RNA–Protein interactions for RNA: YMR229C

RRP5, Transcript of RNA binding protein involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs, yeast

Gene RRP5, Length 5,190 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP5	YMR229C	HDA3	Q06623	655 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CDC73	Q06697	393 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	FOB1	O13329	566 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	NUC1	P08466	329 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	APM3	P38153	483 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CKB2	P38930	258 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	DAK2	P43550	591 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	NGL3	Q03210	505 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	KRE28	Q04431	385 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ARG7	Q04728	441 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ARP9	Q05123	467 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	GAS5	Q08193	484 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YDR056C	Q12025	205 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	HMG2	P12684	1045 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RGR1	P19263	1082 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	KIP1	P28742	1111 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YKR015C	P36111	568 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YTP1	P53584	459 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RET3	P53600	189 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MRPL50	P53724	139 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RRD2	Q12461	358 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YBT1	P32386	1661 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	LAM4	P38800	1345 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	BAS1	P22035	811 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	KIN3	P22209	435 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	KAR9	P32526	644 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	HSP78	P33416	811 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	IFA38	P38286	347 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	VPS29	P38759	282 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RGI2	P40188	164 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PRM2	P40534	656 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	IRC6	P43615	237 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YJR008W	P47085	338 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MAL11	P53048	616 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YGL138C	P53122	345 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	BOP3	P53958	396 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	HAP2	P06774	265 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MEF1	P25039	761 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YCR051W	P25631	222 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	DPH2	P32461	534 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	VID24	P38263	362 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	NUP60	P39705	539 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MGS1	P40151	587 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MRPS18	P42847	217 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CGR1	P53188	120 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	THI21	Q08975	551 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	NTO1	Q12311	748 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	DUR3	P33413	735 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SIC1	P38634	284 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	HSE1	P38753	452 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	BIM1	P40013	344 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YNL108C	P53929	270 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YNL058C	P53947	316 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TPO1	Q07824	586 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	LDB18	Q07887	179 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MED2	Q12124	431 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ERP4	Q12450	207 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MPH2	P0CD99	609 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	DAL2	P25335	343 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YCL068C	P25593	260 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PEP7	P32609	515 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PXA2	P34230	853 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YJL107C	P42947	387 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	BIO4	P53630	237 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RPM2	Q02773	1202 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YDR109C	Q04585	715 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	POL4	P25615	582 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	COT1	P32798	439 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SLX1	P38324	304 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	STS1	P38637	319 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	NPP2	P39997	493 aa		3.37	□□□□□ -1.87

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