RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 H3BPC8 53 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRD-210ENST00000481079 S4R3F8 94 aa11.11□□□□□ -0.63
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PTPRD-210ENST00000481079 SMIM20Q8N5G0 67 aa11.08□□□□□ -0.64
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PTPRD-210ENST00000481079 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRD-210ENST00000481079 LCA10Q71F78 164 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRD-210ENST00000481079 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRD-210ENST00000481079 TRAV7A0A075B6U4 112 aa11□□□□□ -0.65
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PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
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PTPRD-210ENST00000481079 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.93□□□□□ -0.98
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PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-210ENST00000481079 A6NED7 52 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-210ENST00000481079 TNP1P09430 55 aa8.82□□□□□ -1
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