RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 ACYP2P14621 99 aa4.44□□□□□ -1.7
PDE4D-208ENST00000502484 HERC1Q15751 4861 aa4.42□□□□□ -1.7
PDE4D-208ENST00000502484 Q75L30 129 aa4.42□□□□□ -1.7
PDE4D-208ENST00000502484 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.4□□□□□ -1.71
PDE4D-208ENST00000502484 PSPHP1O15172 72 aa4.38□□□□□ -1.71
PDE4D-208ENST00000502484 A8MUN3 132 aa4.37□□□□□ -1.71
PDE4D-208ENST00000502484 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.36□□□□□ -1.71
PDE4D-208ENST00000502484 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.36□□□□□ -1.71
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.35□□□□□ -1.71
PDE4D-208ENST00000502484 SPINK7P58062 85 aa4.35□□□□□ -1.71
PDE4D-208ENST00000502484 Q5VV11 94 aa4.35□□□□□ -1.71
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.35□□□□□ -1.71
PDE4D-208ENST00000502484 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
PDE4D-208ENST00000502484 PRR15LQ9BU68 103 aa4.34□□□□□ -1.71
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.34□□□□□ -1.71
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.34□□□□□ -1.71
PDE4D-208ENST00000502484 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.33□□□□□ -1.72
PDE4D-208ENST00000502484 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.3□□□□□ -1.72
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.3□□□□□ -1.72
PDE4D-208ENST00000502484 TPRXLQ17RH7 258 aa4.29□□□□□ -1.72
PDE4D-208ENST00000502484 LRP2P98164 4655 aa4.27□□□□□ -1.73
PDE4D-208ENST00000502484 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.27□□□□□ -1.73
PDE4D-208ENST00000502484 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.26□□□□□ -1.73
PDE4D-208ENST00000502484 A0A0A0MQY5 61 aa4.26□□□□□ -1.73
PDE4D-208ENST00000502484 LPAP08519 4548 aa4.25□□□□□ -1.73
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1B0GU69 56 aa4.24□□□□□ -1.73
PDE4D-208ENST00000502484 A6NED7 52 aa4.23□□□□□ -1.73
PDE4D-208ENST00000502484 LCE1DQ5T752 114 aa4.23□□□□□ -1.73
PDE4D-208ENST00000502484 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.23□□□□□ -1.73
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.22□□□□□ -1.73
PDE4D-208ENST00000502484 LCA10Q71F78 164 aa4.21□□□□□ -1.74
PDE4D-208ENST00000502484 A8MU10 97 aa4.2□□□□□ -1.74
PDE4D-208ENST00000502484 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.2□□□□□ -1.74
PDE4D-208ENST00000502484 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.16□□□□□ -1.74
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.15□□□□□ -1.74
PDE4D-208ENST00000502484 UQCR11O14957 56 aa4.15□□□□□ -1.75
PDE4D-208ENST00000502484 MUC17Q685J3 4493 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-208ENST00000502484 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-208ENST00000502484 S4R3F8 94 aa4.13□□□□□ -1.75
PDE4D-208ENST00000502484 A6NN06 94 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-208ENST00000502484 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-208ENST00000502484 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.12□□□□□ -1.75
PDE4D-208ENST00000502484 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.11□□□□□ -1.75
PDE4D-208ENST00000502484 MUC2Q02817 5179 aa4.09□□□□□ -1.75
PDE4D-208ENST00000502484 RNF213Q63HN8 5207 aa4.09□□□□□ -1.75
PDE4D-208ENST00000502484 LINC01554Q52M75 96 aa4.09□□□□□ -1.76
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1B0GU33 70 aa4.06□□□□□ -1.76
PDE4D-208ENST00000502484 H0YAA0 97 aa4.04□□□□□ -1.76
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.04□□□□□ -1.76
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PDE4D-208ENST00000502484 CSAG1Q6PB30 78 aa4.01□□□□□ -1.77
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.99□□□□□ -1.77
PDE4D-208ENST00000502484 PRAC1Q96KF2 57 aa3.98□□□□□ -1.77
PDE4D-208ENST00000502484 P0C880 135 aa3.97□□□□□ -1.77
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.97□□□□□ -1.77
PDE4D-208ENST00000502484 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.96□□□□□ -1.78
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.94□□□□□ -1.78
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.94□□□□□ -1.78
PDE4D-208ENST00000502484 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
PDE4D-208ENST00000502484 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.89□□□□□ -1.79
PDE4D-208ENST00000502484 K7ERS5 55 aa3.88□□□□□ -1.79
PDE4D-208ENST00000502484 M0QZ58 72 aa3.87□□□□□ -1.79
PDE4D-208ENST00000502484 A0A0D9SG42 100 aa3.86□□□□□ -1.79
PDE4D-208ENST00000502484 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.85□□□□□ -1.79
PDE4D-208ENST00000502484 MT1HP80294 61 aa3.82□□□□□ -1.8
PDE4D-208ENST00000502484 R4GN34 69 aa3.81□□□□□ -1.8
PDE4D-208ENST00000502484 M0R2T5 61 aa3.8□□□□□ -1.8
PDE4D-208ENST00000502484 LCE4AQ5TA78 99 aa3.8□□□□□ -1.8
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP12-1P59990 96 aa3.8□□□□□ -1.8
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP12-2P59991 146 aa3.8□□□□□ -1.8
PDE4D-208ENST00000502484 ROMO1P60602 79 aa3.8□□□□□ -1.8
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.79□□□□□ -1.8
PDE4D-208ENST00000502484 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.77□□□□□ -1.81
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-208ENST00000502484 CRIPTQ9P021 101 aa3.71□□□□□ -1.81
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.69□□□□□ -1.82
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-208ENST00000502484 LUZP6Q538Z0 58 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-208ENST00000502484 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-208ENST00000502484 MT2AP02795 61 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP10-10P60014 251 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-208ENST00000502484 MT1FP04733 61 aa3.59□□□□□ -1.84
PDE4D-208ENST00000502484 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.59□□□□□ -1.84
PDE4D-208ENST00000502484 NDUFAF8A1L188 74 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-208ENST00000502484 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-208ENST00000502484 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-208ENST00000502484 PLAC4Q8WY50 150 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-208ENST00000502484 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-208ENST00000502484 MT1BP07438 61 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-208ENST00000502484 TNP1P09430 55 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-208ENST00000502484 PP632Q6XCG6 107 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-208ENST00000502484 USH2AO75445 5202 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP10-5P60370 271 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-208ENST00000502484 MT1XP80297 61 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-208ENST00000502484 SSPOA2VEC9 5147 aa3.32□□□□□ -1.88
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