Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
Cnn1Q08091 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Cnn1Q08091 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Cnn1Q08091 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Cnn1Q08091 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,94■■□□□ 1,74
Cnn1Q08091 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Cnn1Q08091 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Cnn1Q08091 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Cnn1Q08091 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,36■■□□□ 1,65
Cnn1Q08091 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
Cnn1Q08091 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Cnn1Q08091 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Cnn1Q08091 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25■■□□□ 1,59
Cnn1Q08091 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Cnn1Q08091 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Cnn1Q08091 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Cnn1Q08091 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,61■■□□□ 1,53
Cnn1Q08091 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,47■■□□□ 1,51
Cnn1Q08091 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Cnn1Q08091 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Cnn1Q08091 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Cnn1Q08091 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Cnn1Q08091 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Cnn1Q08091 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Cnn1Q08091 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Cnn1Q08091 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Cnn1Q08091 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Cnn1Q08091 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Cnn1Q08091 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,89■■□□□ 1,41
Cnn1Q08091 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,86■■□□□ 1,41
Cnn1Q08091 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Cnn1Q08091 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,82■■□□□ 1,4
Cnn1Q08091 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Cnn1Q08091 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Cnn1Q08091 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Cnn1Q08091 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Cnn1Q08091 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Cnn1Q08091 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Cnn1Q08091 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Cnn1Q08091 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,45■■□□□ 1,34
Cnn1Q08091 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Cnn1Q08091 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Cnn1Q08091 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Cnn1Q08091 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,29■■□□□ 1,32
Cnn1Q08091 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Cnn1Q08091 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Cnn1Q08091 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Cnn1Q08091 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,14■■□□□ 1,3
Cnn1Q08091 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Cnn1Q08091 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Cnn1Q08091 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Cnn1Q08091 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,1■■□□□ 1,29
Cnn1Q08091 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Cnn1Q08091 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Cnn1Q08091 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Cnn1Q08091 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,94■■□□□ 1,26
Cnn1Q08091 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Cnn1Q08091 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Cnn1Q08091 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Cnn1Q08091 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Cnn1Q08091 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Cnn1Q08091 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Cnn1Q08091 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Cnn1Q08091 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,74■■□□□ 1,23
Cnn1Q08091 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,73■■□□□ 1,23
Cnn1Q08091 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,72■■□□□ 1,23
Cnn1Q08091 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,7■■□□□ 1,22
Cnn1Q08091 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Cnn1Q08091 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,69■■□□□ 1,22
Cnn1Q08091 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Cnn1Q08091 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,61■■□□□ 1,21
Cnn1Q08091 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Cnn1Q08091 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Cnn1Q08091 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,59■■□□□ 1,21
Cnn1Q08091 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Cnn1Q08091 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Cnn1Q08091 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Cnn1Q08091 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,51■■□□□ 1,19
Cnn1Q08091 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Cnn1Q08091 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,46■■□□□ 1,19
Cnn1Q08091 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22,46■■□□□ 1,19
Cnn1Q08091 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22,45■■□□□ 1,18
Cnn1Q08091 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Cnn1Q08091 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Cnn1Q08091 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Cnn1Q08091 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Cnn1Q08091 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,38■■□□□ 1,17
Cnn1Q08091 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
Cnn1Q08091 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,29■■□□□ 1,16
Cnn1Q08091 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,29■■□□□ 1,16
Cnn1Q08091 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Cnn1Q08091 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Cnn1Q08091 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22,21■■□□□ 1,15
Cnn1Q08091 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Cnn1Q08091 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Cnn1Q08091 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Cnn1Q08091 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22,17■■□□□ 1,14
Cnn1Q08091 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22,12■■□□□ 1,13
Cnn1Q08091 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22,06■■□□□ 1,12
Cnn1Q08091 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
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