RNA–Protein interactions for RNA: YNR061C

YNR061C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YNR061C, Length 660 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNR061C	YNR061C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	PPN1	Q04119	674 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	MCM21	Q06675	368 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	SGO1	Q08490	590 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	SWM1	Q12379	170 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	YLR415C	O13578	112 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	HIS5	P07172	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	NUC1	P08466	329 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	YCL049C	P25577	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	STE14	P32584	239 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	SLC1	P33333	303 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	YBR259W	P38338	688 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	YHR033W	P38690	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	NDE1	P40215	560 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	HOS4	P40480	1083 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	IMA5	P40884	581 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	MAD2	P40958	196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	PXA1	P41909	870 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	TAF4	P50105	388 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	MNT2	P53059	558 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	TRI1	Q05024	226 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	MED1	Q12321	566 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YNR061C	YNR061C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	MTF2	P10849	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	IME1	P21190	360 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	SIC1	P38634	284 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	ECM1	P39715	212 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	PUG1	P40100	303 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	MDG1	P53885	366 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	HOS1	Q12214	470 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	CWH43	P25618	953 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	MRPL36	P36531	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	MAM1	P40065	302 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	PSF2	P40359	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	BUD8	P41698	603 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	SAP4	P53036	818 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	PEF1	P53238	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	COX18	P53239	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	YNR071C	P53757	342 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	DIN7	Q12086	430 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	ERP4	Q12450	207 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	POL3	P15436	1097 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	SIR1	P21691	654 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	CLB4	P24871	460 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	DAL5	P15365	543 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	NPR3	P38742	1146 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	UME6	P39001	836 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	ESL1	P40456	1118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	NCS6	P53088	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	MDR1	P53258	950 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	SPC19	Q03954	165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	VID22	Q05934	901 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	VPS36	Q06696	566 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	CRD1	Q07560	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	FOB1	O13329	566 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
YNR061C	YNR061C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	KIN82	P25341	720 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	YHR112C	P38716	378 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	VPS8	P39702	1274 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	PRM2	P40534	656 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	BIT61	P47041	543 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	BNA1	P47096	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	SPO1	P53541	631 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	NRG1	Q03125	231 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	ARA2	Q04212	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	GAD1	Q04792	585 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	PEX19	Q07418	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNR061C	YNR061C	AAD4	Q07747	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 57.7 ms