RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261799.8

PDGFRB-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRB, Length 5,717 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-201ENST00000261799 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PDGFRB-201ENST00000261799 FRYQ5TBA9 3013 aa6.78□□□□□ -1.32
PDGFRB-201ENST00000261799 FLNCQ14315 2725 aa6.77□□□□□ -1.33
PDGFRB-201ENST00000261799 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.76□□□□□ -1.33
PDGFRB-201ENST00000261799 LAMA1P25391 3075 aa6.74□□□□□ -1.33
PDGFRB-201ENST00000261799 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.73□□□□□ -1.33
PDGFRB-201ENST00000261799 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDGFRB-201ENST00000261799 APCP25054 2843 aa6.71□□□□□ -1.33
PDGFRB-201ENST00000261799 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.71□□□□□ -1.33
PDGFRB-201ENST00000261799 P0C880 135 aa6.71□□□□□ -1.33
PDGFRB-201ENST00000261799 SZT2Q5T011 3432 aa6.7□□□□□ -1.34
PDGFRB-201ENST00000261799 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.7□□□□□ -1.34
PDGFRB-201ENST00000261799 EYSQ5T1H1 3165 aa6.68□□□□□ -1.34
PDGFRB-201ENST00000261799 H0YAA0 97 aa6.68□□□□□ -1.34
PDGFRB-201ENST00000261799 REV3LO60673 3130 aa6.66□□□□□ -1.34
PDGFRB-201ENST00000261799 VCANP13611 3396 aa6.66□□□□□ -1.34
PDGFRB-201ENST00000261799 NDUFAF8A1L188 74 aa6.64□□□□□ -1.35
PDGFRB-201ENST00000261799 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.64□□□□□ -1.35
PDGFRB-201ENST00000261799 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.63□□□□□ -1.35
PDGFRB-201ENST00000261799 LRBAP50851 2863 aa6.62□□□□□ -1.35
PDGFRB-201ENST00000261799 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.61□□□□□ -1.35
PDGFRB-201ENST00000261799 FRYLO94915 3013 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRB-201ENST00000261799 SPEGQ15772 3267 aa6.57□□□□□ -1.36
PDGFRB-201ENST00000261799 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.57□□□□□ -1.36
PDGFRB-201ENST00000261799 TACC2O95359 2948 aa6.56□□□□□ -1.36
PDGFRB-201ENST00000261799 ATMQ13315 3056 aa6.55□□□□□ -1.36
PDGFRB-201ENST00000261799 TENM2Q9NT68 2774 aa6.53□□□□□ -1.36
PDGFRB-201ENST00000261799 COL12A1Q99715 3063 aa6.52□□□□□ -1.37
PDGFRB-201ENST00000261799 KALRNO60229 2985 aa6.49□□□□□ -1.37
PDGFRB-201ENST00000261799 TENM3Q9P273 2699 aa6.48□□□□□ -1.37
PDGFRB-201ENST00000261799 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.46□□□□□ -1.37
PDGFRB-201ENST00000261799 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.45□□□□□ -1.38
PDGFRB-201ENST00000261799 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDGFRB-201ENST00000261799 MT1HL1P0DM35 61 aa6.43□□□□□ -1.38
PDGFRB-201ENST00000261799 KRTAP12-2P59991 146 aa6.43□□□□□ -1.38
PDGFRB-201ENST00000261799 COL6A3P12111 3177 aa6.42□□□□□ -1.38
PDGFRB-201ENST00000261799 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.41□□□□□ -1.38
PDGFRB-201ENST00000261799 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.38□□□□□ -1.39
PDGFRB-201ENST00000261799 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PDGFRB-201ENST00000261799 USP34Q70CQ2 3546 aa6.37□□□□□ -1.39
PDGFRB-201ENST00000261799 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.37□□□□□ -1.39
PDGFRB-201ENST00000261799 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.36□□□□□ -1.39
PDGFRB-201ENST00000261799 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.35□□□□□ -1.39
PDGFRB-201ENST00000261799 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.34□□□□□ -1.4
PDGFRB-201ENST00000261799 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.32□□□□□ -1.4
PDGFRB-201ENST00000261799 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.3□□□□□ -1.4
PDGFRB-201ENST00000261799 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.29□□□□□ -1.4
PDGFRB-201ENST00000261799 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.29□□□□□ -1.4
PDGFRB-201ENST00000261799 KRTAP12-1P59990 96 aa6.29□□□□□ -1.4
PDGFRB-201ENST00000261799 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.4
PDGFRB-201ENST00000261799 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PDGFRB-201ENST00000261799 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.27□□□□□ -1.41
PDGFRB-201ENST00000261799 MUC3AQ02505 3323 aa6.26□□□□□ -1.41
PDGFRB-201ENST00000261799 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.24□□□□□ -1.41
PDGFRB-201ENST00000261799 NF1P21359 2839 aa6.23□□□□□ -1.41
PDGFRB-201ENST00000261799 ZZEF1O43149 2961 aa6.23□□□□□ -1.41
PDGFRB-201ENST00000261799 PDZD2O15018 2839 aa6.21□□□□□ -1.42
PDGFRB-201ENST00000261799 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.19□□□□□ -1.42
PDGFRB-201ENST00000261799 KRTAP10-12P60413 245 aa6.15□□□□□ -1.42
PDGFRB-201ENST00000261799 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PDGFRB-201ENST00000261799 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.12□□□□□ -1.43
PDGFRB-201ENST00000261799 FBN2P35556 2912 aa6.12□□□□□ -1.43
PDGFRB-201ENST00000261799 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PDGFRB-201ENST00000261799 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.12□□□□□ -1.43
PDGFRB-201ENST00000261799 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.11□□□□□ -1.43
PDGFRB-201ENST00000261799 ZANQ9Y493 2812 aa6.11□□□□□ -1.43
PDGFRB-201ENST00000261799 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.06□□□□□ -1.44
PDGFRB-201ENST00000261799 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.06□□□□□ -1.44
PDGFRB-201ENST00000261799 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.02□□□□□ -1.45
PDGFRB-201ENST00000261799 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PDGFRB-201ENST00000261799 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa5.99□□□□□ -1.45
PDGFRB-201ENST00000261799 TGP01266 2768 aa5.98□□□□□ -1.45
PDGFRB-201ENST00000261799 DMDP11532 3685 aa5.96□□□□□ -1.46
PDGFRB-201ENST00000261799 OTOGQ6ZRI0 2925 aa5.95□□□□□ -1.46
PDGFRB-201ENST00000261799 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.94□□□□□ -1.46
PDGFRB-201ENST00000261799 ASPMQ8IZT6 3477 aa5.91□□□□□ -1.46
PDGFRB-201ENST00000261799 VWFP04275 2813 aa5.89□□□□□ -1.47
PDGFRB-201ENST00000261799 FBN3Q75N90 2809 aa5.89□□□□□ -1.47
PDGFRB-201ENST00000261799 LAMA5O15230 3695 aa5.88□□□□□ -1.47
PDGFRB-201ENST00000261799 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PDGFRB-201ENST00000261799 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PDGFRB-201ENST00000261799 KRTAP12-3P60328 96 aa5.85□□□□□ -1.47
PDGFRB-201ENST00000261799 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.85□□□□□ -1.47
PDGFRB-201ENST00000261799 RELNP78509 3460 aa5.84□□□□□ -1.48
PDGFRB-201ENST00000261799 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.8□□□□□ -1.48
PDGFRB-201ENST00000261799 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.79□□□□□ -1.48
PDGFRB-201ENST00000261799 LCE3AQ5TA76 89 aa5.75□□□□□ -1.49
PDGFRB-201ENST00000261799 MT1HP80294 61 aa5.74□□□□□ -1.49
PDGFRB-201ENST00000261799 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.73□□□□□ -1.49
PDGFRB-201ENST00000261799 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.72□□□□□ -1.49
PDGFRB-201ENST00000261799 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PDGFRB-201ENST00000261799 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PDGFRB-201ENST00000261799 ZFHX3Q15911 3703 aa5.64□□□□□ -1.51
PDGFRB-201ENST00000261799 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.63□□□□□ -1.51
PDGFRB-201ENST00000261799 INE1O15225 51 aa5.6□□□□□ -1.51
PDGFRB-201ENST00000261799 DNAH2Q9P225 4427 aa5.59□□□□□ -1.51
PDGFRB-201ENST00000261799 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.56□□□□□ -1.52
PDGFRB-201ENST00000261799 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.55□□□□□ -1.52
PDGFRB-201ENST00000261799 MT2AP02795 61 aa5.55□□□□□ -1.52
PDGFRB-201ENST00000261799 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.54□□□□□ -1.52
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