552915 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.39□□□□□ -1.55
CNOT2-241ENST00000552915 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CNOT2-241ENST00000552915 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CNOT2-241ENST00000552915 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.36□□□□□ -1.55
CNOT2-241ENST00000552915 A8MU10 97 aa5.35□□□□□ -1.55
CNOT2-241ENST00000552915 NDUFAF8A1L188 74 aa5.31□□□□□ -1.56
CNOT2-241ENST00000552915 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
CNOT2-241ENST00000552915 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.3□□□□□ -1.56
CNOT2-241ENST00000552915 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.29□□□□□ -1.56
CNOT2-241ENST00000552915 PLAC4Q8WY50 150 aa5.28□□□□□ -1.56
CNOT2-241ENST00000552915 MT1BP07438 61 aa5.25□□□□□ -1.57
CNOT2-241ENST00000552915 SSPOA2VEC9 5147 aa5.25□□□□□ -1.57
CNOT2-241ENST00000552915 USH2AO75445 5202 aa5.25□□□□□ -1.57
CNOT2-241ENST00000552915 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.23□□□□□ -1.57
CNOT2-241ENST00000552915 KRTAP12-1P59990 96 aa5.22□□□□□ -1.57
CNOT2-241ENST00000552915 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.22□□□□□ -1.57
CNOT2-241ENST00000552915 A6NN06 94 aa5.21□□□□□ -1.58
CNOT2-241ENST00000552915 KRTAP12-2P59991 146 aa5.21□□□□□ -1.58
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