RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540931.1

CLSTN3-210, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CLSTN3, Length 910 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-210ENST00000540931 DMAC1Q96GE9 116 aa8.42□□□□□ -1.06
CLSTN3-210ENST00000540931 NDUFC1O43677 76 aa8.41□□□□□ -1.06
CLSTN3-210ENST00000540931 LCA10Q71F78 164 aa8.41□□□□□ -1.06
CLSTN3-210ENST00000540931 SNURFQ9Y675 71 aa8.41□□□□□ -1.06
CLSTN3-210ENST00000540931 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.4□□□□□ -1.06
CLSTN3-210ENST00000540931 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.4□□□□□ -1.06
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CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-210ENST00000540931 SSPOA2VEC9 5147 aa8.29□□□□□ -1.08
CLSTN3-210ENST00000540931 MT2AP02795 61 aa8.29□□□□□ -1.08
CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP10-10P60014 251 aa8.29□□□□□ -1.08
CLSTN3-210ENST00000540931 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.29□□□□□ -1.08
CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.28□□□□□ -1.08
CLSTN3-210ENST00000540931 USH2AO75445 5202 aa8.25□□□□□ -1.09
CLSTN3-210ENST00000540931 H0YAA0 97 aa8.23□□□□□ -1.09
CLSTN3-210ENST00000540931 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.22□□□□□ -1.09
CLSTN3-210ENST00000540931 MT1FP04733 61 aa8.2□□□□□ -1.1
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CLSTN3-210ENST00000540931 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.1□□□□□ -1.11
CLSTN3-210ENST00000540931 CCDC179H3BU77 68 aa8.09□□□□□ -1.11
CLSTN3-210ENST00000540931 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.06□□□□□ -1.12
CLSTN3-210ENST00000540931 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-210ENST00000540931 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.05□□□□□ -1.12
CLSTN3-210ENST00000540931 COA5Q86WW8 74 aa8.04□□□□□ -1.12
CLSTN3-210ENST00000540931 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.03□□□□□ -1.12
CLSTN3-210ENST00000540931 LCE2BO14633 110 aa8.02□□□□□ -1.13
CLSTN3-210ENST00000540931 TMEM258P61165 79 aa7.99□□□□□ -1.13
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CLSTN3-210ENST00000540931 SEC61GP60059 68 aa7.91□□□□□ -1.14
CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.9□□□□□ -1.14
CLSTN3-210ENST00000540931 R4GN34 69 aa7.88□□□□□ -1.15
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CLSTN3-210ENST00000540931 P0C880 135 aa7.83□□□□□ -1.16
CLSTN3-210ENST00000540931 Q5VV11 94 aa7.82□□□□□ -1.16
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CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.8□□□□□ -1.16
CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.8□□□□□ -1.16
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CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.74□□□□□ -1.17
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CLSTN3-210ENST00000540931 PRR15LQ9BU68 103 aa7.7□□□□□ -1.18
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CLSTN3-210ENST00000540931 MT1BP07438 61 aa7.65□□□□□ -1.18
CLSTN3-210ENST00000540931 NEBP20929 6669 aa7.62□□□□□ -1.19
CLSTN3-210ENST00000540931 A0A1B0GU33 70 aa7.61□□□□□ -1.19
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CLSTN3-210ENST00000540931 A6NN06 94 aa7.59□□□□□ -1.19
CLSTN3-210ENST00000540931 V9GYY9 64 aa7.58□□□□□ -1.2
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CLSTN3-210ENST00000540931 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.44□□□□□ -1.22
CLSTN3-210ENST00000540931 Q1T7F1 81 aa7.43□□□□□ -1.22
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CLSTN3-210ENST00000540931 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.4□□□□□ -1.22
CLSTN3-210ENST00000540931 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.39□□□□□ -1.23
CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.36□□□□□ -1.23
CLSTN3-210ENST00000540931 A0A0D9SG42 100 aa7.34□□□□□ -1.23
CLSTN3-210ENST00000540931 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-210ENST00000540931 MT1XP80297 61 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-210ENST00000540931 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-210ENST00000540931 PSPHP1O15172 72 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP12-1P59990 96 aa7.22□□□□□ -1.25
CLSTN3-210ENST00000540931 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.21□□□□□ -1.26
CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP5-9P26371 169 aa7.19□□□□□ -1.26
CLSTN3-210ENST00000540931 A8MU10 97 aa7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP12-2P59991 146 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-210ENST00000540931 K7ERS5 55 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-210ENST00000540931 KMT2DO14686 5537 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-210ENST00000540931 A6NED7 52 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-210ENST00000540931 MDN1Q9NU22 5596 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP10-12P60413 245 aa6.99□□□□□ -1.29
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CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-210ENST00000540931 TNP1P09430 55 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-210ENST00000540931 SPRR2EP22531 72 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-210ENST00000540931 SPRR2BP35325 72 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-210ENST00000540931 SPRR2AP35326 72 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-210ENST00000540931 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-210ENST00000540931 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.81□□□□□ -1.32
CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.81□□□□□ -1.32
CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.74□□□□□ -1.33
CLSTN3-210ENST00000540931 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-210ENST00000540931 SPRR2DP22532 72 aa6.61□□□□□ -1.35
CLSTN3-210ENST00000540931 ROMO1P60602 79 aa6.61□□□□□ -1.35
CLSTN3-210ENST00000540931 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-210ENST00000540931 BRK1Q8WUW1 75 aa6.58□□□□□ -1.36
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