RNA–Protein interactions for RNA: YOL003C

PFA4, Transcript of Palmitoyltransferase with autoacylation activity, yeastyeast

Gene PFA4, Length 1,137 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFA4YOL003C CBP3P21560 335 aa5.54□□□□□ -1.52
PFA4YOL003C SAT4P25333 603 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PFA4YOL003C UGP1P32861 499 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PFA4YOL003C PPZ2P33329 710 aa5.54□□□□□ -1.52
PFA4YOL003C LOT5P34234 306 aa5.54□□□□□ -1.52
PFA4YOL003C YPT10P38146 199 aa5.54□□□□□ -1.52
PFA4YOL003C RIX1P38883 763 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PFA4YOL003C SWD1P39706 426 aa5.54□□□□□ -1.52
PFA4YOL003C ARG7Q04728 441 aa5.54□□□□□ -1.52
PFA4YOL003C TGS1Q12052 315 aa5.54□□□□□ -1.52
PFA4YOL003C CPA2P03965 1118 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PFA4YOL003C GAL1P04385 528 aa5.53□□□□□ -1.52
PFA4YOL003C VPS34P22543 875 aa5.53□□□□□ -1.52
PFA4YOL003C YKL133CP36066 463 aa5.53□□□□□ -1.52
PFA4YOL003C FLO10P36170 1169 aa5.53□□□□□ -1.52
PFA4YOL003C SAP4P53036 818 aa5.53□□□□□ -1.52
PFA4YOL003C COS12P53053 380 aa5.53□□□□□ -1.52
PFA4YOL003C COQ6P53318 479 aa5.53□□□□□ -1.52
PFA4YOL003C MLC2Q06580 163 aa5.53□□□□□ -1.52
PFA4YOL003C YOL057WQ08225 711 aa5.53□□□□□ -1.52
PFA4YOL003C BPT1P14772 1559 aa5.52□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C RKR1Q04781 1562 aa5.52□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C WHI2P12611 486 aa5.52□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C YMC1P32331 307 aa5.52□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C NOP2P40991 618 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C PIP2P52960 996 aa5.52□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C HOF1Q05080 669 aa5.52□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C YOL114CQ12322 202 aa5.52□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C SCC2Q04002 1493 aa5.51□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C PMA2P19657 947 aa5.51□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C RPA135P22138 1203 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C PTP2P29461 750 aa5.51□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C RIM4P38741 713 aa5.51□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C ENT2Q05785 613 aa5.51□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C BRE1Q07457 700 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C ULA1Q12059 462 aa5.51□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C BET2P20133 325 aa5.5□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C CDC5P32562 705 aa5.5□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C SDH8P38345 138 aa5.5□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C STB5P38699 743 aa5.5□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C POL31P46957 487 aa5.5□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C TRS31Q03337 283 aa5.5□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C CRD1Q07560 283 aa5.5□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C AAD4Q07747 329 aa5.5□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C AAC1P04710 309 aa5.49□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C RPL7AP05737 244 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C MSS18P08593 268 aa5.49□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C ATF1P40353 525 aa5.49□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C QRI7P43122 407 aa5.49□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C MAD3P47074 515 aa5.49□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C ACS1Q01574 713 aa5.49□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data5.49□□□□□ -1.53not detected
PFA4YOL003C RRP6Q12149 733 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C NDJ1Q12366 352 aa5.49□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C RPO31P04051 1460 aa5.48□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C UFD4P33202 1483 aa5.48□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C YOR1P53049 1477 aa5.48□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C RNR3P21672 869 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C CUE2P36075 443 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C VFA1P40080 203 aa5.48□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C HIS6P40545 261 aa5.48□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C TEP1P53916 434 aa5.48□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C GFD1Q04839 188 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C EIS1Q05050 843 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C AAD3P25612 363 aa5.47□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C FRD1P32614 470 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C IMO32P53219 342 aa5.47□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C YNL092WP53934 400 aa5.47□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C NYV1Q12255 253 aa5.47□□□□□ -1.53
PFA4YOL003C PRE2P30656 287 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C STT3P39007 718 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C IDS2P46958 469 aa5.46□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C YJR008WP47085 338 aa5.46□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C TAN1P53072 289 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C SLK19Q08581 821 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C TOP2P06786 1428 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C YMR084WA2P2R3 262 aa5.45□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C YPK1P12688 680 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C SIR1P21691 654 aa5.45□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C YCR061WP25639 631 aa5.45□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C YFL015CP43578 164 aa5.45□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C CRT10Q08226 957 aa5.45□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C OSW1Q08692 278 aa5.45□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C PCL8Q08966 492 aa5.45□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C MYO4P32492 1471 aa5.45□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa5.44□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C TY2B-FP0CX63 1770 aa5.44□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C TY2B-GR2P0CX64 1770 aa5.44□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C TY2B-CP25384 1770 aa5.44□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C TY2B-DR2Q03494 1770 aa5.44□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C TY1B-DR1Q03855 1755 aa5.44□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C TY2B-OR1Q12113 1770 aa5.44□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C TY2B-DR1Q12472 1770 aa5.44□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C TY2B-OR2Q12501 1770 aa5.44□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C YCF1P39109 1515 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C PIF1P07271 859 aa5.44□□□□□ -1.54
PFA4YOL003C YEF3P16521 1044 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.8 ms