RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486446.2

PUDP-204, Transcript of pseudouridine 5'-phosphatase, human

TSL 2

Gene PUDP, Length 586 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUDP-204	ENST00000486446	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUDP-204	ENST00000486446	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUDP-204	ENST00000486446	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUDP-204	ENST00000486446	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUDP-204	ENST00000486446	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUDP-204	ENST00000486446	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUDP-204	ENST00000486446	ATXN8	Q156A1	80 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUDP-204	ENST00000486446	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUDP-204	ENST00000486446	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446		H3BT86	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	UBE2L6	O14933	153 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	SLC25A20	O43772	301 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	CCL18	P55774	89 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	GAGE4	Q13068	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	COX6A2	Q02221	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446		H3BNG1	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	LST1	O00453	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	RTL8C	O15255	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	COX6C	P09669	75 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446		Q6ZR54	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446		C9JAW5	83 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	PRSS2	P07478	247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446		Q9H8V8	135 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446		A0A087WZ39	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	ESRG	Q1W209	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446		A0A096LPF7	62 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446		A0A1B0GVY2	172 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	COX7A2L	O14548	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446		Q1RN00	199 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	TRAC	P01848	142 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	XG	P55808	180 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	CD164	Q04900	197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	SS18	Q15532	418 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446		Q6Q795	121 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUDP-204	ENST00000486446	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446		H7C2G1	150 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	LELP1	Q5T871	98 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446		A0A1B0GX51	115 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	MT-ATP8	P03928	68 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	ACYP1	P07311	99 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	COX17	Q14061	63 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446		Q8IZM0	81 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	CXCL5	P42830	114 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	DAND5	Q8N907	189 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUDP-204	ENST00000486446	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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