RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-202ENST00000379615 CSAG1Q6PB30 78 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-202ENST00000379615 A8MUN3 132 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-202ENST00000379615 LCA10Q71F78 164 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-202ENST00000379615 KLKP1Q107X0 134 aa7.26□□□□□ -1.25
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-202ENST00000379615 SSPOA2VEC9 5147 aa7.2□□□□□ -1.26
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFC1O43677 76 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-202ENST00000379615 USH2AO75445 5202 aa7.18□□□□□ -1.26
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-202ENST00000379615 DMAC1Q96GE9 116 aa7.1□□□□□ -1.27
PGGT1B-202ENST00000379615 SERP2Q8N6R1 65 aa7.09□□□□□ -1.27
PGGT1B-202ENST00000379615 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PGGT1B-202ENST00000379615 H0YAA0 97 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-202ENST00000379615 ACYP2P14621 99 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-202ENST00000379615 SNURFQ9Y675 71 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-202ENST00000379615 C20orf197Q8N268 126 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-202ENST00000379615 CRIPTQ9P021 101 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-202ENST00000379615 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-202ENST00000379615 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-202ENST00000379615 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-202ENST00000379615 COX7CP15954 63 aa6.92□□□□□ -1.3
PGGT1B-202ENST00000379615 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-202ENST00000379615 Q5VV11 94 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-202ENST00000379615 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.83□□□□□ -1.32
PGGT1B-202ENST00000379615 MT1BP07438 61 aa6.79□□□□□ -1.32
PGGT1B-202ENST00000379615 P0C880 135 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-202ENST00000379615 R4GN34 69 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-202ENST00000379615 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-202ENST00000379615 H7BZZ5 65 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-202ENST00000379615 SVIPQ8NHG7 77 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-202ENST00000379615 M0QZ58 72 aa6.72□□□□□ -1.33
PGGT1B-202ENST00000379615 COA5Q86WW8 74 aa6.72□□□□□ -1.33
PGGT1B-202ENST00000379615 A6NN06 94 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.7□□□□□ -1.34
PGGT1B-202ENST00000379615 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.68□□□□□ -1.34
PGGT1B-202ENST00000379615 PLAC4Q8WY50 150 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC179H3BU77 68 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP10-5P60370 271 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC01554Q52M75 96 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-202ENST00000379615 SEC61GP60059 68 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-202ENST00000379615 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-202ENST00000379615 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.56□□□□□ -1.36
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-202ENST00000379615 LCE3BQ5TA77 95 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM258P61165 79 aa6.45□□□□□ -1.38
PGGT1B-202ENST00000379615 MT1XP80297 61 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1B0GU33 70 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1B0GU69 56 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.4□□□□□ -1.38
PGGT1B-202ENST00000379615 NEBP20929 6669 aa6.4□□□□□ -1.39
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.39□□□□□ -1.39
PGGT1B-202ENST00000379615 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.34□□□□□ -1.39
PGGT1B-202ENST00000379615 PRR15LQ9BU68 103 aa6.34□□□□□ -1.39
PGGT1B-202ENST00000379615 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-202ENST00000379615 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0D9SG42 100 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP5-9P26371 169 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP12-2P59991 146 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-202ENST00000379615 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-202ENST00000379615 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP12-1P59990 96 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.15□□□□□ -1.42
PGGT1B-202ENST00000379615 KMT2DO14686 5537 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP10-12P60413 245 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-202ENST00000379615 A8MU10 97 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-202ENST00000379615 LCE1DQ5T752 114 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-202ENST00000379615 V9GYY9 64 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-202ENST00000379615 UQCR11O14957 56 aa6.1□□□□□ -1.43
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.1□□□□□ -1.43
PGGT1B-202ENST00000379615 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.1□□□□□ -1.43
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.1□□□□□ -1.43
PGGT1B-202ENST00000379615 SPRR2EP22531 72 aa6.09□□□□□ -1.43
PGGT1B-202ENST00000379615 SPRR2BP35325 72 aa6.09□□□□□ -1.43
PGGT1B-202ENST00000379615 SPRR2AP35326 72 aa6.09□□□□□ -1.43
PGGT1B-202ENST00000379615 MDN1Q9NU22 5596 aa6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-202ENST00000379615 PCP4P48539 62 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-202ENST00000379615 Q1T7F1 81 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-202ENST00000379615 PSPHP1O15172 72 aa5.96□□□□□ -1.46
PGGT1B-202ENST00000379615 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.96□□□□□ -1.46
PGGT1B-202ENST00000379615 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PGGT1B-202ENST00000379615 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.94□□□□□ -1.46
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