RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452576.6

VWDE-203, Transcript of von Willebrand factor D and EGF domains, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWDE, Length 5,936 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDE-203ENST00000452576 TENM4Q6N022 2769 aa6.4□□□□□ -1.38
VWDE-203ENST00000452576 REV3LO60673 3130 aa6.35□□□□□ -1.39
VWDE-203ENST00000452576 TRANK1O15050 2925 aa6.35□□□□□ -1.39
VWDE-203ENST00000452576 FLNCQ14315 2725 aa6.35□□□□□ -1.39
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.34□□□□□ -1.39
VWDE-203ENST00000452576 KALRNO60229 2985 aa6.34□□□□□ -1.4
VWDE-203ENST00000452576 CDH23Q9H251 3354 aa6.33□□□□□ -1.4
VWDE-203ENST00000452576 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
VWDE-203ENST00000452576 TPRXLQ17RH7 258 aa6.28□□□□□ -1.4
VWDE-203ENST00000452576 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.26□□□□□ -1.41
VWDE-203ENST00000452576 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.26□□□□□ -1.41
VWDE-203ENST00000452576 HIVEP1P15822 2718 aa6.25□□□□□ -1.41
VWDE-203ENST00000452576 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.25□□□□□ -1.41
VWDE-203ENST00000452576 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
VWDE-203ENST00000452576 ITPR1Q14643 2758 aa6.22□□□□□ -1.41
VWDE-203ENST00000452576 VCANP13611 3396 aa6.21□□□□□ -1.41
VWDE-203ENST00000452576 TACC2O95359 2948 aa6.2□□□□□ -1.42
VWDE-203ENST00000452576 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.17□□□□□ -1.42
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP12-2P59991 146 aa6.17□□□□□ -1.42
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.16□□□□□ -1.42
VWDE-203ENST00000452576 LAMA1P25391 3075 aa6.16□□□□□ -1.42
VWDE-203ENST00000452576 SPEGQ15772 3267 aa6.16□□□□□ -1.42
VWDE-203ENST00000452576 SZT2Q5T011 3432 aa6.15□□□□□ -1.43
VWDE-203ENST00000452576 APCP25054 2843 aa6.14□□□□□ -1.43
VWDE-203ENST00000452576 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
VWDE-203ENST00000452576 ATMQ13315 3056 aa6.13□□□□□ -1.43
VWDE-203ENST00000452576 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.12□□□□□ -1.43
VWDE-203ENST00000452576 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.1□□□□□ -1.43
VWDE-203ENST00000452576 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.1□□□□□ -1.43
VWDE-203ENST00000452576 LRBAP50851 2863 aa6.1□□□□□ -1.43
VWDE-203ENST00000452576 COL6A3P12111 3177 aa6.09□□□□□ -1.43
VWDE-203ENST00000452576 COL12A1Q99715 3063 aa6.08□□□□□ -1.44
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.07□□□□□ -1.44
VWDE-203ENST00000452576 FRYLO94915 3013 aa6.05□□□□□ -1.44
VWDE-203ENST00000452576 TENM3Q9P273 2699 aa6.03□□□□□ -1.44
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6□□□□□ -1.45
VWDE-203ENST00000452576 CELSR2Q9HCU4 2923 aa5.99□□□□□ -1.45
VWDE-203ENST00000452576 ZZEF1O43149 2961 aa5.98□□□□□ -1.45
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP12-1P59990 96 aa5.97□□□□□ -1.45
VWDE-203ENST00000452576 MYO15AQ9UKN7 3530 aa5.96□□□□□ -1.46
VWDE-203ENST00000452576 TENM1Q9UKZ4 2725 aa5.95□□□□□ -1.46
VWDE-203ENST00000452576 EYSQ5T1H1 3165 aa5.94□□□□□ -1.46
VWDE-203ENST00000452576 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP5.93□□□□□ -1.464e-7■□□□□ 8.4
VWDE-203ENST00000452576 TENM2Q9NT68 2774 aa5.91□□□□□ -1.46
VWDE-203ENST00000452576 DCHS2Q6V1P9 2916 aa5.88□□□□□ -1.47
VWDE-203ENST00000452576 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
VWDE-203ENST00000452576 ZANQ9Y493 2812 aa5.81□□□□□ -1.48
VWDE-203ENST00000452576 USP34Q70CQ2 3546 aa5.79□□□□□ -1.48
VWDE-203ENST00000452576 NF1P21359 2839 aa5.78□□□□□ -1.48
VWDE-203ENST00000452576 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
VWDE-203ENST00000452576 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.77□□□□□ -1.49
VWDE-203ENST00000452576 DMXL1Q9Y485 3027 aa5.76□□□□□ -1.49
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.75□□□□□ -1.49
VWDE-203ENST00000452576 INE1O15225 51 aa5.74□□□□□ -1.49
VWDE-203ENST00000452576 FBN2P35556 2912 aa5.74□□□□□ -1.49
VWDE-203ENST00000452576 TGP01266 2768 aa5.74□□□□□ -1.49
VWDE-203ENST00000452576 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.73□□□□□ -1.49
VWDE-203ENST00000452576 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa5.72□□□□□ -1.49
VWDE-203ENST00000452576 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5.7□□□□□ -1.5
VWDE-203ENST00000452576 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
VWDE-203ENST00000452576 DCHS1Q96JQ0 3298 aa5.63□□□□□ -1.51
VWDE-203ENST00000452576 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.61□□□□□ -1.51
VWDE-203ENST00000452576 PDZD2O15018 2839 aa5.59□□□□□ -1.51
VWDE-203ENST00000452576 ASPMQ8IZT6 3477 aa5.58□□□□□ -1.52
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP10-12P60413 245 aa5.57□□□□□ -1.52
VWDE-203ENST00000452576 VWFP04275 2813 aa5.56□□□□□ -1.52
VWDE-203ENST00000452576 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.53□□□□□ -1.52
VWDE-203ENST00000452576 FBN3Q75N90 2809 aa5.49□□□□□ -1.53
VWDE-203ENST00000452576 MUC3AQ02505 3323 aa5.49□□□□□ -1.53
VWDE-203ENST00000452576 RELNP78509 3460 aa5.48□□□□□ -1.53
VWDE-203ENST00000452576 MXRA5Q9NR99 2828 aa5.46□□□□□ -1.54
VWDE-203ENST00000452576 LAMA5O15230 3695 aa5.45□□□□□ -1.54
VWDE-203ENST00000452576 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
VWDE-203ENST00000452576 DMDP11532 3685 aa5.44□□□□□ -1.54
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP12-3P60328 96 aa5.41□□□□□ -1.54
VWDE-203ENST00000452576 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.38□□□□□ -1.55
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.37□□□□□ -1.55
VWDE-203ENST00000452576 LCE3AQ5TA76 89 aa5.35□□□□□ -1.55
VWDE-203ENST00000452576 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.34□□□□□ -1.56
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP10-5P60370 271 aa5.33□□□□□ -1.56
VWDE-203ENST00000452576 CUBNO60494 3623 aa5.28□□□□□ -1.56
VWDE-203ENST00000452576 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.27□□□□□ -1.57
VWDE-203ENST00000452576 MT1HL1P0DM35 61 aa5.26□□□□□ -1.57
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.23□□□□□ -1.57
VWDE-203ENST00000452576 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.21□□□□□ -1.58
VWDE-203ENST00000452576 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.17□□□□□ -1.58
VWDE-203ENST00000452576 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
VWDE-203ENST00000452576 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.13□□□□□ -1.59
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.12□□□□□ -1.59
VWDE-203ENST00000452576 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
VWDE-203ENST00000452576 COL7A1Q02388 2944 aa5.05□□□□□ -1.6
VWDE-203ENST00000452576 ZFHX3Q15911 3703 aa5.05□□□□□ -1.6
VWDE-203ENST00000452576 CSMD2Q7Z408 3487 aa5□□□□□ -1.61
VWDE-203ENST00000452576 OTOGQ6ZRI0 2925 aa4.99□□□□□ -1.61
VWDE-203ENST00000452576 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
VWDE-203ENST00000452576 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa4.89□□□□□ -1.63
VWDE-203ENST00000452576 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
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