RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP2-202ENST00000435136 A6NED7 52 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-202ENST00000435136 LPAP08519 4548 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A1B0GU69 56 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-202ENST00000435136 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-202ENST00000435136 LCA10Q71F78 164 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-202ENST00000435136 SEC61GP60059 68 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP2-202ENST00000435136 A8MU10 97 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-202ENST00000435136 RNF213Q63HN8 5207 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-202ENST00000435136 UQCR11O14957 56 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP2-202ENST00000435136 SPATA8Q6RVD6 105 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP2-202ENST00000435136 MIR22HGQ0VDD5 57 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP2-202ENST00000435136 S4R3F8 94 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP2-202ENST00000435136 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP2-202ENST00000435136 MUC2Q02817 5179 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP2-202ENST00000435136 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-202ENST00000435136 PMAIP1Q13794 54 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-202ENST00000435136 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP2-202ENST00000435136 A6NN06 94 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A1B0GU33 70 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-202ENST00000435136 H0YAA0 97 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-202ENST00000435136 MUC17Q685J3 4493 aa9.21□□□□□ -0.93
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BP2-202ENST00000435136 CSAG1Q6PB30 78 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP2-202ENST00000435136 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP2-202ENST00000435136 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-202ENST00000435136 FAT4Q6V0I7 4981 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-202ENST00000435136 P0C880 135 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-202ENST00000435136 K7ERS5 55 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP2-202ENST00000435136 M0QZ58 72 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 LCE2CQ5TA81 110 aa8.82□□□□□ -1
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A0D9SG42 100 aa8.8□□□□□ -1
SH3BP2-202ENST00000435136 PRAC1Q96KF2 57 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP2-202ENST00000435136 R4GN34 69 aa8.69□□□□□ -1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP12-1P59990 96 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 MT1HP80294 61 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 ROMO1P60602 79 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP12-2P59991 146 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-202ENST00000435136 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-202ENST00000435136 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-202ENST00000435136 CRIPTQ9P021 101 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP2-202ENST00000435136 M0R2T5 61 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP2-202ENST00000435136 LINC01554Q52M75 96 aa8.48□□□□□ -1.05
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.46□□□□□ -1.05
SH3BP2-202ENST00000435136 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-202ENST00000435136 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.24□□□□□ -1.09
SH3BP2-202ENST00000435136 FSIP2Q5CZC0 6907 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP2-202ENST00000435136 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.18□□□□□ -1.1
SH3BP2-202ENST00000435136 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.18□□□□□ -1.1
SH3BP2-202ENST00000435136 MT2AP02795 61 aa8.15□□□□□ -1.1
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP2-202ENST00000435136 MT1FP04733 61 aa8.11□□□□□ -1.11
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP10-10P60014 251 aa8.08□□□□□ -1.12
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.07□□□□□ -1.12
SH3BP2-202ENST00000435136 PLAC4Q8WY50 150 aa8.03□□□□□ -1.12
SH3BP2-202ENST00000435136 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.98□□□□□ -1.13
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.97□□□□□ -1.13
SH3BP2-202ENST00000435136 PP632Q6XCG6 107 aa7.94□□□□□ -1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 USH2AO75445 5202 aa7.92□□□□□ -1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 LCE2BO14633 110 aa7.92□□□□□ -1.14
SH3BP2-202ENST00000435136 TNP1P09430 55 aa7.89□□□□□ -1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP2-202ENST00000435136 SSPOA2VEC9 5147 aa7.82□□□□□ -1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 MT1BP07438 61 aa7.78□□□□□ -1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.63□□□□□ -1.19
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP10-5P60370 271 aa7.62□□□□□ -1.19
SH3BP2-202ENST00000435136 MT1XP80297 61 aa7.62□□□□□ -1.19
SH3BP2-202ENST00000435136 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP2-202ENST00000435136 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SH3BP2-202ENST00000435136 LCE3AQ5TA76 89 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.38□□□□□ -1.23
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP10-12P60413 245 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2-202ENST00000435136 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2-202ENST00000435136 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2-202ENST00000435136 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.19□□□□□ -1.26
SH3BP2-202ENST00000435136 NDUFAF8A1L188 74 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP12-3P60328 96 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP2-202ENST00000435136 LUZP6Q538Z0 58 aa7.1□□□□□ -1.27
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7□□□□□ -1.29
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 KMT2DO14686 5537 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 H3BS24 57 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms