Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Cnn1Q08091 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnn1Q08091 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnn1Q08091 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cnn1Q08091 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnn1Q08091 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnn1Q08091 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnn1Q08091 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnn1Q08091 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnn1Q08091 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnn1Q08091 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnn1Q08091 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnn1Q08091 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cnn1Q08091 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnn1Q08091 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnn1Q08091 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnn1Q08091 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnn1Q08091 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnn1Q08091 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnn1Q08091 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnn1Q08091 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnn1Q08091 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnn1Q08091 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnn1Q08091 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnn1Q08091 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnn1Q08091 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnn1Q08091 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnn1Q08091 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnn1Q08091 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnn1Q08091 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnn1Q08091 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnn1Q08091 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnn1Q08091 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnn1Q08091 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnn1Q08091 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnn1Q08091 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnn1Q08091 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnn1Q08091 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnn1Q08091 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnn1Q08091 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnn1Q08091 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnn1Q08091 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnn1Q08091 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnn1Q08091 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnn1Q08091 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnn1Q08091 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnn1Q08091 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnn1Q08091 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cnn1Q08091 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnn1Q08091 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnn1Q08091 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnn1Q08091 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnn1Q08091 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnn1Q08091 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnn1Q08091 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnn1Q08091 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnn1Q08091 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnn1Q08091 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnn1Q08091 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnn1Q08091 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnn1Q08091 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnn1Q08091 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnn1Q08091 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnn1Q08091 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnn1Q08091 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnn1Q08091 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnn1Q08091 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnn1Q08091 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnn1Q08091 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnn1Q08091 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnn1Q08091 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnn1Q08091 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnn1Q08091 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnn1Q08091 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnn1Q08091 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnn1Q08091 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnn1Q08091 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnn1Q08091 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnn1Q08091 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnn1Q08091 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnn1Q08091 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnn1Q08091 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnn1Q08091 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnn1Q08091 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnn1Q08091 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnn1Q08091 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnn1Q08091 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnn1Q08091 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnn1Q08091 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnn1Q08091 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnn1Q08091 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnn1Q08091 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnn1Q08091 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnn1Q08091 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnn1Q08091 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnn1Q08091 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnn1Q08091 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnn1Q08091 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnn1Q08091 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnn1Q08091 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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