RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF56	Q15929	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	NRAC	Q8N912	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	LRBA	P50851	2863 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971		I3L2K1	104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	CD28	P10747	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971		Q1T7F1	81 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971		Q6ZSV7	163 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	LRRK2	Q5S007	2527 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	CR1	P17927	2039 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	AKAP6	Q13023	2319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971		H3BMM0	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	CD24	P25063	80 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	NDP	Q00604	133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	SS18	Q15532	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63	8e-8	■■■■■ 29.6
FBXO38-208	ENST00000504971	CHD6	Q8TD26	2715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971		H3BUA1	57 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971		H3BUX3	64 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971		K7EIM0	57 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	DEFA4	P12838	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	RHOH	Q15669	191 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971		Q6YL49	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	COL12A1	Q99715	3063 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	PEX7	O00628	323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC25A20	O43772	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	UBE2D3	P61077	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	UBE2D2	P62837	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	FBN2	P35556	2912 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	SPG11	Q96JI7	2443 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM223B	A6NKX1	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	IGKV1-17	P01599	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	KLKP1	Q107X0	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	MED13L	Q71F56	2210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	PTPN13	Q12923	2485 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	APELA	P0DMC3	54 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	ESRG	Q1W209	222 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A0B4J2C4	111 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971		K7EQD1	137 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	CTSG	P08311	255 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	LY6E	Q16553	131 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FBXO38-208	ENST00000504971	DAND5	Q8N907	189 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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