Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,81■■■□□ 2,52
Brs3O54798 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Brs3O54798 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Brs3O54798 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,1■■□□□ 1,93
Brs3O54798 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Brs3O54798 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,59■■□□□ 1,85
Brs3O54798 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Brs3O54798 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,42■■□□□ 1,82
Brs3O54798 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Brs3O54798 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Brs3O54798 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Brs3O54798 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Brs3O54798 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,83■■□□□ 1,73
Brs3O54798 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Brs3O54798 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Brs3O54798 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Brs3O54798 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
Brs3O54798 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Brs3O54798 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Brs3O54798 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Brs3O54798 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Brs3O54798 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,87■■□□□ 1,57
Brs3O54798 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Brs3O54798 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Brs3O54798 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Brs3O54798 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,77■■□□□ 1,56
Brs3O54798 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Brs3O54798 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,68■■□□□ 1,54
Brs3O54798 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Brs3O54798 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Brs3O54798 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Brs3O54798 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Brs3O54798 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Brs3O54798 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24,36■■□□□ 1,49
Brs3O54798 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Brs3O54798 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Brs3O54798 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,32■■□□□ 1,48
Brs3O54798 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Brs3O54798 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24,23■■□□□ 1,47
Brs3O54798 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Brs3O54798 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Brs3O54798 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Brs3O54798 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Brs3O54798 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Brs3O54798 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Brs3O54798 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,88■■□□□ 1,41
Brs3O54798 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,82■■□□□ 1,4
Brs3O54798 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Brs3O54798 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,75■■□□□ 1,39
Brs3O54798 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Brs3O54798 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Brs3O54798 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Brs3O54798 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Brs3O54798 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Brs3O54798 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,57■■□□□ 1,36
Brs3O54798 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,57■■□□□ 1,36
Brs3O54798 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Brs3O54798 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,51■■□□□ 1,35
Brs3O54798 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Brs3O54798 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Brs3O54798 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Brs3O54798 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Brs3O54798 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,33■■□□□ 1,32
Brs3O54798 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,32■■□□□ 1,32
Brs3O54798 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Brs3O54798 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Brs3O54798 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23,28■■□□□ 1,32
Brs3O54798 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,28■■□□□ 1,32
Brs3O54798 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Brs3O54798 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Brs3O54798 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Brs3O54798 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Brs3O54798 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23,2■■□□□ 1,3
Brs3O54798 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Brs3O54798 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Brs3O54798 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Brs3O54798 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Brs3O54798 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Brs3O54798 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
Brs3O54798 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Brs3O54798 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,02■■□□□ 1,28
Brs3O54798 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Brs3O54798 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22,92■■□□□ 1,26
Brs3O54798 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Brs3O54798 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,89■■□□□ 1,26
Brs3O54798 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22,89■■□□□ 1,25
Brs3O54798 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,87■■□□□ 1,25
Brs3O54798 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Brs3O54798 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Brs3O54798 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22,78■■□□□ 1,24
Brs3O54798 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22,78■■□□□ 1,24
Brs3O54798 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22,78■■□□□ 1,24
Brs3O54798 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Brs3O54798 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22,73■■□□□ 1,23
Brs3O54798 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Brs3O54798 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Brs3O54798 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Brs3O54798 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Brs3O54798 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,66■■□□□ 1,22
Brs3O54798 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22,64■■□□□ 1,21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms