RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 GaptQ8CB93 157 aa18.29■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cdpf1Q8R3A2 119 aa18.29■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr495Q8VF12 330 aa18.29■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr1030Q8VFL5 318 aa18.29■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ctxnd2A0A1B0GQX3 59 aa18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Khdc1bP0C7A0 126 aa18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Msrb3Q8BU85 253 aa18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 P03980 138 aa18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Stfa1P35175 97 aa18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Aqp11Q8BHH1 271 aa18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr958Q8VEY3 312 aa18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr959Q9EQ86 311 aa18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 LrbaQ9ESE1 2856 aa18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Qrich2A0A140LIY9 2337 aa18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zfp109A0A0U1RPC5 652 aa18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10020E9QAZ2 204 aa18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm21900J3QP38 180 aa18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 P0C1Z5 52 aa18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rnase9P60154 184 aa18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmem88bQ3TYP4 173 aa18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Oosp2Q4FZG8 168 aa18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr148Q60887 310 aa18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 OstcQ78XF5 149 aa18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slamf7Q8BHK6 333 aa18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Klre1Q8CJC7 226 aa18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rpl15Q9CZM2 204 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rnase4Q9JJH1 148 aa18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pla2g2dQ9WVF6 144 aa18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prrc2cQ3TLH4 2846 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 P04219 140 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tpt1P63028 172 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trp53rkaQ5U452 244 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Btf3Q64152 204 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tp53rkQ99PW4 244 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Brs3O54798 399 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nanos1Q80WY3 267 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dido1Q8C9B9 2256 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ighv1-55A0A075B5W6 117 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ighv1-20A0A0A6YX66 117 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ascl2O35885 263 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Urm1Q9D2P4 101 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ighv5-16A0A0B4J1P4 117 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 AU041133A0A0J9YVH3 498 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rnf212bD3Z423 297 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr872E9PVW2 323 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm12169F2Z474 250 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmem95P0DJF3 176 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Myo18bE9PV66 2605 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 BsgP18572 389 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hes1P35428 282 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prss3Q792Z0 246 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cst10Q9JM84 148 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Opn3Q9WUK7 400 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vmn1r61W4VSP5 300 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cep192E9Q4Y4 2514 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Armcx4E9PWM3 2356 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prpf8Q99PV0 2335 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ighv1-69A0A0G2JFS5 117 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ypel3P61237 119 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 CklfQ9DAS1 152 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmem183Q9JJB9 375 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 BlnkQ9QUN3 457 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Med12A2AGH6 2190 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kcnk5Q9JK62 502 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 AcanQ61282 2132 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Adcyap1O70176 175 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 KhkP97328 298 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pilrb2Q2YFS1 225 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm12689Q8BQU9 117 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ighv1-58A0A075B5W9 117 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr1116E9PXB8 307 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccl1P10146 92 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Spink12Q9D256 87 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cldn34c4A2ANA3 212 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 P01792 123 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cela2aP05208 271 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gng10Q9CXP8 68 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Crybb3Q9JJU9 211 aa18.21■□□□□ 0.51
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Timp3P39876 211 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ren1P06281 402 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lgals1P16045 135 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 EppinQ9DA01 134 aa18.2■□□□□ 0.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trbv31A0A075B5J5 111 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr1326-ps1A0A140T8J7 311 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Amn1B8JKV0 258 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rpl19P84099 196 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmprss5Q9ER04 455 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Arpc1aQ9R0Q6 370 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fabp6P51162 128 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cnn1Q08091 297 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm9733Q1AN91 178 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sox21Q811W0 276 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Q8CF25 301 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr984Q8VFN1 314 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mgst1Q91VS7 155 aa18.19■□□□□ 0.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Med13lQ6JPI3 2207 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hist1h2bfP10853 126 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 RanP62827 216 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Q497N7 227 aa18.18■□□□□ 0.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hist1h2bbQ64475 126 aa18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.1 ms