RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429260.6

C9orf116-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 116, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf116, Length 678 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116-205ENST00000429260 C4orf26Q17RF5 130 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf116-205ENST00000429260 OCR1Q9BZK8 76 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf116-205ENST00000429260 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf116-205ENST00000429260 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.4□□□□□ -1.22
C9orf116-205ENST00000429260 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
C9orf116-205ENST00000429260 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.39□□□□□ -1.23
C9orf116-205ENST00000429260 MP68P56378 58 aa7.38□□□□□ -1.23
C9orf116-205ENST00000429260 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.38□□□□□ -1.23
C9orf116-205ENST00000429260 C5orf47Q569G3 176 aa7.37□□□□□ -1.23
C9orf116-205ENST00000429260 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf116-205ENST00000429260 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf116-205ENST00000429260 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf116-205ENST00000429260 LINC00208Q96KT6 92 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf116-205ENST00000429260 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.31□□□□□ -1.24
C9orf116-205ENST00000429260 H3BPC8 53 aa7.3□□□□□ -1.24
C9orf116-205ENST00000429260 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.27□□□□□ -1.25
C9orf116-205ENST00000429260 KLKP1Q107X0 134 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf116-205ENST00000429260 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf116-205ENST00000429260 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf116-205ENST00000429260 S4R3F8 94 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf116-205ENST00000429260 A8MUN3 132 aa7.15□□□□□ -1.26
C9orf116-205ENST00000429260 LCA10Q71F78 164 aa7.15□□□□□ -1.26
C9orf116-205ENST00000429260 SERP2Q8N6R1 65 aa7.15□□□□□ -1.26
C9orf116-205ENST00000429260 MT2AP02795 61 aa7.14□□□□□ -1.27
C9orf116-205ENST00000429260 KRTAP10-10P60014 251 aa7.12□□□□□ -1.27
C9orf116-205ENST00000429260 CSAG1Q6PB30 78 aa7.12□□□□□ -1.27
C9orf116-205ENST00000429260 MT1FP04733 61 aa7.09□□□□□ -1.27
C9orf116-205ENST00000429260 SNURFQ9Y675 71 aa7.09□□□□□ -1.27
C9orf116-205ENST00000429260 C20orf197Q8N268 126 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf116-205ENST00000429260 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf116-205ENST00000429260 NDUFC1O43677 76 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf116-205ENST00000429260 DMAC1Q96GE9 116 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf116-205ENST00000429260 COX7CP15954 63 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf116-205ENST00000429260 ACYP2P14621 99 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf116-205ENST00000429260 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf116-205ENST00000429260 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf116-205ENST00000429260 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf116-205ENST00000429260 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf116-205ENST00000429260 H0YAA0 97 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf116-205ENST00000429260 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.84□□□□□ -1.31
C9orf116-205ENST00000429260 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.84□□□□□ -1.31
C9orf116-205ENST00000429260 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.83□□□□□ -1.32
C9orf116-205ENST00000429260 H7BZZ5 65 aa6.82□□□□□ -1.32
C9orf116-205ENST00000429260 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.82□□□□□ -1.32
C9orf116-205ENST00000429260 USH2AO75445 5202 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf116-205ENST00000429260 CCDC179H3BU77 68 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf116-205ENST00000429260 CRIPTQ9P021 101 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf116-205ENST00000429260 COA5Q86WW8 74 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf116-205ENST00000429260 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf116-205ENST00000429260 P0C880 135 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf116-205ENST00000429260 SSPOA2VEC9 5147 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf116-205ENST00000429260 Q5VV11 94 aa6.65□□□□□ -1.34
C9orf116-205ENST00000429260 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf116-205ENST00000429260 R4GN34 69 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf116-205ENST00000429260 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
C9orf116-205ENST00000429260 M0QZ58 72 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf116-205ENST00000429260 MT1BP07438 61 aa6.59□□□□□ -1.35
C9orf116-205ENST00000429260 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.58□□□□□ -1.36
C9orf116-205ENST00000429260 TMEM258P61165 79 aa6.55□□□□□ -1.36
C9orf116-205ENST00000429260 SEC61GP60059 68 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf116-205ENST00000429260 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf116-205ENST00000429260 LINC01554Q52M75 96 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf116-205ENST00000429260 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
C9orf116-205ENST00000429260 PLAC4Q8WY50 150 aa6.46□□□□□ -1.38
C9orf116-205ENST00000429260 A6NN06 94 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf116-205ENST00000429260 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf116-205ENST00000429260 A0A1B0GU69 56 aa6.4□□□□□ -1.38
C9orf116-205ENST00000429260 KRTAP10-5P60370 271 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf116-205ENST00000429260 A0A1B0GU33 70 aa6.37□□□□□ -1.39
C9orf116-205ENST00000429260 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.37□□□□□ -1.39
C9orf116-205ENST00000429260 PRR15LQ9BU68 103 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf116-205ENST00000429260 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf116-205ENST00000429260 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf116-205ENST00000429260 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.29□□□□□ -1.4
C9orf116-205ENST00000429260 A0A0D9SG42 100 aa6.26□□□□□ -1.41
C9orf116-205ENST00000429260 MT1XP80297 61 aa6.26□□□□□ -1.41
C9orf116-205ENST00000429260 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
C9orf116-205ENST00000429260 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf116-205ENST00000429260 PRAC1Q96KF2 57 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf116-205ENST00000429260 V9GYY9 64 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf116-205ENST00000429260 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf116-205ENST00000429260 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf116-205ENST00000429260 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
C9orf116-205ENST00000429260 A8MU10 97 aa6.12□□□□□ -1.43
C9orf116-205ENST00000429260 UQCR11O14957 56 aa6.11□□□□□ -1.43
C9orf116-205ENST00000429260 Q1T7F1 81 aa6.11□□□□□ -1.43
C9orf116-205ENST00000429260 KRTAP12-1P59990 96 aa6.1□□□□□ -1.43
C9orf116-205ENST00000429260 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
C9orf116-205ENST00000429260 KRTAP12-2P59991 146 aa6.07□□□□□ -1.44
C9orf116-205ENST00000429260 PSPHP1O15172 72 aa6.06□□□□□ -1.44
C9orf116-205ENST00000429260 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.05□□□□□ -1.44
C9orf116-205ENST00000429260 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6□□□□□ -1.45
C9orf116-205ENST00000429260 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
C9orf116-205ENST00000429260 MT3P25713 68 aa5.97□□□□□ -1.45
C9orf116-205ENST00000429260 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.97□□□□□ -1.45
C9orf116-205ENST00000429260 KRTAP10-12P60413 245 aa5.95□□□□□ -1.46
C9orf116-205ENST00000429260 KMT2DO14686 5537 aa5.92□□□□□ -1.46
C9orf116-205ENST00000429260 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.91□□□□□ -1.46
C9orf116-205ENST00000429260 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.91□□□□□ -1.46
C9orf116-205ENST00000429260 A6NED7 52 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.8 ms