RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa9.17□□□□□ -0.94
LTB-210ENST00000429299 C1orf64Q8NEQ6 169 aa9.17□□□□□ -0.94
LTB-210ENST00000429299 LINC00208Q96KT6 92 aa9.14□□□□□ -0.95
LTB-210ENST00000429299 MUC12Q9UKN1 5478 aa9.14□□□□□ -0.95
LTB-210ENST00000429299 SMIM20Q8N5G0 67 aa9.13□□□□□ -0.95
LTB-210ENST00000429299 H3BPC8 53 aa9.12□□□□□ -0.95
LTB-210ENST00000429299 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa9.11□□□□□ -0.95
LTB-210ENST00000429299 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.11□□□□□ -0.95
LTB-210ENST00000429299 TRAV7A0A075B6U4 112 aa9.04□□□□□ -0.96
LTB-210ENST00000429299 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa9.04□□□□□ -0.96
LTB-210ENST00000429299 S4R3F8 94 aa9□□□□□ -0.97
LTB-210ENST00000429299 A6NN06 94 aa8.99□□□□□ -0.97
LTB-210ENST00000429299 KLKP1Q107X0 134 aa8.98□□□□□ -0.97
LTB-210ENST00000429299 A8MUN3 132 aa8.96□□□□□ -0.98
LTB-210ENST00000429299 CSAG1Q6PB30 78 aa8.92□□□□□ -0.98
LTB-210ENST00000429299 KRTAP5-9P26371 169 aa8.9□□□□□ -0.98
LTB-210ENST00000429299 LCA10Q71F78 164 aa8.89□□□□□ -0.99
LTB-210ENST00000429299 SERP2Q8N6R1 65 aa8.88□□□□□ -0.99
LTB-210ENST00000429299 KMT2DO14686 5537 aa8.85□□□□□ -0.99
LTB-210ENST00000429299 NDUFC1O43677 76 aa8.82□□□□□ -1
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LTB-210ENST00000429299 Q5VV11 94 aa8.8□□□□□ -1
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LTB-210ENST00000429299 C20orf197Q8N268 126 aa8.78□□□□□ -1
LTB-210ENST00000429299 SNURFQ9Y675 71 aa8.78□□□□□ -1
LTB-210ENST00000429299 DMAC1Q96GE9 116 aa8.77□□□□□ -1.01
LTB-210ENST00000429299 KRTAP10-5P60370 271 aa8.76□□□□□ -1.01
LTB-210ENST00000429299 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.76□□□□□ -1.01
LTB-210ENST00000429299 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.73□□□□□ -1.01
LTB-210ENST00000429299 ACYP2P14621 99 aa8.71□□□□□ -1.02
LTB-210ENST00000429299 COX7CP15954 63 aa8.71□□□□□ -1.02
LTB-210ENST00000429299 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.69□□□□□ -1.02
LTB-210ENST00000429299 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.65□□□□□ -1.02
LTB-210ENST00000429299 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.62□□□□□ -1.03
LTB-210ENST00000429299 H0YAA0 97 aa8.59□□□□□ -1.03
LTB-210ENST00000429299 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.58□□□□□ -1.04
LTB-210ENST00000429299 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.57□□□□□ -1.04
LTB-210ENST00000429299 CRIPTQ9P021 101 aa8.52□□□□□ -1.05
LTB-210ENST00000429299 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.5□□□□□ -1.05
LTB-210ENST00000429299 SPRR2EP22531 72 aa8.49□□□□□ -1.05
LTB-210ENST00000429299 SPRR2BP35325 72 aa8.49□□□□□ -1.05
LTB-210ENST00000429299 SPRR2AP35326 72 aa8.49□□□□□ -1.05
LTB-210ENST00000429299 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa8.48□□□□□ -1.05
LTB-210ENST00000429299 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa8.48□□□□□ -1.05
LTB-210ENST00000429299 SPRR2FQ96RM1 72 aa8.47□□□□□ -1.05
LTB-210ENST00000429299 H7BZZ5 65 aa8.44□□□□□ -1.06
LTB-210ENST00000429299 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.39□□□□□ -1.07
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LTB-210ENST00000429299 COA5Q86WW8 74 aa8.36□□□□□ -1.07
LTB-210ENST00000429299 LCE1AQ5T7P2 110 aa8.31□□□□□ -1.08
LTB-210ENST00000429299 P0C880 135 aa8.3□□□□□ -1.08
LTB-210ENST00000429299 R4GN34 69 aa8.3□□□□□ -1.08
LTB-210ENST00000429299 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.28□□□□□ -1.08
LTB-210ENST00000429299 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
LTB-210ENST00000429299 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa8.24□□□□□ -1.09
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LTB-210ENST00000429299 SPRR2DP22532 72 aa8.22□□□□□ -1.09
LTB-210ENST00000429299 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.22□□□□□ -1.09
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LTB-210ENST00000429299 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.15□□□□□ -1.1
LTB-210ENST00000429299 MT1XP80297 61 aa8.12□□□□□ -1.11
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LTB-210ENST00000429299 LINC01554Q52M75 96 aa8.08□□□□□ -1.12
LTB-210ENST00000429299 KRTAP12-2P59991 146 aa8.07□□□□□ -1.12
LTB-210ENST00000429299 LCE3BQ5TA77 95 aa8.05□□□□□ -1.12
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LTB-210ENST00000429299 A0A1B0GU69 56 aa7.98□□□□□ -1.13
LTB-210ENST00000429299 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.97□□□□□ -1.13
LTB-210ENST00000429299 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.97□□□□□ -1.13
LTB-210ENST00000429299 A0A1B0GU33 70 aa7.94□□□□□ -1.14
LTB-210ENST00000429299 PRR15LQ9BU68 103 aa7.92□□□□□ -1.14
LTB-210ENST00000429299 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.87□□□□□ -1.15
LTB-210ENST00000429299 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.84□□□□□ -1.15
LTB-210ENST00000429299 PCP4P48539 62 aa7.83□□□□□ -1.16
LTB-210ENST00000429299 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.8□□□□□ -1.16
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LTB-210ENST00000429299 A0A0D9SG42 100 aa7.76□□□□□ -1.17
LTB-210ENST00000429299 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.75□□□□□ -1.17
LTB-210ENST00000429299 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
LTB-210ENST00000429299 KRTAP10-12P60413 245 aa7.72□□□□□ -1.17
LTB-210ENST00000429299 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.71□□□□□ -1.18
LTB-210ENST00000429299 V9GYY9 64 aa7.7□□□□□ -1.18
LTB-210ENST00000429299 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.67□□□□□ -1.18
LTB-210ENST00000429299 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.65□□□□□ -1.18
LTB-210ENST00000429299 UQCR11O14957 56 aa7.62□□□□□ -1.19
LTB-210ENST00000429299 Q1T7F1 81 aa7.6□□□□□ -1.19
LTB-210ENST00000429299 KRTAP12-1P59990 96 aa7.58□□□□□ -1.2
LTB-210ENST00000429299 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
LTB-210ENST00000429299 A8MU10 97 aa7.57□□□□□ -1.2
LTB-210ENST00000429299 PSPHP1O15172 72 aa7.51□□□□□ -1.21
LTB-210ENST00000429299 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.46□□□□□ -1.22
LTB-210ENST00000429299 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.43□□□□□ -1.22
LTB-210ENST00000429299 LCE1DQ5T752 114 aa7.4□□□□□ -1.22
LTB-210ENST00000429299 K7ERS5 55 aa7.34□□□□□ -1.23
LTB-210ENST00000429299 A6NED7 52 aa7.32□□□□□ -1.24
LTB-210ENST00000429299 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.32□□□□□ -1.24
LTB-210ENST00000429299 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.29□□□□□ -1.24
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